New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_008463 | = 3304506 | 450 (0.900) | 13 (0.030) | 12/266 | 35.5 | 3.1% | coding (1023/1449 nt) | PA14_RS15105 | aldehyde dehydrogenase family protein |
? | NC_008463 | 3304825 = | 417 (0.930) | coding (704/1449 nt) | PA14_RS15105 | aldehyde dehydrogenase family protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 455 total aligned reads displayed.
AGGGTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAACGCCGCG > NC_008463/3304357‑3304655 | gggTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGa > 1:2170524/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGAt < 2:2374609/150‑1 (MQ=255) gTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCCGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATg < 1:6740708/150‑1 (MQ=255) tCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATgg < 2:10892733/150‑1 (MQ=255) aGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGcc > 1:10743200/1‑150 (MQ=255) gCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCt > 1:6926119/1‑150 (MQ=255) aCCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTgg < 1:1010082/150‑1 (MQ=255) aCCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTgg > 1:10552061/1‑150 (MQ=255) gTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTa < 2:4879570/150‑1 (MQ=255) ccGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGCAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCCCCACCCGCGCGCCGGCGGCGCTGGCCTGGCGTACg < 2:44878/150‑1 (MQ=255) cGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACgg > 2:10110075/1‑150 (MQ=255) gTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgctcgc < 1:10987568/150‑1 (MQ=255) tttCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgctcgct > 1:1416517/1‑150 (MQ=255) ttCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgctcgctc < 1:6129173/150‑1 (MQ=255) ttCCTGTTGAACGATGTACATGTCCGGATCATCGACCTCAAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCTCGGACCACCACCCGAGCGCCGGCGTCGATGGCCTGGCTTACGgctcgctc < 1:2683642/150‑1 (MQ=255) ccTGTTGCACCATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcga < 1:9677536/150‑1 (MQ=255) tGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcgacgcgc > 2:4219105/1‑150 (MQ=255) gCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcgacgcgct > 2:7215238/1‑150 (MQ=255) 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tcatcGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATc > 1:8626708/1‑150 (MQ=255) acaacGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATc < 1:10305610/146‑1 (MQ=255) atcGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAg < 2:7843784/150‑1 (MQ=255) tcGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGc < 2:8354027/150‑1 (MQ=255) cGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCg < 2:5946294/150‑1 (MQ=255) 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cAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCAcgcg > 2:1497138/1‑150 (MQ=255) gCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCa < 1:1183315/150‑1 (MQ=255) cTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAg < 1:3645656/150‑1 (MQ=255) cGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGt < 2:4636887/150‑1 (MQ=255) cccTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGttt > 1:6420508/1‑150 (MQ=255) cTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCCCGCGCCGGTTTTc > 2:363490/1‑150 (MQ=255) tCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTcc < 2:7973083/150‑1 (MQ=255) cGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGGCTGTCGGACGGAGGGCTCGTAGCGCTCGACGGTGTCCTGCTCCATCAGCGGCCCCAGGTCGCTGCGCGGGTCCCCCGCGGGCCCCGAGCGCATGttgtaca > 2:1256818/1‑145 (MQ=255) gtACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGgc < 1:33149/149‑1 (MQ=255) tACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGGCTTGTCGATCAGCGGCCCCCTGTCGCTGCGCGGGGCCCCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCGAGgcg > 2:252273/1‑150 (MQ=255) aCCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCCGGTTTTCCAGgcgc > 1:4129625/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGCTGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTgcg < 1:426866/150‑1 (MQ=255) gccgcGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAg < 1:6324237/150‑1 (MQ=255) cgGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGt > 1:500934/1‑150 (MQ=255) ccaccaccCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCCTGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTcgc < 1:10373617/150‑1 (MQ=255) ccaccCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTa < 1:9785003/150‑1 (MQ=255) caccCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTAGTCGATCACCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCCGGTTTTACAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAg > 2:7726110/1‑150 (MQ=255) cgcgcCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTc < 1:4349867/150‑1 (MQ=255) gcCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGc < 2:4387338/150‑1 (MQ=255) ggcggcGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGGGCGGGTGCGCCGCCGGCCCCACGCGCACGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAAc > 1:8414167/1‑150 (MQ=255) ggcggcGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAAc < 2:3037142/150‑1 (MQ=255) gcggcgATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCCTTCGGCAAcg > 2:2004864/1‑150 (MQ=255) cggcgATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAAcgc < 1:1889663/150‑1 (MQ=255) cggcgATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAAcgc < 1:5763579/150‑1 (MQ=255) ggcgATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAAcgcc < 2:8221282/150‑1 (MQ=255) gcgATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAAcgccg < 1:8035434/150‑1 (MQ=255) gcgATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGGTCGGCAAcgccg > 2:10473117/1‑150 (MQ=255) | AGGGTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAACGCCGCG > NC_008463/3304357‑3304655 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |