| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_008463 | 3,374,601 | A→G | F41S (TTC→TCC) | PA14_RS15385 ← | aminotransferase class V‑fold PLP‑dependent enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 3,374,601 | 0 | A | G | 99.8% | 1936.0 / NA | 486 | F41S (TTC→TCC) | PA14_RS15385 | aminotransferase class V‑fold PLP‑dependent enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (187/298); minor base T (1/0); total (188/298) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.87e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 490 total aligned reads displayed.
GCCTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGAAATTCGACGCGGGATTGCCAAAACACGCCTGGTAGCCGAGACACTCCACCATGGCCCGGATCACGCGCTCGTCCACGGGCGTGGTGGCGGCGTAATCGAAGTACAACGGTAACGAACTCATCGCATTCCCCCAATCGATCGGACG > NC_008463/3374454‑3374746 | gcCTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGgaa < 1:2832882/150‑1 (MQ=255)gcCTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGgaa < 2:255980/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAAt < 2:8949243/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAAt < 2:4283472/150‑1 (MQ=255) cTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAAtt > 2:9081460/1‑150 (MQ=255) tGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTc > 2:141301/1‑150 (MQ=255) tGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTc > 1:3166106/1‑150 (MQ=255) ggggCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGGTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTc < 1:453754/149‑1 (MQ=255) ggCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGa < 1:4371582/150‑1 (MQ=255) cACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGAcgc > 2:783337/1‑150 (MQ=255) cccTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGa < 1:7684099/150‑1 (MQ=255) cccTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGa > 2:1222080/1‑150 (MQ=255) ccTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGAt < 1:4141615/150‑1 (MQ=255) cTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGAtt > 1:8823044/1‑150 (MQ=255) ttGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTg > 1:10582321/1‑150 (MQ=255) aGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCa > 1:5979904/1‑150 (MQ=255) aGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCa < 2:5684552/150‑1 (MQ=255) aGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCa < 2:1991524/150‑1 (MQ=255) 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tAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCAAAACACGCCTGGTAGCCGAGACACTCCACCATGGCCCGGATCACGCGCTCGTCCACGGGCGTGGTGGCGGCGTAATCGAAGTACAACGGTAACGAACTCATCGCATTCCCCCAatcgatc > 1:6764435/1‑150 (MQ=255) aTGGGAAGTCGACGCGGGATTGCCAAAACACGCCTGGTAGCCGAGACACTCCACCATGGCCCGGATCACGCGCTCGTCCACGGGCGTGGTGGCGGCGTAATCGAAGTACAACGGTAACGAACTCATCGCATTCCCCCAATCGATcggacg < 2:824435/150‑1 (MQ=255) | GCCTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGAAATTCGACGCGGGATTGCCAAAACACGCCTGGTAGCCGAGACACTCCACCATGGCCCGGATCACGCGCTCGTCCACGGGCGTGGTGGCGGCGTAATCGAAGTACAACGGTAACGAACTCATCGCATTCCCCCAATCGATCGGACG > NC_008463/3374454‑3374746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |