Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 3,777,754 | 0 | A | C | 37.0% | 78.8 / 29.2 | 93 | pseudogene (943/1617 nt) | Y75_RS18735 | PTS sugar transporter subunit IIB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/6); new base C (6/28); total (58/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.11e-12 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.33e-02 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
TTATCTTTGGTCCGGCAGCTGTTGAAGGCGGCATTCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑CCCG‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCACGCGGATATGATGCTGACCCAAATCGCC > NC_007779/3777527‑3777984 | ttATCTTTGGTCCGGCAGCTGTTGAAGGCGGCATTCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCCTTGTGGTT‑CCCC‑CCACCCT‑A‑A‑c > 1:1478412/1‑235 (MQ=255) tttCTGTGGCCCGGCGGCTGTGGAGGGCGGTATGCAGTTGTGCGGGGGGCAGCTTGTGCAAGAGTTCAGTTGGAGCGCGGGGCCGCTGAAATCGTTTTCCCC‑GGAAGGCGT‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTAAAAAA‑TTTTTGGTGCCGGGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAAGC‑GGGTAAAG‑GTGGCGGGTTTGCTGATT‑CCCG‑CAACCTT‑A‑A‑cc < 2:524632/233‑1 (MQ=255) gcccGGCGGCGGTGGAGGGGGGCTTTCAGTGGTCGGGGGCGGATCATCTGAAAGAGTTCGGTTGGAGCGCCGGGCCGCGGAAATCGTTGTCCCG‑GGAGGGGGT‑TTTTGCCCGGCAGGGTAACTAAAAAA‑TCTTTGGGGCGGGGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAAGC‑GGGAAAAG‑GTGGGGGGCTTGCTGATT‑CCCG‑CACCCTT‑A‑A‑CCGCCATGCt < 2:566779/233‑1 (MQ=255) tCCGGCAGCTGTTGAAGGCGGCATTCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTTGTT‑TCCC‑CAACCTT‑a‑aaccccccgccg > 1:1117723/1‑224 (MQ=255) tCCGGCAGCTGTTGAAGGCGGCATTCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCCTGCTGTTT‑TCCC‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCCTGcgg > 1:258284/1‑233 (MQ=255) cGGCAGCTGTTGAAGGCGGCATTCAGATGTACTGGGCGCAGCATTTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGGTT‑TCCG‑CAACCCT‑T‑A‑ACGCCATGCtggg > 1:524632/1‑234 (MQ=255) cGGCAGCTGTTGAAGGCGGCATTCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGGTT‑TCCG‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCATGCtggt > 1:291073/1‑235 (MQ=255) cGGCAGCTGTTGAAGGCGGCATTCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCGTGGTGGTT‑CCCG‑CCACCCT‑C‑A‑CCGCCCTgactgg > 2:879100/1‑230 (MQ=255) cGGCAGCTGTTGAAGGCGGCATTCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCCTCCTGCCT‑CCCC‑CCACCCT‑A‑A‑Ccccccacacggt > 2:274014/1‑227 (MQ=255) gAAGGCGGCATTCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTTCGGCTT‑GCCG‑CCCCCCT‑A‑A‑CCGCCAAGCCGGTGGGGAGTAccc > 2:819232/1‑234 (MQ=255) gAAGGCGGCATTCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑TCCG‑CCACCCT‑A‑A‑ACGCCCTGCTGGTGGGGATTATCg > 1:1489898/1‑235 (MQ=255) tCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGGTTTCTGATT‑CCCG‑CAACCCT‑A‑A‑ACGCCATGCTGGTGGGGAATACCG‑AACCG‑CCggca > 1:358068/1‑233 (MQ=255) tCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGGTTGCTGATT‑CCCG‑CAACCCT‑A‑A‑CCGCCAAGCTGGGGGGGATTAACG‑AAACG‑CTGGaa > 1:426632/1‑235 (MQ=255) tCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑CCCG‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGGATTACCG‑AACCG‑CTggga > 1:125335/1‑233 (MQ=255) tCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCGTTCTGATT‑CCCC‑CACCCCT‑C‑A‑ACGCCCTGCCGGTGGGGAGTAACC‑AACCG‑CTGGaa > 2:1462120/1‑235 (MQ=255) tGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTTCTGATT‑CCCG‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGGGGGGATTACCG‑AACCG‑CTGGGATTTACCTTcn > 1:646705/1‑234 (MQ=255) tGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGGTT‑TCCG‑CACCCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGGGGGGATTACCG‑AACCG‑CTGGGATTTACCTTcn > 1:1579301/1‑234 (MQ=255) ggCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGGTT‑TCCG‑CAACCCT‑A‑A‑CCGCCCTGCCTGTGGGGAATACCG‑AACCC‑CTGGAATTTTACTTcnnn > 1:1724218/1‑232 (MQ=255) ggCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑CCCC‑CCACCTT‑T‑A‑CCGCCCTGCCGGGGGGGATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTaacctcnnn > 1:1256423/1‑227 (MQ=255) gcagcaTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTTATT‑CCCC‑CCACCTT‑A‑A‑CCCCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTTGAATTTTCCTTCC‑CG‑TTc > 1:410749/1‑235 (MQ=255) gcagcaTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGGTT‑TCCC‑CCACCCT‑T‑A‑CCGCCCTGCTGGGGGGGATTACCG‑CACCG‑CTGGAATTTTCCTTCC‑TG‑TTc > 1:1804463/1‑235 (MQ=255) gcagcaTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑TCCG‑CCACCTT‑A‑A‑CACCCCTGCTGGGGGGGGTTAACG‑AACCG‑CTGGGATTTACCTTCC‑TG‑TTc > 1:214930/1‑235 (MQ=255) gcagcaTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑CCCG‑CAAACCT‑A‑A‑CCGCCCTGCTGGTGGGGAATACCC‑GACCG‑CCGGGAATTACCTTCC‑Tggtt > 1:1846822/1‑232 (MQ=255) gcagcaTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTCGCTTGTT‑CCCC‑CCACCTT‑A‑A‑ACGCCAAGCTGGGGGGGAGTATCG‑CACCG‑CCGGGATTTTCCTTCC‑TG‑TTc > 1:827783/1‑235 (MQ=255) gcagcaTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCGTGCGGGTT‑TCCC‑CCACCTC‑T‑A‑CCGCCCTGCGGGGGGGGGTGACCG‑AACCC‑CCCGGATTTACCGTCC‑CG‑ttt > 2:720686/1‑234 (MQ=255) gcagcaTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCCTTCTTGTT‑CCCC‑CCACCCT‑C‑A‑CCCCCCCGCCTGTGGGGAGTTCCC‑AACCG‑CCGGACTTTACCCTCC‑Tgctt > 2:803549/1‑232 (MQ=255) agcaTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGGTTGCTGGTT‑CCCG‑CCACCTT‑T‑A‑CCCCCCTGGTGGGGGGGGTTTACG‑AACAGCCTGGAGTtt‑ccttccccgttct > 2:954687/1‑228 (MQ=255) agcaTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTTCTGGTT‑CCCG‑CCACCTT‑C‑A‑CCCCCACTCATGGGGGGATTACCT‑AACCG‑CTCGGATATTTCTTCC‑tctcttt > 2:1875899/1‑229 (MQ=255) agcaTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑CCCG‑CCACCCT‑A‑A‑CCGCCCCGCTGGTGGGGATTACCG‑CACCC‑CTGGGATTTACCTTccctcttat > 1:384215/1‑228 (MQ=255) agcaTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑CCCG‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGGATTACCG‑GAACG‑CTGGGATTTACCTTCC‑TG‑TTCAt > 1:1191872/1‑235 (MQ=255) agcaTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCCTCCCGATT‑CCCC‑CCCCCCT‑A‑C‑CCCCCCCTCTGGGGGGAATTACCG‑GACCC‑CTGGGCTTTTCCTTCC‑CG‑TTcct > 1:1295157/1‑233 (MQ=255) aTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTTATT‑CCCG‑CAACCTT‑A‑A‑ACGCCATGCTGGGGGGGATTACCG‑GACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑CG‑TTCAtttt > 1:1504507/1‑234 (MQ=255) aTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑TCCC‑CAACCCT‑A‑A‑ACGCCCTGCTGGTGGGGATTTACC‑AACCG‑CCGGAATTTTCCTTCC‑CG‑TTCCTTTc > 1:1744356/1‑235 (MQ=255) aTCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCGTGCTGATT‑CCCG‑CCACCCT‑A‑A‑CCGGCATGCTGGTGGGGATTACCG‑ACACG‑CCGGGAATTTCCTTCC‑Tgcttctttn > 2:1758876/1‑227 (MQ=255) cTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTTCTGATT‑CCCG‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTTCCTTCC‑TG‑TTCATTTCAc > 1:1628492/1‑235 (MQ=255) cTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGGTT‑TCCG‑CCAACTT‑T‑A‑CCGCCCAGCTGGGGGGGATTACCG‑GACCC‑CCGGGATTTACCTTCC‑TC‑tttcttttcc > 1:749567/1‑227 (MQ=255) cAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGTCCTGCTGATT‑CCCC‑CCACCCT‑A‑A‑CCGCCCTGCTGGTGGGGATTACCC‑AACCC‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCCCCgn > 1:1056205/1‑234 (MQ=255) cAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTTCTGATT‑TCCC‑CCACCCT‑A‑A‑CCTCCCTGCTGGTGGGGAGTACCC‑AACCG‑CCGGAATTTTCCTTTC‑TG‑TTTAttttttccn > 1:1628428/1‑229 (MQ=255) agagTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑TCCC‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCCTGCTGGGGGGGATTACCG‑AACCG‑CTGGGATTTTCCTTCC‑TG‑TTTATTTTACCGttt > 1:707524/1‑234 (MQ=255) tCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGGTTGGTGGTT‑TCCG‑CCACCCT‑A‑ACCCCCCACGC‑GGTGGGGATTAACG‑AACCG‑CCGGAAATTTCCTTCC‑CGTTTCTTTTCACCGTGGCGGt > 2:756270/1‑235 (MQ=255) tCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGGTTGCTGGTT‑TCCG‑CAACCCT‑A‑A‑ACCCCCCACTGGGGGGGAGTACCGCACCCC‑CCGGACTTTACCTCCC‑T‑‑TTCTTTTCACCGTTTGTGtt > 2:391888/1‑235 (MQ=255) tCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑CCCG‑CCAACCT‑A‑A‑CCCCCCTGCTGGTGGGGATTACCG‑AACCG‑CCGGGATTTACCCTCC‑TG‑TTCCTTTCACCGTTGCTGtt > 1:668621/1‑235 (MQ=255) aGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑CCCC‑CCACCCT‑A‑A‑CCGCCCTGCTGGTGGGGATTACCG‑GACCG‑CCGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTTCCCGTTGCTGtttt > 1:1690204/1‑234 (MQ=255) tttGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑CCCG‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCCTGCTGGGGGGGATTACCG‑AACCG‑CCGGGATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCCCCCTTGCTGTTTTCg > 1:385530/1‑235 (MQ=255) gAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGGTT‑CCCC‑CCACCCT‑A‑A‑CCGCCCTGCTGGTGGGGATTACCG‑AACCG‑CTGGGAGTTACCTTCC‑TC‑TTCCTTTCTCCGTTGCTGTTTGCGGTa > 1:948797/1‑235 (MQ=255) cgtgaaaaTGGTTGTCCCC‑GGAGGGGGT‑TTTTCCCTTGGCGGGTAACTAAAAAA‑TC‑TTGGGGGCGTGGGGATTTTTTTTA‑GGGATTTCCTTCCCGGCCGC‑CCGGGAAAAC‑GGGTAAAAGGGGGGGGGTTTGCTGATT‑CCCG‑AACCCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCt < 1:1105624/230‑1 (MQ=255) cgctaaaTTGTTGGTCCGGGGAGGGGGG‑TTTCCCCCGGCACGGAACCTAAAAAT‑CCTTGGGTGCCGGGGGC‑‑TTTCTTTAGGCGATGTCCTTCCCTCCCCCACGGAAAAAGC‑GGGTAAAG‑GGGGGGGTCTTCCGGATC‑CCCG‑AATCCTT‑A‑C‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCt < 2:125335/231‑1 (MQ=255) ttgtcCCC‑GGAGGGCTG‑TTTGCCCCTGCTGGGTAACTCAAAAT‑TCTTTGGGGCCGTGGGCA‑TTTTTTGA‑GCGATGTTCTTCCCTGCCCCACGGAAAAAGG‑GGGAAAAG‑GGGGGGGGCTTGCTGTTC‑CCCG‑CAACCTA‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCaa < 2:1498772/235‑1 (MQ=255) tttgtcc‑GGGAGGCGG‑TTTTTCCCTCGCCGGTAAACCAAAAACTTTTTGGGCCCGGGGCCT‑TTTTTTTG‑GCGTTTTCCTCCCCGCCCGCCCCGGAAAATG‑GGGTAAAG‑GGGGGGGGTTTGCGGTTC‑CCCG‑CACCTTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCaa < 2:529732/230‑1 (MQ=255) tCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTTCTGATT‑CCCGCCAACCTA‑A‑A‑CC‑CCCTTCTGGGGGGGATTACCC‑AAACC‑CTGGGAATTACCTTCC‑TC‑TTTATTTTACCGTTTCTGTTTTCGGGGCACGCCCGGCTCGGGGCCCCCATGTc > 1:1826475/1‑235 (MQ=255) ccc‑GGGAGGGGGTTTTTCCCCGGCAGCGTAACAAAAAAG‑TTTTGGGGGCCGGGGGCT‑TTTCTTTA‑GCGGTGTCCTTCCCGCCCCCACCGGAAAGTG‑GGGAAAAG‑GGGGGGGGTTTGCTGATC‑CCCG‑CACCTTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTc < 2:384215/235‑1 (MQ=255) ggagggggtttttCCCCTCCTGGGTAACTAAAATG‑TGTTGGGGGCCGGGGGTT‑TTGTTTGA‑GGGATGTCCTCCACCCCCGCACCGGAAAATG‑GGGTAAGG‑GTGGCGGGCTTGCTGTTC‑CCCG‑CACCCTT‑A‑C‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGAcc < 2:824695/226‑1 (MQ=255) gtgtttttGCCCTGCGGGGTAACACAAATC‑TGTGGGGTGCGTGGGGCT‑TTTCTTTG‑GGGTTTTCTTTCACTGCCGCACGGGAAAGCC‑GGGAAAAG‑GGGGGGGGCTTGCTGTTT‑CCCG‑CACCTTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAAt < 2:1826475/231‑1 (MQ=255) ggttttcGCCCTGCACGTTAACTAAAAAT‑TCTTGGGTGCCGTGGGTT‑TTTTTGTA‑GCGTGGTACTCCACGCCCGCAGC‑GAAAAAG‑GGGTAAAAGGTGGGGGGTTGGCTTATC‑CCCG‑CACCTTT‑A‑C‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATg < 2:1726583/232‑1 (MQ=255) ttGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑ACCG‑CCACCCT‑A‑A‑ACCCCATGCCGGGGGGGGTTACCG‑AACCG‑CTGGGATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTTCCCGTTGCTGGTTGCGGGGCCCGCCGGGCTGGCGGCCTCCACGGCGACCGCAATGTAtcg > 2:675999/1‑234 (MQ=255) ccccgccccgTAACTCAAAAATTCTTGGGTGCCGTGGGCT‑TTTCTTTG‑GCGATGTCCTTCCCTCCCGCACCGAAAACTG‑GGGTAAAG‑GTGGCGGTTTCGCTGTTC‑CCCG‑CACCTTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATctct < 2:123192/226‑1 (MQ=255) gCACGGTAACAAAAAAT‑TCTTGGGTGCCGTGGGCT‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCCCGGCCGCACCGAAAAATC‑GGGTAAAA‑GGGGCGGGCTTGCTGATC‑CCCG‑CACCCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTtggt < 1:314224/235‑1 (MQ=255) ggTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTTCTGATT‑TCCG‑CCACCCT‑A‑A‑CCCCCCTGCTGGTGGGGGTTTCCC‑CACCG‑CCGGGATTTTTCTTCCTTG‑TTC‑TTTTTCCCTTTCTGTTTTCGGGTCACGCCCCGCGGGGCGCCCCCCTGTCGCACGCAATGTATTTCTTttgtgggg > 2:930582/1‑235 (MQ=255) ggTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCCTGCTGGTTCCCCC‑CAACCTA‑A‑A‑CC‑CCATGCTGGGGGGGATTACCG‑AACCC‑CTGGGATTTTACTTCC‑TG‑TTCATTTTACCCCTGCTGTTTTCGGGACACGCCGTGCTGGGGGCCTCAATGTCTACCGCAATGTATTTCTTttgtttgg > 1:1416150/1‑235 (MQ=255) cTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑CCCG‑CAACCCT‑A‑A‑CCGCCCTGCTGGGGGGGATTACCG‑AACCG‑CCGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGGACACGCCGCGCTGGCGGGCCCCATGTCGACCGTGAAGTATCTCTTTTGTGTGGTgggg > 1:123192/1‑234 (MQ=255) aaaaat‑TCTTGGGGGCGGGGGGCT‑TTTTTTTG‑GCGATGTCCTCCCCTCCCGCCCCGAAAAAGC‑GGGAAAAA‑GGGGGGGGTTTGCTGTTC‑CCCG‑CACCCTT‑A‑C‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCaa < 1:954687/234‑1 (MQ=255) aaaaa‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCGTGGTGATT‑CCCC‑CCACCCC‑A‑A‑CCCCCGTGGTAGTGGGGGCTACCC‑AGACG‑CCGGAATTTAACTTCC‑TG‑GTCCTTTCCCCGCTGCTGTTTGCGGTACACACCCTGCCGGCGGCCGCGATGGCTATCGTAATTTATCTCTTTGGTGTGGCGGGcgaa > 2:879503/1‑232 (MQ=255) ccTTTGGTGCGGGGGGCT‑TTTCTTTA‑GCGTGGTCCTCCCCTGCCGCACCGGAAAATG‑GGGTAAAG‑GGGGCGGGCTTGCTGATC‑CCCG‑CACCTTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATggg < 1:1720448/234‑1 (MQ=255) tGGTGCGGTGGGCT‑TTTTTTTA‑GCGATGTCCTCCCCGGCCGC‑CCGGAAAAAG‑GGGGAAAAGGGGGCGGGCTGGCTGATC‑CCCG‑CACCCTA‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGa < 1:317667/235‑1 (MQ=255) ggCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGGTTGCTGATT‑CCCG‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCCTGCTGGTGGGGATTACCG‑AACCG‑CTGGGATTTACCTTCC‑TG‑TTCCTTTTACCGCTGCTGTTTGCGGTACACGCCCGGCTTGCGGCCTCACTGTCGACCCGAATGTATTTCTTTGGTGTGGGGGGGGAGATGGGCGggggggtggttg > 2:399864/1‑227 (MQ=255) cGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGTTTTCTGATT‑CCCC‑CTCCCTT‑A‑A‑TCCCCATGCTTGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CCGGAATTTATCTCCC‑TT‑TTTCTTTTTCCCTTTCTGTTTTCGGTACTCCTCGTGCTTCCCGCCTCATTTTTGACCCTAATCTTTTTCTTTTTTCTGTTGGGCCACCTGGGCGGCGGGTTGTTTGTCTA‑GGtttttct > 2:829900/1‑232 (MQ=255) ctcgcccccccGAAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGTCCTTTCTCATC‑CCCC‑CACCCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGa < 2:1724218/226‑1 (MQ=255) gcgccACGGGAAAACC‑GGGTAAAA‑GTGGGGGGTTTGTTGATC‑CCCG‑CACCCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATcc < 1:1147488/231‑1 (MQ=255) cGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGGTTTCTTATT‑TCCG‑CCACCCT‑A‑A‑CCCCCCTGCTGGTGGGGGTTACCG‑AAACG‑CCGGGATTTTACCTCC‑TT‑TTCCTTTTACCCGTGCTTTTTTCGGGACAAGCCGGGCTGGCGGCCTCTATGTCGGCCCGCATGTATCTCTTTTGTGTGGGGGGGAGAAAGGGGGGGGGTCTGATTGGATAGGGTTTTCCGGCAAAAcggagcacg > 2:524496/1‑227 (MQ=255) cGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTTCTGGTT‑CCCG‑CCACCCT‑A‑A‑CCCCCCTGCTGGGGGGGATTACCG‑AACCG‑CCCGAATTTACCCTCC‑TG‑TTCCTTTCCCCGTTTCTGTTTTGGGGACACGCCCCGCTGGGGGCCCCCATTTCGGCCGGAATGTTTTCCTTTTGTGGGGTGGGGGACATCGGGGGGGGGCTGGTTGGATC‑AGTTTTACCGCAACACCGGATCCCg > 2:599898/1‑235 (MQ=255) cGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑TCCG‑CACCCTT‑A‑A‑ACCCCCTGCTGGTGGGGAATACCG‑CACCG‑CCGGAGTTTAACTTCC‑CG‑TTCATTTTACCGCTGCTTGTTGCGGGACACGCCGCGCTGGGGGCCTCTCTGTCGGCCGCGATGTGTCTCTTTTGTGTGGGGGGGGCCACGGGCGGGGGGCTGATTGTGTA‑GGTTTTTCCGCCCAACTGGAGcccc > 2:1561987/1‑234 (MQ=255) gccagggAAAATGGGGGTAAAG‑GGGGGGGGGTTGGTGA‑T‑CCCG‑GAACCTTGA‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCg < 1:188765/230‑1 (MQ=255) cACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑TCCC‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGGATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTTCCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTTCGGGACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATTTCTTTTGTGTGGGGGGGAAAATGGGCGGGGGGGTGATTGGCTA‑GGGTTTACCGCAAAACTGGATCCCgca > 1:1107839/1‑233 (MQ=255) ggaaaagg‑gggaaaag‑ggGGGGGGTTTGCTGTTC‑CCCG‑CACCCTG‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTc < 1:879100/235‑1 (MQ=255) gaaaaagggggAAAAA‑GTGGGGGCTTTGCGGTGC‑CCCG‑CACCCTA‑A‑C‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTc < 1:699303/227‑1 (MQ=255) c‑GGGTAAAG‑GTGGGGGCCTGCCTGGTC‑CCCC‑CCCCCTT‑A‑C‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAAcc < 1:1478914/235‑1 (MQ=255) c‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTCGGTGTTC‑CCCG‑CACCTTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAAcc < 2:1042793/235‑1 (MQ=255) c‑GGGAAAAG‑GTGGCGGGTTGGCTGATC‑CCCC‑CACCCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAAcc < 2:1690204/235‑1 (MQ=255) agggggaaagggTGGGGGGCTTCGTGATC‑CCGG‑CACCCTC‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCaa < 2:385530/224‑1 (MQ=255) ggggTAAAG‑GGGGGGGGTTTGCTACTT‑CCCG‑‑AACCTT‑A‑AGCCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAAcc < 2:827783/234‑1 (MQ=255) ggggTAAAA‑GTGGCGGGTTTGCTGATC‑CCCG‑CACCTTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAAcc < 1:274014/234‑1 (MQ=255) gtgTAAAG‑GGGGCGGGTTTGTTGTTT‑CCCG‑CACCCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCa < 2:958678/233‑1 (MQ=255) gggTAAAG‑GTGGCGGTTTTGCTCTCC‑CCCG‑CACCTTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCa < 2:1107839/235‑1 (MQ=255) gggTAAAAGGGGGGGGGCTTGCTGATT‑CCCG‑‑ACCCTT‑ACA‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAAcc < 2:1744356/235‑1 (MQ=255) aggTGGCGGGTTTGCGGA‑T‑CCCC‑CAACCCG‑A‑ACCCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCACGCGGa < 1:212739/233‑1 (MQ=255) ggact‑CCCG‑CACCCAA‑C‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCACGCGGATATGATGCTGACCCa < 2:749567/231‑1 (MQ=255) ggATC‑CCCG‑CACCCTA‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCACGCGGATATGATGCTGACCCa < 1:930582/234‑1 (MQ=255) cttatccccG‑CACCTTT‑A‑C‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCACGCGGATATGATGCTGAccc < 1:391888/229‑1 (MQ=255) ttttccccG‑CACCCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCACGCGGATATGATGCTGACCCa < 1:756270/230‑1 (MQ=255) ggttccccc‑CAACTTA‑A‑C‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCACGCGGATATGATGCTGACCCa < 2:30056/230‑1 (MQ=255) cG‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCACGCGGATATGATGCTGACCCAAATCGcc > 2:618821/1‑235 (MQ=255) cG‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCACGCGGATATGATGCTGACCCAAATCGcc > 2:471679/1‑235 (MQ=255) cG‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCACGCGGATATGATGCTGACCCAAATCGcc > 1:1822329/1‑235 (MQ=255) | TTATCTTTGGTCCGGCAGCTGTTGAAGGCGGCATTCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCC‑GGAAGGCGG‑TTTTGCCCTGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCA‑TTTCTTTA‑GCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAATC‑GGGTAAAA‑GTGGCGGGCTTGCTGATT‑CCCG‑CAACCTT‑A‑A‑CCGCCATGCTGGTGGGAATTACCG‑AACCG‑CTGGAATTTACCTTCC‑TG‑TTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACACGCCGTGCTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTA‑GGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCACGCGGATATGATGCTGACCCAAATCGCC > NC_007779/3777527‑3777984 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |