| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002745 | 2112505 = | 0 (0.000) | intergenic (‑353/+119) | SA_RS10720/SA_RS10725 | 23S ribosomal RNA/16S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
TTTTATAAGTCAAACGTTAACATGAAGTTACGTTCTTTTATAAAAAGATTTAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGTGTTCTTTCGAACACTAGCGATTATTTCTTATGAATTCAAGCTTATTTAAAACTCTTTATTCACTCGGTTTTGCTTGGTAAAATCTATATTTTACTTACTTATCTAGTTTTCAATGTACAATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTca‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002745/2112167‑2112399‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACGTTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTTCGACGGCTAGCTCCTAAAAGGTTACTCCACCGGCTTCGGG > NC_002745/2112505‑2112738 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AATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTT > 1:1376949/1‑234 AATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTT > 1:614332/1‑234 TTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTTCGACGGC < 1:1039633/234‑1 TTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTTCGACGGC < 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GCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTTCGACGGCTAGCTCCTAAAA > 2:393650/1‑234 TACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTTCGACGGCTAGCTCCTAAAAGGTTACT < 1:537983/234‑1 TATTTTCATACGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATACACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTCTCCCACCTTCGACGGCTAGCTCCTAAAAGGTTACTCCACCGGC > 2:591451/1‑234 TATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTTCGACGGCTAGCTCCTAAAAGGTTACTCCACCGGC > 2:776714/1‑234 TTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTTCGACGGCTAGCTCCTAAAAGGTTACTCCACCGGCTTC < 2:133432/234‑1 TTTTATAAGTCAAACGTTAACATGAAGTTACGTTCTTTTATAAAAAGATTTAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGTGTTCTTTCGAACACTAGCGATTATTTCTTATGAATTCAAGCTTATTTAAAACTCTTTATTCACTCGGTTTTGCTTGGTAAAATCTATATTTTACTTACTTATCTAGTTTTCAATGTACAATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTca‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002745/2112167‑2112399‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACGTTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTTCGACGGCTAGCTCCTAAAAGGTTACTCCACCGGCTTCGGG > NC_002745/2112505‑2112738 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |