| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 5,536,163 | 0 | G | A | 45.7% | 410.6 / inf | 435 | intergenic (‑12/+132) | rrf/PA14_RS25360 | 5S ribosomal RNA/23S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (100/135); new base A (96/102); total (197/238) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 437 total aligned reads displayed.
CACTACCATCGGCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCAAGCCTCACGGGC > NC_008463/5536073‑5536313 | acTACCATCGGCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGc < 1:10097110/151‑1 (MQ=31) tcccctCGGCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCgg < 2:6555037/146‑1 (MQ=2) tACCATCGGCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCgg > 1:3719758/1‑151 (MQ=32) aCCATCGGCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGt > 2:1848781/1‑151 (MQ=33) aTCGGCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCa < 1:6615268/151‑1 (MQ=33) tCGGCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCAt < 2:7170432/151‑1 (MQ=14) cGGCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTTTGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATg < 2:8490020/151‑1 (MQ=18) cGGCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATg < 2:7440717/151‑1 (MQ=33) cGGCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATg < 1:23144/151‑1 (MQ=33) ggCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGc < 2:10718235/151‑1 (MQ=33) ggCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGc < 2:2667662/151‑1 (MQ=14) gCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCg < 1:1224947/151‑1 (MQ=33) cGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGa < 1:10895585/151‑1 (MQ=14) gATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGaa > 2:4915856/1‑151 (MQ=33) tGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACt < 2:3367577/151‑1 (MQ=14) tGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACt > 1:10776865/1‑151 (MQ=14) gCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACtt > 1:6923221/1‑151 (MQ=33) cgtcgtTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTCTCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACttt > 1:9325217/1‑151 (MQ=14) gtcgtTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTc < 2:10111530/151‑1 (MQ=33) gtcgtTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTc < 2:3216660/151‑1 (MQ=14) gtcgtTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTc < 1:9075532/151‑1 (MQ=14) tcgtTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCg < 1:4442757/151‑1 (MQ=14) cgtTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCgg < 1:3101897/151‑1 (MQ=33) tttCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGtt > 2:108279/1‑151 (MQ=14) ttCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTtc > 1:3645633/1‑151 (MQ=33) tCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTtcg < 1:7543197/151‑1 (MQ=14) aCTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTCTCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTtcgtc > 1:7711126/1‑151 (MQ=14) cTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTtcgtcg < 1:4332057/151‑1 (MQ=14) cTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTtcgtcg < 1:4282359/151‑1 (MQ=14) ttCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGa < 2:9098688/151‑1 (MQ=33) tCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTtcgtcgcc < 1:10351110/151‑3 (MQ=14) tGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTGCGGTTCGTCGACtt > 2:11052408/1‑151 (MQ=18) gAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTc > 1:9712904/1‑151 (MQ=14) gTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCAc > 1:2104512/1‑151 (MQ=33) gTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCAc < 1:4829677/151‑1 (MQ=33) ttCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCAcc > 1:585644/1‑151 (MQ=33) tCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCt > 1:1509558/1‑151 (MQ=33) tCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCt < 2:3001178/151‑1 (MQ=33) tCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTGGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCt < 2:4471572/151‑1 (MQ=18) cGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCtt < 2:2716141/151‑1 (MQ=33) cGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCtt > 2:8020467/1‑151 (MQ=14) gggAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTa < 2:7027137/151‑1 (MQ=14) ggAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTac > 2:5712895/1‑151 (MQ=33) ggAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTac < 2:4803256/151‑1 (MQ=14) gAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTaca < 1:6413543/151‑1 (MQ=14) aaGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTTGTCGACTTCACCTTacaa > 1:4694963/1‑151 (MQ=18) aaGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTacaa < 1:1835596/151‑1 (MQ=14) gggATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTacaaca < 1:716283/151‑1 (MQ=33) ggATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAacac < 2:6032458/151‑1 (MQ=33) aTCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAacacac > 2:668818/1‑151 (MQ=33) aTCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAacacac > 1:9383818/1‑151 (MQ=33) aTCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAacacac < 2:6337264/151‑1 (MQ=33) tCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAAcacaca < 1:353157/151‑1 (MQ=14) cAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACaa > 2:9533189/1‑151 (MQ=14) aGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAAt < 1:5032902/151‑1 (MQ=33) ggtggtTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAAta < 1:8005568/151‑2 (MQ=18) tggtTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGt < 1:2937873/151‑1 (MQ=34) tggtTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTAGGTAGGATATACGAACGCTTGTGCTTACGTCTAACAGGATTAAGTTATGTTATTTCAAGTTGTTTGAGTTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCAACTTACAACACACCAtaga > 2:10317821/1‑148 (MQ=11) ggtTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTc > 2:9283416/1‑151 (MQ=14) ttCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACACTCGTCAg > 2:438999/1‑151 (MQ=25) ccAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGAt < 2:9733472/151‑1 (MQ=14) cAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGAtt > 1:9934433/1‑151 (MQ=35) cAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGAtt < 2:8690982/151‑1 (MQ=14) cAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGAtt < 1:8577620/151‑1 (MQ=14) aCGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACACTCGTCAGAgtgt > 2:6805964/1‑151 (MQ=25) cGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGtt > 2:8950026/1‑151 (MQ=35) gCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGttt > 1:11197748/1‑151 (MQ=14) gCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGttt > 1:5927719/1‑151 (MQ=14) ctctATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTg > 2:5220001/1‑151 (MQ=35) tATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGTACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGgt < 2:9893040/151‑1 (MQ=25) tATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGgt > 2:9398249/1‑151 (MQ=14) aTGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGgtg < 1:11362606/151‑1 (MQ=35) tGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGgtgt > 1:1607255/1‑151 (MQ=35) tGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGgtgt < 2:2352236/151‑1 (MQ=35) gATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGtt < 1:2428802/151‑1 (MQ=35) aTCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTta > 2:3839094/1‑151 (MQ=35) aTCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTta < 2:1343481/151‑1 (MQ=35) tCGTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTtat < 2:6174212/151‑1 (MQ=14) gTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTatat > 1:59779/1‑151 (MQ=35) gTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTatat < 1:5564237/151‑1 (MQ=14) gTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTatat < 1:603977/151‑1 (MQ=14) gTCAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTatat < 1:8978609/151‑1 (MQ=14) tCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGTACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATg < 2:549573/151‑1 (MQ=25) tCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATg < 1:7345658/151‑1 (MQ=35) cacgCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATgg < 2:584407/148‑1 (MQ=25) cAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATgg < 1:8423226/151‑1 (MQ=35) cAAGCAATTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTAGATgg > 2:3663806/1‑151 (MQ=14) aaGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACTTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGGGTTCTATGGt > 2:4063036/1‑151 (MQ=255) cAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCaa < 1:6238105/151‑1 (MQ=35) aaTTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCAAg < 1:4947197/151‑1 (MQ=14) aaTTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCAAg > 2:1630650/1‑151 (MQ=14) atacGGTTGAATATCCGTTAGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGAATCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGAATTCACCTTAAAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCAAGc > 2:5266113/4‑151 (MQ=11) aTTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCAAGc < 2:2243325/151‑1 (MQ=35) aTTCGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCAAGc < 1:9524877/151‑1 (MQ=14) tCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCAAGCCt < 2:11464799/151‑1 (MQ=35) cGGTTGAATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCAAGCCTc < 1:1909109/151‑1 (MQ=14) gTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTCTCCGGATTCAGGTATGTGGTTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCAAGCCTCAc > 1:5709585/1‑151 (MQ=25) gTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCAAGCCTCAc < 2:5111265/151‑1 (MQ=35) gTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCAAGCCTCAc > 2:11199287/1‑151 (MQ=35) tGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCAAGCCTCACgg < 1:5184599/151‑1 (MQ=35) | CACTACCATCGGCGATGCGTCGTTTCACTTCTGAGTTCGGGAAGGGATCAGGTGGTTCCAACGCTCTATGATCGTCAAGCAATTCGGTTGGATATCCGTTCGCTTGGGCTTACGTCTATCCGGATTCAGGTATGTGATTTCAAGGTGTTTGCGGTTCATGCGAACTTTCGGTTCGTCGACTTCACCTTACAACACACAATCGTCAGATTGTTTGGGTGTTATATGGTCAAGCCTCACGGGC > NC_008463/5536073‑5536313 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |