Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_008463 | 3,711,749 | T→C | L37L (TTG→CTG) | cobA → | uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_008463 | 3,711,749 | 0 | T | C | 99.8% | 2042.5 / NA | 527 | L37L (TTG→CTG) | cobA | uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (305/221); minor base A (0/1); total (305/222) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.21e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 527 total aligned reads displayed.
CCCCCCGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATTTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGGTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGA > NC_008463/3711601‑3711896 | ccccccGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTg > 1:5242506/1‑151 (MQ=255) cccccGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTgg > 1:5707331/1‑151 (MQ=255) cccccGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTgg < 2:1218199/151‑1 (MQ=255) ccccGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGt > 2:9568764/1‑151 (MQ=255) cccGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTc < 2:1902411/151‑1 (MQ=255) cccGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTc > 2:1767961/1‑151 (MQ=255) ggCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAAc < 1:8198529/151‑1 (MQ=255) gCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAAcc < 1:338682/151‑1 (MQ=255) aTGGCGGCGACTGCCTGAGGAGAACGCCGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAg < 1:4667364/151‑1 (MQ=255) tGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGc < 2:7950097/151‑1 (MQ=255) aaTGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGa > 1:6012173/1‑151 (MQ=255) aTGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAg < 1:9497478/151‑1 (MQ=255) aTGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAg > 2:8952438/1‑151 (MQ=255) tGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGc > 1:10385272/1‑151 (MQ=255) gCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACAGTTGACCCTGCAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGACGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCa < 1:1377756/151‑1 (MQ=255) tGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTg < 1:4848872/151‑1 (MQ=255) ggagAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTgtcc > 1:927132/1‑151 (MQ=255) gagaACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTgtccg > 2:6087898/1‑151 (MQ=255) 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aGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCg > 2:2575443/1‑151 (MQ=255) ggACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGc > 2:5277223/1‑151 (MQ=255) gACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGcc > 2:6568018/1‑151 (MQ=255) cgcgGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAg > 1:7030045/1‑151 (MQ=255) ggATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGa < 2:9834755/151‑1 (MQ=255) 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tgATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgt < 1:10734694/151‑1 (MQ=255) tgATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgt > 2:934294/1‑151 (MQ=255) ggTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgtggtg < 2:6619477/151‑1 (MQ=255) ggTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgtggtg < 2:3020887/151‑1 (MQ=255) cgacgaTCTGGTCAACCCGAGCATACAGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTgcgc > 2:10419824/1‑151 (MQ=255) 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cgaTCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCAGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGACGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGTGACGCAGCGAGGTCCGCCTg > 2:7195117/1‑151 (MQ=255) gaTCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGa > 1:5899306/1‑151 (MQ=255) | CCCCCCGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATTTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGGTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGA > NC_008463/3711601‑3711896 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |