| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002745 | = 2049577 | 204 (0.920) | pseudogene (7/831 nt) | sph | sphingomyelin phosphodiesterase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TAATCAATTTTGCATCTATTTTGTTGTAAGCTATATAAAAGGAGTGATAATGATGGTAAAAAAAACAAAATCCAATTCACTAAAAAAAGTTGCAACACTTGCATTAGCAAATTTATTATTAGTTGGTGCACTTACTGACAATAGTGCCAAAGCCGAATCTAAGAAAGATGATACTGATTTGAAGTTAGTTAGTCATAACGTTTATATGTTATCGACCGTTTTGTATCCAAACTGGAGACTTTTAACATAAAATTACTTATCATTCAAAAAGTAAAACAGCATAATATCAAGGTTTATAACTTTATCATTATCAATAATACCTCATATAAAATAAAATTTTAGGGACTTTTTAGGGACTTTAAATTTAAAATTACAAGTTTAATAGAAACATCAAAATAATCACATGTTTGTGTGGAATGTACACCCCAAAAGCTAGACTGAAAAATCTATTTTTT > NC_002745/2005100‑2005554 | tAATCAATTTTGCATCTATTTTGTTGTAAGCTATATAAAAGGAGTGATAATGATGGTAAAAAAAACAAAATCCAATTCACTAAAAAAAGTTGCAACACTTGCATTAGCAAATTTATTATTAGTTGGTGCACTTACTGACAATAGTGCCAAAGCCGAATCTAAGAAAGATGATACTGATTTGAAGTTAGTTAGTCATAACGTTTATATGTTATCGACCGTTTTGTATCCAAACTg < 2:260752/234‑1 (MQ=255)tAATCAATTTTGCATCTATTTTGTTGTAAGCTATATAAAAGGAGTGATAATGATGGTAAAAAAAACAAAATCCAATTCACTAAAAAAAGTTGCAACACTTGCATTAGCAAATTTATTATTAGTTGGTGCACTTACTGACAATAGTGCCAAAGCCGAATCTAAGAAAGATGATACTGATTTGAAGTTAGTTAGTCATAACGTTTATATGTTATCGACCGTTTTGTATCCAAACTg > 1:1431133/1‑234 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |