| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002745 | 2070088 = | 213 (0.900) | 3 (0.010) | 3/462 | 12.6 | 1.1% | coding (152/219 nt) | SA_RS10520 | helix‑turn‑helix transcriptional regulator |
| ? | NC_002745 | 2604645 = | 348 (1.480) | coding (679/1044 nt) | SA_RS13305 | PTS fructose transporter subunit IIC | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCAAAAGAAAAACGATTATGTATAATAAAGTTATAAATTGATTGAGAAGTCAGTCAAAAACGAAGGAGGATTTTAATTATGACTATTTTAGCGAATACTAGAAAGTTTAAAGAAGCCATGTTCTTAAAAGGCTTTAATTTATCTGATTTATCACGTGAAACAGGTGTTGGAATTTCTTATTTAAGCCAAATTATTAATGGTAAAAAGATTCCAAGCCCTAAATTAGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002745/2070317‑2070088‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aATTTTCGGAATAAAATAAGGTTAACAAATGAGCTACCTGTACATGTTAGTGCTCCAATAGCCATAGGAACACCTGTCAGTCCTAATAAACTTGTTAATACCATTGAACTTAGCGGTGTCATACCTGTAACAGGAATCACTAGTCCTAAAATGACCGCTAATGCATATGGATTGTTATCACCTACCGCAGTGACAGCACTACCTATTTGTTTTAATGTTGCTAGCACACCAGGT > NC_002745/2604645‑2604877 GCAAAAGAAAAACGGTTATGTATAATAAAGTTATAAATTGATTGAGAAGTCAGTCAAAAACGAAGGAGGATTTTAATTATGACTATTTTAGCGAATACTAGAAAGTTTAAAGAAGCCATGTTCTTAAAAGGCTTTAATTTATCTGATTTATCACGTGAAACAGGTGTTGGAATTTCTTATTTAAGCCAATTTATTAATGGTAAAAAGCTTCCAAGCCCTAAATTAGGTAAAaaa > 2:1318302/1‑231 ATGTTCTTAAAAGGCTTTAATTTATCTGATTTATCACGTGAAACAGGTGTTGGAATTTCTTATTTAAGCCAAATTATTAATGGTAAAAAGATTCCAAGCCCTAAATTAGCTAAATTTTCGGAATAAAATAAGGTTAACAAATGAGCTACCTGTACATGTTAGTGCTCCAATAGCCATAGGAACACCTGTCAGTCCTAATAAACTTGTTAATACCATTGAACT < 1:952686/222‑1 ATGTTCTTAAAAGGCTTTAATTTATCTGATTTATCACGTGAAACAGGTGTTGGAATTTCTTATTTAAGCCAAATTATTAATGGTAAAAAGATTCCAAGCCCTAAATTAGCTAAATTTTCGGAATAAAATAAGGTTAACAAATGAGCTACCTGTACATGTTAGTGCTCCAATAGCCATAGGAACACCTGTCAGTCCTAATAAACTTGTTAATACCATTGAACT > 2:952686/1‑222 AATTTTCGGAATAAAATAAGGTTAACAAATGAGCTACCTGTACATGTTAGTGCTCCAATAGCCATAGGAACACCTGTCAGTCCTAATAAACTTGTTAATACCATTGAACTTAGCGGTGTCATACCTGTAACAGGAATCACTAGTCCTAAAATGACCGCTAATGCATATGGATTGTTATCACCTACCGCAGTGACAGCACTACCTATTTGTTTTAATGTTGCTAGCACACCAGGT > 1:1219582/1‑234 AATTTTCGGAATAAAATAAGGTTAACAAATGAGCTACCTGTACATGTTAGTGCTCCAATAGCCATAGGAACACCTGTCAGTCCTAATAAACTTGTTAATACCATTGAACTTAGCGGTGTCATACCTGTAACAGGAATCACTAGTCCTAAAATGACCGCTAATGCATATGGATTGTTATCACCTACCGCAGTGACAGCACTACCTATTTGTTTTAATGTTGCTAGCACACCAGGT > 1:35449/1‑234 AATTTTCGGAATAAAATAAGGTTAACAAATGAGCTACCTGTACATGTTAGTGCTCCAATAGCCATAGGAACACCTGTCAGTCCTAATAAACTTGTTAATACCATTGAACTTAGCGGTGTCATACCTGTAACAGGAATCACTAGTCCTAAAATGACCGCTAATGCATATGGATTGTTATCACCTACCGCAGTGACAGCACTACCTATTTGTTTTAATGTTGCTAGCACACCAGGT > 1:432853/1‑234 AATTTTCGGAATAAAATAAGGTTAACAAATGAGCTACCTGTACATGTTAGTGCTCCAATAGCCATAGGAACACCTGTCAGTCCTAATAAACTTGTTAATACCATTGAACTTAGCGGTGTCATACCTGTAACAGGAATCACTAGTCCTAAAATGACCGCTAATGCATATGGATTGTTATCACCTACCGCAGTGACAGCACTACCTATTTGTTTTAATGTTGCTAGCACACCAGGT < 1:529799/234‑1 AATTTTCGGAATAAAATAAGGTTAACAAATGAGCTACCTGTACATGTTAGTGCTCCAATAGCCATAGGAACACCTGTCAGTCCTAATAAACTTGTTAATACCATTGAACTTAGCGGTGTCATACCTGTAACAGGAATCACTAGTCCTAAAATGACCGCTAATGCATATGGATTGTTATCACCTACCGCAGTGACAGCACTACCTATTTGTTTTAATGTTGCTAGCACACCAGGT < 2:421459/234‑1 AATTTTCGGAATAAAATAAGGTTAACAAATGAGCTACCTGTACATGTTAGTGCTCCAATAGCCATAGGAACACCTGTCAGTCCTAATAAACTTGTTAATACCATTGAACTTAGCGGTGTCATACCTGTAACAGGAATCACTAGTCCTAAAATGACCGCTAATGCATATGGATTGTTATCACCTACCGCAGTGACAGCACTACCTATTTGTTTTAATGTTGCTAGCACACCAGGT < 2:518192/234‑1 AATTTTCGGAATAAAATAAGGTTAACAAATGAGCTACCTGTACATGTTAGTGCTCCAATAGCCATAGGAACACCTGTCAGTCCTAATAAACTTGTTAATACCATTGAACTTAGCGGTGTCATACCTGTAACAGGAATCACTAGTCCTAAAATGACCGCTAATGCATATGGATTGTTATCACCTACCGCAGTGACAGCACTACCTATTTGTTTTAATGTTGCTAGCACACCAGGT > 2:563863/1‑234 AATTTTCGGAATAAAATAAGGTTAACAAATGAGCTACCTGTACATGTTAGTGCTCCAATAGCCATAGGAACACCTGTCAGTCCTAATAAACTTGTTAATACCATTGAACTTAGCGGTGTCATACCTGTAACAGGAATCACTAGTCCTAAAATGACCGCTAATGCATATGGATTGTTATCACCTACCGCAGTGACAGCACTACCTATTTGTTTTAATGTTGCTAGCACACCAGGT < 2:860953/234‑1 AATTTTCGCAATAAAATATGGTTAACAAATGAGCTACCTGTACATGTTAGTGCTCCAATATCCATAGGAACACCTGTCAGTCCTAATAAACTTGTTAATACTATTGAACTTAGCGGTGTCATACCTGTTACAGGAATCACTAGTCCTAAAATGACCGCTAATGCATATGGATTGTTATCACCTACCGCAGTGACAGCACTACCTATTTGTTTTAATGTTGCTAGCACACCAGGT > 2:455404/1‑234 GCAAAAGAAAAACGATTATGTATAATAAAGTTATAAATTGATTGAGAAGTCAGTCAAAAACGAAGGAGGATTTTAATTATGACTATTTTAGCGAATACTAGAAAGTTTAAAGAAGCCATGTTCTTAAAAGGCTTTAATTTATCTGATTTATCACGTGAAACAGGTGTTGGAATTTCTTATTTAAGCCAAATTATTAATGGTAAAAAGATTCCAAGCCCTAAATTAGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002745/2070317‑2070088‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aATTTTCGGAATAAAATAAGGTTAACAAATGAGCTACCTGTACATGTTAGTGCTCCAATAGCCATAGGAACACCTGTCAGTCCTAATAAACTTGTTAATACCATTGAACTTAGCGGTGTCATACCTGTAACAGGAATCACTAGTCCTAAAATGACCGCTAATGCATATGGATTGTTATCACCTACCGCAGTGACAGCACTACCTATTTGTTTTAATGTTGCTAGCACACCAGGT > NC_002745/2604645‑2604877 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |