Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_008463 | 3,515,863 | T→C | intergenic (+617/+267) | PA14_RS16005 → / ← PA14_RS16010 | AAA family ATPase/DUF4354 family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_008463 | 3,515,863 | 0 | T | C | 99.3% | 1063.0 / NA | 289 | intergenic (+617/+267) | PA14_RS16005/PA14_RS16010 | AAA family ATPase/DUF4354 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (134/152); minor base A (2/0); total (137/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.22e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
TATACAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCTTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAA > NC_008463/3515716‑3516009 | tataCAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTc < 2:6291490/150‑1 (MQ=255) taCAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCTCAc > 1:2216561/1‑150 (MQ=255) taCAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCaa > 2:3286346/1‑149 (MQ=255) aCAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCAcc < 1:6163728/150‑1 (MQ=255) cAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCAccc > 1:10307711/1‑150 (MQ=255) ccctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTGGGGCCGCACCCCCAc > 1:3837416/1‑150 (MQ=255) cctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTAACCCCAAcc > 2:4629312/1‑150 (MQ=255) cctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCACACCCCaaac > 2:4945133/1‑148 (MQ=255) ctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCCAccc > 1:10625381/1‑150 (MQ=255) ccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCctc < 2:5403508/150‑1 (MQ=255) tAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCCACCCTCTcc > 2:8765648/1‑150 (MQ=255) tAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCACCCCTCTcc < 2:106487/150‑1 (MQ=255) aaGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTccc < 2:5608782/150‑1 (MQ=255) aaGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTccc > 2:383397/1‑150 (MQ=255) aaGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCACTccc > 1:9803271/1‑150 (MQ=255) aGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCg < 2:1856396/150‑1 (MQ=255) aGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCg < 2:2651164/150‑1 (MQ=255) ccATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACACCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCa < 1:4748886/150‑1 (MQ=255) ccATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCGCACCCCAACCCTCTcccccc > 1:7122479/1‑147 (MQ=255) ccATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCGCACCCCCCCCCACACCCGCa > 2:7542913/1‑150 (MQ=255) tAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCGCACACCCCAAACCAATACCGCAcgc > 1:1728336/1‑150 (MQ=255) aGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCACTCCCGCAcccg > 2:6920798/1‑150 (MQ=255) cccTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACACCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCggg < 2:9051940/150‑1 (MQ=255) cccTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCggg < 1:5259285/150‑1 (MQ=255) cccTTCCCCATACCAGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCggg < 1:2454349/150‑1 (MQ=255) ccTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGga < 2:7215106/150‑1 (MQ=255) cTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCACCCCTCTCCCGCACGCGGgag < 2:1483719/150‑1 (MQ=255) cTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGgag < 1:3051/150‑1 (MQ=255) ttCCCCCTACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGgaga < 1:5844741/150‑1 (MQ=255) ttCCCCATCCCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGgaga < 2:10185149/150‑1 (MQ=255) ccccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCTCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAgg < 2:5123205/150‑1 (MQ=255) ccccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAgg < 2:1391091/150‑1 (MQ=255) ccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTACCCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCGCCCCCCCAACCACGCGCGCGCGCGGGAGCgggg > 1:6389816/1‑150 (MQ=255) cATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCCACCCTCACCCGCACGCGGGTGAggggg > 2:2580793/1‑150 (MQ=255) ccTGAACGGCACACCTCTGGCCACCCGCAAAACCACCACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCCACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCgg < 2:4290040/150‑1 (MQ=255) cTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACACCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCggg < 2:1082659/150‑1 (MQ=255) aCGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTg < 1:4472879/150‑1 (MQ=255) cGGCACACCTAGTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCGCTCCCGCCCGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGc < 2:2801154/150‑1 (MQ=255) caccCCTATCGCCACCCGCAAAACCACAACCACCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGCTCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCCCGCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCtt < 1:356500/150‑1 (MQ=255) cTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCGCACCCCAAACCTCTCCCGCCCGCGGGCGAGGGGGCCGGGCGGGCCGGGTggg > 1:5998592/1‑150 (MQ=255) tATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTTGTGTTTGCCCACAACCCAACCCAAACACGCCCCCGGGATCGGGGGCCGGGGGTGGCGTGTGGGt > 1:660185/1‑150 (MQ=255) tATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGGCGGGCGTGGCGGGTgggg > 2:8700736/1‑149 (MQ=255) tATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCACACCCCAGCCCTCTACCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGGGCCGTGTGGGt > 1:1039422/1‑150 (MQ=255) cACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTGACCCCCACCCTCTCCCCCCCCCCGGAGCGGGGGGCGGGCGTGCCTGGTGGGGCGAgcg > 2:701894/1‑150 (MQ=255) ccGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCct < 1:1354112/150‑1 (MQ=255) cGCAAAACCACCACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGGTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCATCCCTCTCCCGCACTCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCctc < 2:7713275/150‑1 (MQ=255) aaaaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCctcgct < 1:9037016/150‑1 (MQ=255) ccACACCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCACCCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCggg < 1:177610/150‑1 (MQ=255) ccACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCGCACCCCCACCCAATCACCCACGCGGGGGGGGGGGGCGGGGGGGGCGTTTGGGTGGAGGGCcgcgcggggg > 1:4000652/1‑145 (MQ=255) cacaACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGgc < 2:737475/150‑1 (MQ=255) accaCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCCACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGgcg < 2:5136473/147‑1 (MQ=255) acaACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCACACCCCCAACCACAACCCCCCGCCGGGGAGGGGGCCGGGGGTGGCGTGTGGGGCGGGCGCCGCGCGCggggg > 2:948478/1‑148 (MQ=255) acaACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCACACCCCCACCCACAACCGCCCGCGGGTGAGGGGGCCCGGGGTGCGGGGTGGGTCGGGCGCCACCCACGGgcg > 1:10059677/1‑150 (MQ=255) caACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCGCAACCCAAACCTATCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGGCGTGTTGGGCGAGCGCCACGCACGGgcgc > 2:4088690/1‑150 (MQ=255) aaCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCGCACCCCAACCCGAACCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGGCTTGTGGGTCGAGGGCCTCGCGCGGGCGCa > 2:7985838/1‑150 (MQ=255) aaCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCGCACCCCAAACCTCTACCCCCCCCGGGCGCGGGGGCCGGGCGTGCCGTGTGGGTCGGGGGCCGCCCACGGGCGCa > 2:10754680/1‑150 (MQ=255) ccgcccccGCTGCGAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGc < 1:10802445/147‑1 (MQ=255) ccTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCCAACACCAACCCACTACCCCACCCGGGCGACGGGGCCCGGCGGGGCGATGGGGGCGAGCGGCGCGCTCGGgcgcccc > 2:9227700/1‑147 (MQ=255) cTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCTCACCCCAACCCACTCCCCCACCCGGGCGGGGGGGGCCGGCGGGCCATGTGGGGGGAGCGCCGCGCTCGGGCgccgcc > 2:8720995/1‑150 (MQ=255) cccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGa < 2:2412406/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGAACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGaa < 1:8803410/150‑1 (MQ=255) gctAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCGCACCCCAAACCACACCCGCACCCGGGTGAGGGGGCCGGGGGGGCGGGGTGGGTGGAGCGCCGCCCCCGGGGGCAGCCAGGGACGATg > 1:9697866/1‑150 (MQ=255) tAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTc < 2:3563522/150‑1 (MQ=255) aaCCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCt < 2:256041/150‑1 (MQ=255) aCCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCACACCCCAAACCAAAACCGCACGCGGGAGAGGGGGCCCGGCCTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCGCGCTCGGGCGCATCCAGGAACGCTGtata > 2:2147636/1‑150 (MQ=255) ctcAATAGCTGCGGATTGAGTGTCGCGGATCTGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCTACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGAATTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTaac < 2:6401617/148‑3 (MQ=255) tAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTccc < 2:8951777/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCACACCCCAACCCACACCCCCCCGCGGGGGAGGGGGCCGGGCGGGCCATGTGGGTCGAGCGCCGCGCGCGGGGGCCGCCAGGAAAGATTTCTAACCAcccc > 1:7790386/1‑150 (MQ=255) aGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTcccc < 2:484836/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGATAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTa < 2:9967569/150‑1 (MQ=255) ggCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCACACCCCAACCCACACCCCCACCCGGGCGAGGGGGGCCGGCGGGCCGTGTGGGGGGGGCGGCGCGCTCGGGCGGCGCCAGGGACCATGTCTTCCCTCCCCCA‑gggc > 1:10095472/1‑148 (MQ=255) gCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCCACCCACACCCGCACGCCGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCATGTGGGTCGAGCCCCTCGCTCGGGCGCAGCCAGGAACGATGTCTACCCAACCCGA‑GGccc > 2:6629988/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGccc < 1:4224814/150‑1 (MQ=255) gCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCACACCCCCAACCACTACCCCACCCGGGAGAGGGGGGCGGGCGTTGCATTTTGGTGGAGCGCCAAGCAAGGGCGCACCCAGGCACGATGTATAACCAACCCCA‑GGgcc > 2:6456345/1‑150 (MQ=255) cTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGcccc < 1:1765271/150‑1 (MQ=255) ttGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCACCCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCg < 1:7085716/150‑1 (MQ=255) ttGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCg < 1:9531212/150‑1 (MQ=255) ttGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCg < 1:2647795/150‑1 (MQ=255) gAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCCCACCCCCAACCCCTCCCCCCCGCCGGAGCGGGGGCCGGGCGGGGCTGGTGGGTGGACCGCCGCGCGCGGGCGCCGCCGGGAACCATGTCTACCCACCCCCA‑GGGCCCggg > 2:8378271/1‑150 (MQ=255) gAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCggg < 2:10395750/150‑1 (MQ=255) gtgtCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCACACCCCAACCCACTCCCCCACGCGGGGGAGGGGGCCGGGCGGGCCGTGGGGGGCGAGCGCCCCGCACGGGGGCAGCCGGGTACGAATTATAACCACCCCAAGGGCCCCggga > 2:9083119/1‑149 (MQ=255) gtCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACTCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATc < 2:10464156/150‑1 (MQ=255) gcgGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCGCACCCCAACCCCCACCCCCACCCGGGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGTGGGTCCAGCGCCTCGCGCCGGCGCCGCCGGGGACCATTTGTTCCCACCCCAA‑GGGCCCGGGtgtgggg > 2:4686807/1‑144 (MQ=255) cgGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCTCACCCCAAACCACTCCCCCACGCGGGGGAGGGGGCCCGGCGTGCCGTGTTGGTCGAGCGCCAAGCTCGGGCGCAGCCAGGAACGAAGTCTAACCTCCCCAA‑GGCCCCCGGGATCAGGa > 2:8092679/1‑150 (MQ=255) ggATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCCCGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCGACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGaa < 2:5707924/150‑1 (MQ=255) ggATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGaa < 1:3343913/150‑1 (MQ=255) ggATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGaa < 1:1607968/150‑1 (MQ=255) ggATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTGGGCCCACACCCCAACCCACTACCCCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCGTGTGGGTCGCGCGCCGCGCTCGGGCGCAGCCAGGCCCCATGGCTACCCACCCCTA‑GGCCCCCGGGATCTGGaa > 2:7829978/1‑150 (MQ=255) tttttGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGcc < 1:2117814/150‑1 (MQ=255) ttttGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGccc < 2:2760401/150‑1 (MQ=255) tttGGAATGTGGTGTTGGCCCACAACCCAAACCTCACCCGCACGCGGGAGAGGGGGGCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGCGCGCCGCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGGTGTCTACCCTCCCCAA‑GGCCCCGGGTATATGGAAATCGGcccc > 2:3247154/1‑150 (MQ=255) ttGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGccccc < 1:5285658/150‑1 (MQ=255) ttGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGccccc < 1:4938743/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCcccagccca < 2:8636400/150‑1 (MQ=255) gtTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTC‑GGCCCCGGGGATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCacc > 2:9759223/1‑148 (MQ=255) gtTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAAc < 2:3093244/150‑1 (MQ=255) tGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCa < 2:6365614/150‑1 (MQ=255) ggCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCaa < 1:6997782/150‑1 (MQ=255) gCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCaaa > 1:8080961/1‑150 (MQ=255) gCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCaaa < 1:9834723/150‑1 (MQ=255) | TATACAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCTTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA‑GGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAA > NC_008463/3515716‑3516009 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |