Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 3,974,713 | 0 | G | T | 40.4% | 251.5 / 81.2 | 152 | A37S (GCG→TCG) | gadX | acid resistance transcriptional activator GadX |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (17/73); new base T (61/0); total (79/73) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.07e-27 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
AACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTA > NC_007779/3974481‑3974944 | aCATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCgg > 1:622369/1‑235 (MQ=255) acacaTTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGGTTTTTTGGGTGC‑a > 1:734394/1‑235 (MQ=255) acaTTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑Ag > 1:1370904/1‑235 (MQ=255) ttATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCa < 1:1897043/235‑1 (MQ=255) atcatcCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GGCCTGGTTTTTTCGGGTGG‑A‑AG‑CCaaa > 1:1391911/1‑235 (MQ=255) atcatcCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCgg > 1:953753/1‑223 (MQ=255) atcatcCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCgg < 2:953753/223‑1 (MQ=255) atcatcCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCaaa < 1:551092/235‑1 (MQ=255) atcatcCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCaaa < 2:361001/235‑1 (MQ=255) atcatcCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGA‑TACCCCGTTTCTTCGGGTGC‑C‑AG‑CCgaa > 2:1444007/1‑235 (MQ=255) catcCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAAtt < 1:1324169/235‑1 (MQ=255) catcCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAAtt < 1:48634/235‑1 (MQ=255) catcCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAAtt < 1:121041/235‑1 (MQ=255) tGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGt < 1:353859/235‑1 (MQ=255) gTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACATTGTTTTTTTTGATGC‑A‑AG‑CCAAATTcacgta > 2:371281/1‑230 (MQ=255) gTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GAACTCGTGTTTGTGGGTGG‑A‑AG‑ACAAAATCGAgga > 2:830498/1‑233 (MQ=255) tctcCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTTCGGATGC‑A‑CG‑CCCAATTTGAGtcgc > 1:182078/1‑232 (MQ=255) tcCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GGCCTGGGTGTTTCTGGTGC‑A‑CG‑ACCAATTTGTGTTGATa > 2:1001314/1‑235 (MQ=255) tcCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GGCACGGTTTTTTTGGGTGCGA‑AC‑CCAAATCTAAGTAGAt > 2:974898/1‑235 (MQ=255) tcCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCCGGGTTTTTTGGGTGC‑A‑AA‑CCCAAATCGAGgagaga > 1:810663/1‑233 (MQ=255) ccGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGGTTTTTCGGGTGC‑A‑AG‑CCCAAATCTAATAGATAAg > 2:1324169/1‑235 (MQ=255) atttatCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGt < 2:1890464/235‑1 (MQ=255) tatCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTAtt < 1:974898/235‑1 (MQ=255) atTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATAGCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAg < 1:149365/235‑1 (MQ=255) agGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GGCCTGGGTTTTTGGGGTGC‑C‑AG‑CCAAATTTGAGTAGATAAGTGTGTTG‑GAAAATTTTTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTc > 1:1051138/1‑235 (MQ=255) cggcgTGCTGCAGTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCatta < 2:1492247/235‑1 (MQ=255) gCTACAGTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTtctc < 2:1242968/235‑1 (MQ=255) cATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GAACTTGGTTTTTCGGATGC‑A‑AG‑CCAAAATCGGGGAGATAAGTGTGTTG‑TAAATTTTTTATTCGTGTCAAGGGGCACGCTTTTATTATTTTTCCCGa > 1:285300/1‑235 (MQ=255) aaCAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCCGGGTTTTTTGGATGG‑A‑AG‑CCAAAATCGCGGAGAAAAGTGGGGTT‑GAAATTTTTTTTTTGTGTCAAGGGAAACGCCTTCCTTATTTTTccccacagtccag > 1:1902427/1‑225 (MQ=255) nnntAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAagga < 1:1829148/232‑1 (MQ=255) tAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTTTGGGTGC‑A‑AG‑CCAAATTTTAGTAGATAAATGTGTTG‑AAAATTTTTTATTTGTGTCAAGGGGCACGCTTTCATTATTTTTCCCGATGCTCAaggagga > 1:1606227/1‑235 (MQ=255) tAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTTGTGGTGC‑A‑AG‑CCAAATTTGTGTAGAAAAGAGGGTTG‑TTAAATTTTTTTTTTTGTCAATGGACACCCCTTCCTTTTTTCTCCCGATGTTCActgaggg > 2:1392631/1‑234 (MQ=255) tatGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GTCCTCGTTTTTGTGGATGG‑ACAC‑CCAAATTC‑AATAGATAAAGGTGTTGTAAAATTTTTTTTTC‑TGTTCAGGGACACCCCTTCATCATTTCTCTCCATGTTCTaggagggcgg > 2:125871/1‑231 (MQ=255) tatGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GTCCCCGTTTTTTCGGCTGC‑A‑AG‑CCACATTCTTGTAGATAAGTGTTTTG‑ATAATTTTTTATTCCTGTCAAGGGACACGCTTTTCTTATTTTTTCCCGTGCTCTAGGAGGAGGc > 1:85069/1‑235 (MQ=255) aTGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTTTGGGTGC‑A‑AG‑CCAAAATCGAATAGATAAATGTGGTG‑GAAATTTTTTTTTTGTTTTCAGGGACCCCCTTTCATTTTTTTTCCCCATTCTCCAGGAGGAGGGCTTAAAt > 2:1829148/1‑235 (MQ=255) tAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑TTCCCCGTTTTTGCGGGTGC‑A‑AG‑CCAAAATCGAGGTGATAAAGGTGTTG‑GAAATTTTGTTTTTCTGGCAAGGGGCCCCCGTTTCTTATTTTTTCCCGTGTTCCAAGAGGGGGGAGTAAATCtc > 2:1072503/1‑234 (MQ=255) tAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑TGCCCGGTTTTTTTGGGTGT‑C‑AG‑CCAAAATCTAGTAGATAAGTGTGTTG‑TAAATTTTTTTTTTTTGTTAAAGGGCACGCTTTCATTTTTTTTTCCGTTGCTCAAGGCGGGGGCATTAAATCtt > 2:476919/1‑235 (MQ=255) tAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GTCCCGGGTTTTTCTGATGT‑A‑AG‑TCCAAATCTTGTAGATAAGTGTGTTG‑TAAATTTTTTTTTCGTGTCAAGGGGCACGCTTTCATTTTTTTTCCCGCTGCTCATGGTGGTGGCATTAAAACtt > 2:234610/1‑235 (MQ=255) tAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGTGGGTGC‑A‑AG‑CCAAAATCGAGTAGATAAGGGTGTTG‑AAAATTTTTTTTTTGTTTCAAGGGGCACGCTTTTTTTATTTCTCCCGATTCTCCAGGAGGGGGGATTTAATCtt > 1:303823/1‑235 (MQ=255) tAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGGTTTTTCGGAGGG‑A‑AA‑CCAAAATTGAGTAGATAAAGGTGTTG‑GAAATTTTGTATTTGTGTCAAAGGACACGCTTTCATTTTTTTTTCCCATGCTCAAGGTGGGGGCGTTAAAACtt > 2:1512065/1‑235 (MQ=255) aaGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑TACCTGGTTTTTTCGGATGC‑A‑AG‑CCAAAATTGAGTAGATAAAGGTGTTG‑AAAATTTTTTTTTTGTGTCCACGGACAAGCCTTCATTTTTTTTTCCGCTGCTCAACGAGGAGGGATTAAATCTTCCTGcac > 2:1915783/1‑235 (MQ=255) ntCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACAt < 1:105506/234‑1 (MQ=255) aTGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAg < 1:1072503/235‑1 (MQ=255) tGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGt < 2:1356354/235‑1 (MQ=255) cTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCAt < 2:79438/235‑1 (MQ=255) cTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATACTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCAt < 1:1019442/235‑1 (MQ=255) aCATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCCGGGTTTTTTGGGTGC‑A‑AG‑CCAAAATCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑GAAATTTTTTATTTTTGTTAAAGGACACGCTTTTATTATTTTTTCCCATGCTCCAGGAGGGGGGATTTAATCTTCATTCACATAAAAAAAATTCTTCCttt > 1:1700824/1‑234 (MQ=255) tGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GAGCTGGGTTTTTTGGGTGT‑A‑AG‑ACAAAATTGTGGAGGTAAGTGTGTTG‑GAAATTTTTTTTTTGTGTTAAGGGAGAAGCTTTTATTATTTTTTCCGATGGTTAAGGAGGAGGGATTAAATTTTCATTCTAATAAAAAAGATTTTttattaatt > 2:633062/1‑232 (MQ=255) tGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTc < 2:622369/235‑1 (MQ=255) tGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GAACTGGTTTTTTCGGGTGC‑A‑AA‑CCAAAATCGAGTAGATAAATGTGTTG‑AAAATTTTTTTTTTGTGTCAAAGGACACGCTTTCATTATTTTTCCCCATGCTCAAGGAGGGGGCAGTAAATCTTCATTCACATAAAAAAAATTCTTCATTACTc > 1:1761606/1‑235 (MQ=255) gAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGtt < 2:1370904/235‑1 (MQ=255) gAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGtt < 2:298292/235‑1 (MQ=255) gAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGtt < 2:1528247/235‑1 (MQ=255) gAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGtt < 1:1918877/235‑1 (MQ=255) gAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGtt < 1:21802/235‑1 (MQ=255) gAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGtt < 1:1305653/235‑1 (MQ=255) gAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGtt < 2:98056/235‑1 (MQ=255) gAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGtt < 1:1001314/235‑1 (MQ=255) nnngTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTtca < 1:1839814/232‑1 (MQ=255) aTTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTtca < 1:507419/235‑1 (MQ=255) aTTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTtca < 1:386609/235‑1 (MQ=255) aTTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTtca < 1:1668187/235‑1 (MQ=255) aTTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTtca < 2:1723457/235‑1 (MQ=255) tCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGTGGACCGGGTTTTT‑TGGGTGC‑C‑AA‑CCAAAATTGAGTAGATAAATGTGTTG‑GAAAATTTTTTTTTGTGTTAAGGGACACGCCTTTATTTTTTTTTCCCATTCTCAAAGAGGGGGCATTAAAACTTCCTGCACATAAAAAAAATTTTTCATTACTCGTtcctcan > 2:990756/1‑234 (MQ=255) tCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GGACTGGTTTTTTTGGGTGG‑A‑AG‑CCCAAATTGAGTAGGTAAAGGTGTTT‑GAAATTTTTTTTTTTTGTCAAGGGACACGGCTTCATTATTTTTTCCCATGTTCAAGGAGGGGGGATTTAATATTCATTCACATAAAAAAACATCTTTATTACTCGTttattct > 2:1236300/1‑232 (MQ=255) tCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTTTGGGTTC‑A‑AG‑CCAAAATTGAGTAGATAAGTGGGTTG‑GAAATTTTTTTTTCTTGTCAAGGGAGCCGCCTTCATTTTTTTTTCCCGTGCTCAACGAGGGGGCATTAAATCTTCATTCACCTAAAAAAATTTCTTCATTTATCCTTTATCAc > 2:1058308/1‑235 (MQ=255) tCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTTTGGGTGC‑A‑AG‑CCAAAATTGAGTAGATAAATGTGTTG‑TAAATTTTTTTTTTGTGTCCAGGGACACGCTTTCATTATTTTTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGGATTAAATCTTCATTCACATAAAAAAAGTTCTTCATTACTCGTtcattcn > 2:386609/1‑232 (MQ=255) tAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCCGGGTTTTTCGGGTGC‑C‑AG‑CCAAAATTTCGAAGATAAGTGTGGTG‑TAAAATTTTTATTTCTGTCAAAGGGCACGCTTTCATTTTTTTTCCCCACGCTCCAGGAGGAGGGCTTAAAACTTCATGCACATAAAAAAAGTTCTTCCTTACTCCTTCTTCAcct > 2:460740/1‑233 (MQ=255) aaTTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTgt < 1:633062/235‑1 (MQ=255) cGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTTTGGAGGC‑A‑AA‑ACAAAATCTAGTAGATAAATGGGTTG‑GAAATTTTTTATTTTTGTCAAAGGGCACGCTTTCATTATTTTTTCCGCTTCTCCAAGAGGAGGCATTAAATCTTCATTCATATAAAAAAAATTTTTTTTTATTCGCTCATCACTGtcgtag > 2:1470606/1‑235 (MQ=255) aTGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGC‑GGCCTCGTTTTTTTGGGTGC‑A‑AG‑CCAAATTCGGGGAGATGAGGGGGGTG‑GAAATTTTGTTTTTGTGTCAAGGGGCACGCTGTTCTTATTTTTCCCCCTTCTCCAGGGGGAGGGAGTTAATCTTCATGTACATATAAAAATTTCTTCTTTTCTCCGTCTTCAcatttgttggga > 2:537638/1‑224 (MQ=255) gCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCCGGGTTTTTCGGATGG‑A‑AG‑CCAAAATTGAGGAGATAAGAGGGGTG‑AAAAATTTGTATTTGTGTCAAGGGGAACGCCTTCATTATTTCTCCCGATGGTCAAGGGGGAGGGAATAAAAATTCATGCAAATAAAAAAAATTTTTTATTACTCGTTTATTACTGTAGTAGAGata > 1:756111/1‑235 (MQ=255) aagtAAATATAGTCTCGCCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTC‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCt < 2:1614738/232‑1 (MQ=255) tctcACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCCGGGTTTTTCGGGTGC‑A‑AG‑CCAAAATCGAGGAGATAAATGTGTTG‑TAAATTTTTTATTTGTGTCAAGGGACACGCCTTCATTATTTTTCCCCCTGCTCCAGGAGGGGGCATTTAATCTTCATGCCCATAAAAAAATTTTTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTTTGGaa > 1:1072879/1‑235 (MQ=255) tctcACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCCCGGTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAACTCGTGGAGATAAAAGTGGTG‑GAAATTTTGTTTTCGTGTCAAGGGGAACGCCTTCCCTTTTTCTCCCCCTTCTCCACGAGGAGGCATTAAATTTTCATCCCCCTAAAAAAAGTTCTTCTCTATTCCTTCCTTACTGTAGTAGAGACATTCCTTctttttcgtga > 1:918795/1‑229 (MQ=255) tcACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCCGGGTTTTGCGGGTGG‑C‑AG‑GCAAAATTTAGGAGATAAAGGGGTTG‑GAAAATTTGTATTTGGGGGGAAGGAAAAGCTTTCATTATTTTTCCCGGAGGTCCAGGAGGAGGGCATAAAAATTCATGCACAAAAAAAAAATTTTTTCTTACTCGCTCATTCATGTAGAAGAGAAAATCCCGtgttttctgaagt > 2:928558/1‑227 (MQ=255) tcACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GAACTTGGTTTTTTGGATGC‑T‑AA‑CCAAAATCCAGTAGATAAGTGTTTTG‑CAAATTTTTTATTTTTGTCAAGGGACAAGCTTTCATTATTTTTCCCCGCGGTCTAGGGGGAGGCATTAAAACTTTATGCCCATAAAAAAAGTTCTTCATTTCTCGTTTCTCACTGTAGTAGAGATATTCCTTTTTTTCTGGAAGt > 1:1569800/1‑235 (MQ=255) cACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTCGTTTTTTCGGTCGC‑T‑AG‑TCAAAATTGAGTTGATAAGTGGGTTT‑AAAATTTTTTTTTTTTGTTAAGGGACACCGTTTTATTTTTTTTCCTGCATCCCTATGTGGAGGCATTAAATTATCTTCCTCAAAAAAAACATTCTTTCTTAATTGTTTATCACTGTTGTAAAGATATTTCTGTTTTTCAGGAAGtt > 2:1730508/1‑235 (MQ=255) ccATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GTCCCCGTTTTTTTCGCTGC‑A‑AC‑CCAAAATCTGGTAGCTAAGAGTGTTT‑GAAATTTTTTATTTGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTTTTTTTTCCCCTTCTCAAGGAGGAGGGGTTAAAACTTCTTTCACATAAAAAAGATTCTTCATTACTCGTTCTTCCCTGTAGGTGAGATATTCCTGTTTTTTATGAAGTTgg > 2:568719/1‑234 (MQ=255) ccATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTTCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGGAGATAAGGGGGTTG‑GAAATTTTTTATTCGTGTCAAGGGGCACCCTTTTATTTTTTTTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAATTTCTTCCTTACTCGTTCATCACTGTAGTTGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTgc > 1:1917357/1‑235 (MQ=255) aTGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GCCCCTGTTTTTTCGGGTGG‑T‑CGTCAAAATTCGA‑TAGATAATTGTGTTG‑GTAATTTTTTTTTCTTGTTAAGGGACACGCTTTCATTCTTTTTTCCGCTGTTCTAGGAGGAGGCATTAAATCTTCCTGCACATCAAAAAGATTTTTCATTATTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTTGTGTTTTTTAGGGAGTTgtgc > 2:470007/1‑235 (MQ=255) aTGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTTCGGATGC‑A‑AA‑CCAAAATTGAGGAGATAAGTGGGTTG‑AAAATTTTTTTTTTGTGTCAAGGGACACGCCTTCATTATTTTTCCCGATGCTCAAGGAGGGGGGATTAAAACTTCATGCACATAAAAAAGATTTTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGGAGAGATATTTCTGTTTTTTAGGAAGTTgtgc > 1:909782/1‑235 (MQ=255) aTGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGGTTTTTTGGGTGC‑A‑AG‑CCAAAATCTAGTAGATAAGGGTGTTT‑TAAATTTTTTATTCGTGTCCAGGGACCAGCTTTCTTTTTTTCTCCCGCTGCTCCAAGAGGGGGCATTAAATCTTCATGCCCATAAAAAAGATTCTTCATTACTTGTTCCTCACCGTTGTAGAGGTATTCCTGTTTTTCATGAAGTTgcgc > 1:229149/1‑235 (MQ=255) aTGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCCGGTTTTTTCGGATGC‑A‑AG‑CCAAAATCCAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTTTATTTGTGTCAAAGGACACGCTTTCCTTTTTTTTCCCGCTGCTCCAGGAGGGGGCATTAAATCTTCATTCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCCTTCCTCCCTGTCGTAGAGATATTTCTGTTTTTTAGGAAGTTgcgc > 1:1643626/1‑235 (MQ=255) aTGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCCGGGTTTTTCGGGGGC‑A‑AG‑CCAAAATTTTGTAGATAAGAGGGTTG‑GAAAATTTTTTTTTGTGTCAAGGGACACGCCTTCTTTATTTTTCCCGATGCTCAAGGAGGGGGCATTAAATATTCTTTCACATAAAAAAATTTTTTCCTTACTACTTTCTTACCAGAGTAGAGAATTTTCTTTTTTTTTGGAAGTTgcgc > 2:921431/1‑235 (MQ=255) tAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTa < 2:300289/235‑1 (MQ=255) tAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTa < 1:533090/235‑1 (MQ=255) tAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTa < 1:464660/235‑1 (MQ=255) tAATGGTGAATAGCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTa < 2:918795/235‑1 (MQ=255) aTGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATc < 2:421450/235‑1 (MQ=255) aTGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATc < 1:92807/235‑1 (MQ=255) cTATTTTAATGGCGGT‑GAACTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAAGTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAAt < 2:1837897/235‑1 (MQ=255) aTTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCt < 1:1495289/235‑1 (MQ=255) aTTATAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCt < 1:125871/235‑1 (MQ=255) ggT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAg < 1:460740/235‑1 (MQ=255) t‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGaa < 1:371281/235‑1 (MQ=255) t‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGaa < 2:164189/235‑1 (MQ=255) aCCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAAt < 1:928437/235‑1 (MQ=255) tttGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTa < 2:285300/235‑1 (MQ=255) tttGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTa < 2:1606227/235‑1 (MQ=255) | AACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GACCTGGTTTTTGCGGATGC‑A‑AG‑CCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTG‑AAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTA > NC_007779/3974481‑3974944 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |