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Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
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2:1132297/1‑235 AATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGC > 2:524341/1‑235 AATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGC > 1:296173/1‑235 AATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGC > 2:1473824/1‑235 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1:1140781/1‑235 AATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGC > 1:912433/1‑235 AATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGA < 1:938979/223‑1 TTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCAn > 1:709476/1‑234 TCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACT < 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TATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCG < 1:95520/235‑1 TATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCGCA < 2:1133720/235‑1 TATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCGCAAG < 1:1473824/235‑1 ATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCGCAAGA < 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ACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCGCAAGACACGAGGC > 2:1499411/1‑235 ACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCGCAAGACACGAGG > 2:187851/1‑234 ACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCGCAAGACA < 2:950680/229‑1 CCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCGCAAGACACGAGGCT < 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NC_007779/3750368‑3750590 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctaaAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCGCAAGACACGAGGCTACATTATTACAC > NC_007779/3751790‑3752022 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |