New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 1007857 = | 11 (0.060) | 212 (1.120) | 101/466 | 0.1 | 95.1% | coding (166/1110 nt) | ycbX | 6‑N‑hydroxylaminopurine resistance protein YcbX |
? | NC_007779 | 1105622 = | NA (NA) | intergenic (+88/+11) | csgC/Y75_RS05455 | curli assembly chaperone CsgC/IS3‑like element IS2 family transposase |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
GCATTATAGCTAATAAGCGCGTCATGTCATAAAGTTGAGGGCTTATTTTCATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1008088‑1007857 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTC > NC_007779/1105622‑1105855 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1:683670/235‑1 AATAAGCGCGTCATGTCATAAAGTTGAGGGCTTATTTTCATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCGTCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGAGGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCGTTATGATCACGGAACCTGACGGTGCGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTA < 2:1587928/235‑1 AATAAGCGCGTCATGTCATAAAGTTGAGGGCTTATTTTCATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTA < 1:1037393/235‑1 AGCGCGTCATGTCATAAAGTTGAGGGCTTATTTTCATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATT > 1:944433/1‑235 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GTCATGTCATAAAGTTGAGGGCTTATTTTCATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG > 1:356332/1‑235 TCATGTCATAAAGTTGAGGGCTTATTTTCATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA < 2:191917/235‑1 TCATGTCATAAAGTTGAGGGCTTATTTTCATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA < 2:1411671/235‑1 CATGTCATAAAGTTGAGGGCTTATTTTCATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC > 1:757223/1‑235 CATGTCATAAAGTTGAGGGCTTATTTTCATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC > 2:447383/1‑235 CATGTCATAAAGTTGAGGGCTTATTTTCATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACAGTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA < 2:1205830/234‑1 GTCATAAAGTTGAGGGCTTATTTTCATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC < 2:1723524/235‑1 TCATAAAGTTGAGGGCTTATTTTCATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCT < 2:757223/235‑1 ATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGC < 1:310591/235‑1 TGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATCTTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCG > 2:1129321/1‑235 GAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTACTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC > 2:281077/1‑235 ACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGA > 2:881986/1‑235 CGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGC < 2:1328124/220‑1 CGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGC > 1:1328124/1‑220 CGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCC > 2:1593947/1‑235 CGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAG > 1:331571/1‑227 CATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTG < 1:881986/235‑1 TTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC < 2:944433/235‑1 ATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAG < 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CATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATA > 1:498418/1‑235 TCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTC < 1:814368/235‑1 TCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTC < 2:1365055/235‑1 TCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTC < 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1:858334/235‑1 CTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA > 1:731423/1‑235 CTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA > 1:58264/1‑235 CTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA > 2:579978/1‑235 CTGGCAGATGTCAGTGGGCTGGCCTTCGATCGCATTTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGCTTCCCCAGATGGTCCTGGTGTTGCCCCTATATTTCCAGACCTCTGCTCTCACTCAACCCATTACAGGCCCGCCGCCGCAGATATCCCCGTCCCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCAGTCGTTATACTGCCCGAACGCCTCGGCA > 2:1794427/1‑235 GGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAG < 1:941647/235‑1 CAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTC < 1:567425/218‑1 TGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTT < 1:1161368/235‑1 TGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTT < 1:1689640/235‑1 aaTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGnn > 1:113925/3‑233 AGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGnn > 1:470186/1‑233 TGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGC > 1:234864/1‑235 gcCTGGCCTCCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGACTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGCTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCCGCTATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGCTGCCATTCGTTATAATGCTCGCACGCCTCTGCAAGGTCCTTTGCTGCCG > 2:289089/3‑235 GTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGCTTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTCTGCGGATGCCATTCGTTCTAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCG > 2:372910/1‑235 TCGCATCTTTATGATCGGGGAACCTGACGGTACGTGTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACGGGATTTGCCCCTATATTGCCGGACATCTGTTATCGCTTAACCCATTACAAGCACGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGG < 2:545025/235‑1 TCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGG < 2:155942/235‑1 CGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGT > 2:879188/1‑235 CGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGT > 1:1732003/1‑235 CATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTT < 2:167200/235‑1 CATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTT < 1:1735933/235‑1 TCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCTGTCTGGTTTGG < 2:493375/235‑1 TCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGG < 1:1593947/235‑1 TCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGG < 1:156383/235‑1 TCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGG < 2:101187/235‑1 TCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGG < 2:234864/235‑1 TCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGG < 1:1420360/235‑1 CTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGG > 1:428067/1‑235 ATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATG < 2:20202/235‑1 ATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATG < 1:1181848/235‑1 TGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGA < 2:1434809/235‑1 TGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGA < 2:498418/235‑1 TCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATAC < 1:1087262/235‑1 ACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTA < 1:1631338/235‑1 GGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGn > 1:1012563/1‑234 TCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAA < 1:282560/235‑1 TCGCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAA < 1:793764/235‑1 GCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGn > 2:592025/1‑234 GCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGn > 2:365092/1‑234 GCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGn > 1:25581/1‑234 GCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGn > 2:122062/1‑234 GCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAA < 1:48721/233‑1 GCCAGTTTCCCCAGATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTC < 2:413339/228‑1 nATGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTATATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCC < 1:1514037/234‑1 TGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTC > 2:532038/1‑224 TGGTACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTC < 1:532038/224‑1 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTC < 2:1262409/235‑1 GCATTATAGCTAATAAGCGCGTCATGTCATAAAGTTGAGGGCTTATTTTCATTTGAGGACCGCACCGTGGCGACATTAATCCGGCTTTTTATTCATCCTGTTAAATCGATGCGCGGCATTGGTCTTACACATGCTCTGGCAGATGTCAGTGGTCTGGCCTTCGATCGCATCTTTATGATCACGGAACCTGACGGTACGTTTATTACCGCTCGCCAGTTTCCCCAGATGGTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1008088‑1007857 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTC > NC_007779/1105622‑1105855 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |