| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 1,271,763 | Δ1 bp | intergenic (+20/+69) | PA14_RS05965 → / ← PA14_RS05970 | YidB family protein/aldo/keto reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 1,271,761 | 0 | G | . | 99.8% | 2285.9 / ‑3.2 | 463 | intergenic (+18/+71) | PA14_RS05965/PA14_RS05970 | YidB family protein/aldo/keto reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base . (245/216); total (247/216) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 499 total aligned reads displayed.
CGGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCGGGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGGTCG > NC_008463/1271611‑1271907 | cgGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCg > 1:1745773/1‑151 (MQ=255)cgGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCg > 2:5020965/1‑151 (MQ=255)cgGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCGTCAGCGAAGGTTTTCCCGTCGATGCg > 2:4618015/1‑151 (MQ=255) tCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCTGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCggagcg > 1:4507966/1‑147 (MQ=255) tCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTGTTCCCGTCGATGCggagcg > 1:3411974/1‑147 (MQ=255) gCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGAt > 1:5515215/1‑151 (MQ=255) gCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGAt > 1:11284958/1‑151 (MQ=255) cAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAg < 2:10564275/151‑1 (MQ=255) aGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTTCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGACAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCCTCAGCTAAGTTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGc < 2:3167848/151‑1 (MQ=255) gCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCcgc > 2:3064437/1‑151 (MQ=255) cGAGGCGGCCGAACACCTTAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCTGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCcgcg < 1:2428359/151‑1 (MQ=255) agtcggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGTACTGGTCAACAAGCAGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGAt < 2:2902987/148‑1 (MQ=255) aGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGAt < 1:7165740/151‑1 (MQ=255) cggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACg > 1:6543768/1‑151 (MQ=255) ggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACgg < 2:1869272/151‑1 (MQ=255) ggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACgg < 1:1865344/151‑1 (MQ=255) ggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACgg > 1:7968862/1‑151 (MQ=255) ggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACgg > 1:5286871/1‑151 (MQ=255) gcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATGGCCGCGATACGGt < 2:8724103/151‑1 (MQ=255) ccGACCACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACACGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCTGGGCGTCCTGGACATCGGTTCGATGCTGGAGCGCTTCAGCTTATTTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGTTAGACGCGATACGGtt < 2:7241351/151‑1 (MQ=255) ccGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTGCAGCTAGGGTTGTCCCGTCGAGGC‑GGAGCGGCGAGCCGCGATGCgggg > 2:7535338/1‑149 (MQ=255) cGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTa > 1:355224/1‑151 (MQ=255) gAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTAt > 1:7351355/1‑151 (MQ=255) gAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTAt > 1:6214642/1‑151 (MQ=255) acCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGc < 1:2228979/151‑1 (MQ=255) ccTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCt > 1:695161/1‑151 (MQ=255) agcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCa < 1:9333765/151‑1 (MQ=255) agcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCa < 2:5888676/151‑1 (MQ=255) ccTGCTGCCGGAACTGGTCAACCAGCTGACGCCGGTCGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAAc < 2:6062761/151‑1 (MQ=255) ctgctgCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACg > 1:1232169/1‑151 (MQ=255) tgctgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACgg > 1:2970151/1‑151 (MQ=255) gctgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACggg < 2:7913103/151‑1 (MQ=255) gctgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGGTATCCGCTCCACTCAACggg > 1:7620897/1‑151 (MQ=255) tgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGc > 2:9356729/1‑151 (MQ=255) tgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGc < 1:6051717/151‑1 (MQ=255) tgcCGGAACTGGTCAACAAGATGACGCCGGACGTCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTACGCAGCAGTCGAGCTAAAGCTAAGGTTTACCCCTCGATGC‑GGATCGTATAGCAGCGATAAGGTTATCCGCTCCACTAAACGGGGc > 2:8463975/1‑151 (MQ=255) ccGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCGAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGa > 2:7048728/1‑151 (MQ=255) cGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTCAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAg < 2:6960085/151‑1 (MQ=255) cGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGTTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTAAACGGGGCGAg > 1:500106/1‑151 (MQ=255) gAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGgc > 2:10718293/1‑151 (MQ=255) aCTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCTGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGgccg > 2:3586482/1‑151 (MQ=255) tGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACCTCGGGTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTCTCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGgccgcc > 1:10481837/1‑151 (MQ=255) caacaaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCg > 1:3970090/1‑151 (MQ=255) aacaaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCTGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGa > 2:3693665/1‑151 (MQ=255) aacaaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGa > 1:11018561/1‑151 (MQ=255) aacaaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGAGGTTCAGCTAAGGGTTTCCCGTCGAGGC‑GGAGCGGATCGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACGCAACGGGGCGAGGCCGGCCTCgc > 2:5158806/1‑150 (MQ=255) ccaaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGCCATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCGAAGGTGTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCGCCACTCCACGGGGCGAGGCCGCCCTCGAc < 2:8879197/150‑1 (MQ=255) acaaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGAc < 2:2935351/151‑1 (MQ=255) aCGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggtc > 1:8882552/1‑151 (MQ=255) cGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggtcg < 1:3744953/151‑1 (MQ=255) gCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCGTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggtcgg < 1:1526679/151‑1 (MQ=255) cGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTATGGTTGTGCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATAGGGTTATCCGCTCCACGCAACGGGGCGAGGGCGACCTCGACGGCAggtcggtc > 1:11058099/1‑151 (MQ=255) cGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggtcggtc > 2:1199532/1‑151 (MQ=255) cGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggtcggtc < 1:4753184/151‑1 (MQ=255) ggACGGCCTGGCGCCGCTGTGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCa < 2:2031993/151‑1 (MQ=255) ggACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCa > 1:3217410/1‑151 (MQ=255) ggACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCa > 2:4842070/1‑151 (MQ=255) ccGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTGTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAAt < 2:6833598/150‑1 (MQ=255) aCGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAAt > 2:8141529/1‑151 (MQ=255) aCGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAAt > 1:5730318/1‑151 (MQ=255) aCGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAAt > 2:2417609/1‑151 (MQ=255) aCGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAAt < 2:2579060/151‑1 (MQ=255) cGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATa < 1:1119447/151‑1 (MQ=255) 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ggACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTg < 2:1290400/151‑1 (MQ=255) gACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTgg > 2:9218390/1‑151 (MQ=255) cATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGAt > 2:216477/1‑151 (MQ=255) cATCGGTTCGCTGCCGGCGCGCTTCAGCTAAGGTATTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGAt < 1:9667358/151‑1 (MQ=255) tCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCg > 1:10112598/1‑151 (MQ=255) ggTTCGCTGCTGGCGCGCTGCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGcc > 2:1489847/1‑151 (MQ=255) tCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGt > 1:5903242/1‑151 (MQ=255) gctgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcgtc < 1:9990294/151‑1 (MQ=255) gctgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcgtc < 1:984273/151‑1 (MQ=255) gctgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcgtc > 1:3294038/1‑151 (MQ=255) tgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGa < 1:9100613/151‑1 (MQ=255) tgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTGGCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGGCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGa < 2:5853943/151‑1 (MQ=255) cgcgcTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCt < 1:8614218/151‑1 (MQ=255) cTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAg < 1:6691767/151‑1 (MQ=255) cAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAggtg > 2:11327075/1‑151 (MQ=255) gCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAggtggg < 2:10196606/151‑1 (MQ=255) ttttCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTggcggc < 2:4066189/151‑1 (MQ=255) tttCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGgcggcg > 1:2711683/1‑151 (MQ=255) ttCCCGTCGTTGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCGGGCGCGGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGa > 1:2503147/1‑151 (MQ=255) ttCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGa > 1:8383938/1‑151 (MQ=255) 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cGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCTCTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGTCGGCAGGTCGGTAAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGgtc < 2:5432116/151‑1 (MQ=255) cGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGgtc > 1:4353888/1‑151 (MQ=255) | CGGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCGGGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGGTCG > NC_008463/1271611‑1271907 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |