| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_008463 | 3,711,791 | G→C | V51L (GTG→CTG) | cobA → | uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 3,711,791 | 0 | G | C | 99.8% | 1978.6 / NA | 505 | V51L (GTG→CTG) | cobA | uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (282/222); total (283/222) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 512 total aligned reads displayed.
AGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATTTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGGTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCGCGCCGGCGAAGAA > NC_008463/3711644‑3711937 | gCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATTCTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGgctgg > 2:8558229/1‑150 (MQ=255) gCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGgctgg > 2:3223546/1‑150 (MQ=255) ggTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTc < 2:1381401/150‑1 (MQ=255) 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tGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCt < 1:10131103/150‑1 (MQ=255) tGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCt < 2:5088109/150‑1 (MQ=255) ggAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCtt > 1:9439775/1‑150 (MQ=255) gCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCgg < 1:4302421/150‑1 (MQ=255) cACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGc < 2:5217536/150‑1 (MQ=255) gtccgtccGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCcgcg < 1:8842464/150‑1 (MQ=255) gtccgtccGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCcgcg > 2:2783368/1‑150 (MQ=255) tccgtccgCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCAGGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCgcgc < 1:7107761/150‑1 (MQ=255) ccgtccgCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCGCGcc < 2:7897910/150‑1 (MQ=255) ccgtccgCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCGCGcc < 1:8570057/150‑1 (MQ=255) gtccgCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCGCGCCgg > 1:9000998/1‑150 (MQ=255) gtccgCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCGCGCCgg > 2:1893487/1‑150 (MQ=255) gtccgCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCGCGCCgg < 1:103272/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCGCGCCGGCgaa < 1:2413256/150‑1 (MQ=255) ccGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCGCGCCGGCgaaga > 2:3841792/1‑150 (MQ=255) cGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCGCGCCGGCgaagaa < 1:8069829/150‑1 (MQ=255) cGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCGCGCCGGCgaagaa > 1:7014864/1‑150 (MQ=255) | AGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATTTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGGTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCGCGCCGGCGAAGAA > NC_008463/3711644‑3711937 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |