Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_008463 | 3,515,863 | T→C | intergenic (+617/+267) | PA14_RS16005 → / ← PA14_RS16010 | AAA family ATPase/DUF4354 family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_008463 | 3,515,863 | 0 | T | C | 99.6% | 990.6 / NA | 266 | intergenic (+617/+267) | PA14_RS16005/PA14_RS16010 | AAA family ATPase/DUF4354 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (138/126); minor base A (1/0); total (140/126) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
TATACAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCTTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAA > NC_008463/3515716‑3516009 | ataCAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCa < 1:4131961/150‑1 (MQ=255) ataCAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCa < 2:5444341/150‑1 (MQ=255) taCAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTTG‑CCCTCAc > 1:3379305/1‑150 (MQ=255) aGCCCCTCCCTACGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCAcccc < 1:6191980/150‑1 (MQ=255) gCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTTG‑CCCTCACCCCa > 2:3174103/1‑150 (MQ=255) gCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTATTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCa > 2:386657/1‑150 (MQ=255) ccccTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCTCACCCCaa > 2:184056/1‑150 (MQ=255) ccctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAAc < 2:5482695/150‑1 (MQ=255) ccctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACACCCCaaa > 1:5614066/1‑149 (MQ=255) ctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCACaacccaaccc > 1:9162744/1‑150 (MQ=255) ctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACACCCCAAccc > 2:2327183/1‑150 (MQ=255) ctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCtc‑tc < 1:10354059/150‑1 (MQ=255) tAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACCCCCCAACCCAC‑Tcc > 2:7010899/1‑150 (MQ=255) aTAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTTG‑CCCACACCCCAAACCAC‑Acccccccg > 2:786792/1‑145 (MQ=255) tAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCTCAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCACTAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCTCACCCCAACCCAC‑TCCCCCCcgc > 1:3532672/1‑150 (MQ=255) cccTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTAACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCggg > 2:8642261/1‑150 (MQ=255) ccTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCACCCCTC‑TCCCGCACGCGGga < 1:10679095/150‑1 (MQ=255) tCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACAACCCAACCCAC‑ACCCCCACGCggggggg > 2:5202757/1‑146 (MQ=255) ccccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCGCACCCCAACCCCC‑ACCCGCACGCgggggggg > 1:2074401/1‑145 (MQ=255) ccccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCACCCCCCAACCCAC‑ACCCGCCCGCGGGGGAgg > 1:8247193/1‑150 (MQ=255) ccccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAgg < 2:9506935/150‑1 (MQ=255) cccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCACCCCCCAACCCAC‑TACCCCACGCGGGGGAggg > 2:278095/1‑150 (MQ=255) cccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCACACCCCAAAACAC‑AACCGCACGCGGGTGAggg > 1:9764099/1‑150 (MQ=255) aCCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCGCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAAGGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCTACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCg < 2:8799271/150‑1 (MQ=255) ccTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCCCCCCCCAACCCGC‑TACCCCACCCGGGGGAGGGGGGCgg > 2:5242732/1‑150 (MQ=255) tGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACACCCCAACCCAC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGc > 2:1334481/1‑150 (MQ=255) ggCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCGCACCCCCAACCTC‑TCCCCCACGCGGGCGAGGGGGGCGGGGGTggc > 1:95307/1‑148 (MQ=255) gCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCAACCCCCCACCCAC‑ACCCCCACCCGGGGGAGGGGGCCggggggggcg > 1:6035374/1‑143 (MQ=255) cacaCCTCTGGCCACCCGCAACACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCtt < 1:778969/150‑1 (MQ=255) cacCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCAC‑TCCCCCACGCGGGGGTGGGGGCCGGGCGTGCCAtgt > 2:10158109/1‑150 (MQ=255) acCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTtgtg < 1:3286091/150‑1 (MQ=255) ccTATTGCCACCCGCACACCCCCACCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAAGAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCACCCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTgg < 1:6798476/150‑1 (MQ=255) tATTGCCACCCGCAAAACCACACCCTCCCCCGCTGCTACCCGAATTAGCTGCGGCTTGTGTGTCGCGTTTCGGTTTTTGGATTGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCACCCCTC‑TCCCGCACGGGGTATTGGGGGCGGGGCGTGCCTTGTGGGt < 2:2685339/150‑1 (MQ=255) cttGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTGTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCCTCCCTC‑GCCCGCACGCGGGGGCGGGGGCCGGGGGGGCCGGGTggggc > 2:197241/2‑148 (MQ=255) agtGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCACCCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTc < 1:5578270/148‑1 (MQ=255) aTTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCAACACCCAAACCC‑C‑ACCCCCACGCGGGAGAGGGGGGCCGGCGTGCCGTGTGGGTc > 2:10702755/1‑150 (MQ=255) ttGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCg < 1:8120628/150‑1 (MQ=255) gCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTA‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCgtg > 2:6859652/1‑148 (MQ=255) aCCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAgcgc < 1:7458764/150‑1 (MQ=255) cccGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCGCACCCCAACCCAC‑ACCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCATGTGGGTCGAGCGcc > 2:2219675/1‑150 (MQ=255) ccGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCct < 2:3160220/150‑1 (MQ=255) cGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCAC‑ACCCGCACGCGGGTGTGGGGGGCGGGCGTGCCATGTGGGTCGAGCGCctc > 1:7928827/1‑150 (MQ=255) gCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACACCCCCACCCAC‑GCCCCCCCCCCGGCCAGGGGGGCGGGCGGGGCGTGGGGGTAGGGCGCctcg > 2:8309912/1‑150 (MQ=255) aaCCCCAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCctcgctcg < 1:2231980/150‑1 (MQ=255) aaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCGCCCCCCAAACCACAACCCCCAC‑CGGGGGGGGGGGGCGGGCGGGGGGGGTGGGTGGGGCGCcccgcgcg > 1:3900178/1‑150 (MQ=255) aaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCCCACCCCAACCCAC‑ACCCCCACGCGGGGGAGGGGGGCGGGGGGGGCGTGTGGGGCGAGCGCcacgctcg > 1:10086398/1‑150 (MQ=255) aaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCctcgctcg < 2:366470/150‑1 (MQ=255) ccACACCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGATTGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCggg < 2:4489575/150‑1 (MQ=255) ccACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCGC‑TACCGCACGCGGGTGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCGCggg > 2:7375522/1‑150 (MQ=255) caACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCGCACCCCCAACCTC‑TACCGCACGCCGGTGTGGGGGGCGGGCGTGGCGGGTGGGGCGAGCGCCGCGCGCGGgggc > 2:9811986/1‑150 (MQ=255) caACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCCAACCCCAAACCAA‑ACCCCCGCCCGGGGGTGGGGGGGGGGGGTGGCGTGTTGGGGGGGCCCCACGCACGGgcgc > 1:8862919/1‑150 (MQ=255) caACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCCCCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGgcgc < 1:2690406/150‑1 (MQ=255) aaCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCa < 1:6665572/150‑1 (MQ=255) ccTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCGCACCCCCAACCAC‑ACCCGCCCGCGGGAGAGGGGGGCGGGCGTGGCGTTTGGGGCGAGCGCCACGCGCGGGCGCAGc > 1:8502310/1‑150 (MQ=255) cTCCCCCGCTGCTACCCGCAATAGATGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGTGCGCAGcc < 2:4970147/150‑1 (MQ=255) cccccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCGTGAGTGTCGCGGATCGGTTTGTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCGACCCCCAACCCTC‑TCCCCCCAGCGGGAGAGGGGGGCGGGCGGGGCGGGGGGGTCGGGCGCCTCGCTCGGGCCGAGccgg > 2:10424409/1‑148 (MQ=255) ccccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTgg < 1:3944883/150‑1 (MQ=255) ccccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACACCCCAAACCAC‑AACCCCACCCGGGGGAGGGGGCCGGGCGTGCCGAGTGGGTCGAGCGCCTCGCGCGGGCGCAGCCAgg > 2:8475309/1‑150 (MQ=255) cccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGa < 2:4159472/150‑1 (MQ=255) cccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGa < 2:1641462/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCGAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGaa < 2:8072462/150‑1 (MQ=255) ctgctAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACCCCCCAAAACGA‑ACCCGCACCCGGGCGAGGGGGGCGGGCGGGGCGGGTGGGTCGGGCGCCGCGCTCGGGCGCAACCGGGGACgg > 1:10417173/1‑149 (MQ=255) tgctAACAGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGATTGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGAt < 1:7116710/150‑1 (MQ=255) aaCCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCt < 2:8865181/150‑1 (MQ=255) ccGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTAc < 1:4746368/150‑1 (MQ=255) cAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCACACCCCCAACCAC‑AACCCCACCCCGGTGAGGGGGCCGGGCGTGCCCTTTGGGGGGAGCGCCCCCCGCCGGGGCACCCAGGGACCATTTCTAcccc > 1:8672563/1‑149 (MQ=255) cAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCt < 2:5878125/150‑1 (MQ=255) cagcgCTGCGGCCTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTTGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCCACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCGCGCTCGGGCGCAGCCGGGAACGATGACTACCCTc < 2:1787359/146‑1 (MQ=255) aaTAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCAACCCAAACCAC‑TCCCCCAAGCGGGAGATGGGGCCGGGCGTTCCGTGTGGGTCGAGCGCCGAGCTAGGGCGCCGCCATGAACGATGTCTACCCTc > 2:7379000/1‑150 (MQ=255) tAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTccc < 1:10241238/150‑1 (MQ=255) tAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTccc < 2:1376480/150‑1 (MQ=255) gCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCt < 1:8558634/150‑1 (MQ=255) cGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCCCACCCCCACCCAA‑ACCCCCACCCGGGGGTGGGGGCCCGGCGTGCCGTGTGGGTCGAGCGCCACGCACGGGCGCAGCCGGGAACCATGTCAAACCACCCCAAGGc > 2:6284798/1‑150 (MQ=255) cGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCAAACCCCAACCCAC‑ACCCCCAACCCGGTGAGGGGGGCGGGCGTGCCGTGTTGGTCGAGCGCCGCCCTCGGGCGCAGCCAGGAACGATTTCTACCCAccccaatgc > 2:2591216/1‑145 (MQ=255) cTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCTCACCCCAAACCTCAACCCCCCCACGGGTTGGGGGGCC‑GGCGTGGCATGTGGGTGGAGCGCCGCGCAAGGGCGCCGCCCGGGACAGTGTATAACCGCCCCAAGGcccc > 2:7276648/1‑150 (MQ=255) ttGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCg < 2:9546680/150‑1 (MQ=255) gtgtCGCGGCTCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTTG‑CCCACACCCCAAACCTA‑AACCACCCCCGGGGGAGGGGGGCCGGCGTGGCATGGGGGGGGAGCGCCGCGCGAGGGCGCAGCCAGGAAAGATGTGTAACCACCCCAAGGCCCCCGGTa > 2:3002553/1‑150 (MQ=255) gtgtCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTa < 2:901618/150‑1 (MQ=255) gtCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTAACCCCAACCCAC‑TCCCGCACCCGGGAGAGGGGGCCGGGGGTGCCGTGTGGGTAGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCGGGTACGATGTATACCCGCCCCAAGGCCCCCGGGATc > 2:6516566/1‑150 (MQ=255) tCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACACCCCAACCCGC‑TCCCCCACGCCGGGGAGGGGGGCCGGGGGGCCATGTGGGTGGAGCGCCACGCTAGGGCGCACACGGGAACCATGTCTAACCACCCCAAGGGCCCGGGTATCt > 2:4349592/1‑150 (MQ=255) gATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAAt < 2:569876/150‑1 (MQ=255) aTCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAAtt < 2:1025038/150‑1 (MQ=255) aTCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAAtt < 1:116620/150‑1 (MQ=255) aTCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAAtt < 1:4245646/150‑1 (MQ=255) aTCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTA‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAAtt < 2:1654188/150‑1 (MQ=255) gTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACACCCCAACCCAC‑AACCCCACCCCGGGGAGGGGGGCCGGCGTGGCGTTTGGGTCGAGCGCCACCCACGGGCGCACCCGGGTAAGAATTATACCCACCCCAAAGCCCCCGGGATAAGGAAATAGGc > 2:7125495/1‑150 (MQ=255) ttGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGccccc < 1:1747097/150‑1 (MQ=255) ttGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGccccc < 1:4439772/150‑1 (MQ=255) tgtgGAGTTGG‑CCCGCACCCCCACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGAGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCcccagccca < 2:7615222/150‑1 (MQ=255) tggtgTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAgg < 2:571271/150‑1 (MQ=255) ggtgTTGG‑CCCTCACCCCACCCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGc < 2:10621000/150‑1 (MQ=255) gtgtTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCGTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCACCCCAAGGCCCCGGGTATCTGGAAATCGGCCCCCAGCCCAGGCa > 2:448104/1‑150 (MQ=255) tgtTGG‑CCCTCACCCCAACCCAC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGGATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCaa > 1:7618922/1‑150 (MQ=255) gtTGG‑CCCTCACCCCACCCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAAc < 2:3452372/150‑1 (MQ=255) gtTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCacc > 2:5366205/1‑148 (MQ=255) tGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCa < 1:6438465/150‑1 (MQ=255) gg‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCaa > 2:10407380/1‑150 (MQ=255) gg‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCGTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCaa > 2:10032015/1‑150 (MQ=255) gg‑CCCTCACCCCAACCCAC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCAAGGCCCCGGGTATCTGGAATTAGGCCCCCAGCCCAGGCAACCaa > 1:2848915/1‑150 (MQ=255) g‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCaaa < 2:844360/150‑1 (MQ=255) | TATACAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCTTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAA > NC_008463/3515716‑3516009 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |