Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_008463 | 5,905,079 | A→G | F731F (TTT→TTC) | glnE ← | bifunctional [glutamate‑‑ammonia ligase]‑adenylyl‑L‑tyrosine phosphorylase/[glutamate‑‑ammonia‑ligase] adenylyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_008463 | 5,905,079 | 0 | A | G | 99.8% | 1877.4 / NA | 489 | F731F (TTT→TTC) | glnE | bifunctional [glutamate‑‑ammonia ligase]‑adenylyl‑L‑tyrosine phosphorylase/[glutamate‑‑ammonia‑ligase] adenylyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (251/237); minor base T (1/0); total (252/237) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 490 total aligned reads displayed.
GCAGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATAAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGTTCG > NC_008463/5904931‑5905226 | cAGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAac > 1:10204560/1‑151 (MQ=255) aGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCTGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAaca > 2:11078528/1‑151 (MQ=255) aGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAaca > 1:1934729/1‑151 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |