BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_002745	36,145	G→T	intergenic (+396/‑19)	SA_RS00275 → / → SA_RS00280	DUF3578 domain‑containing protein/hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_002745	36,145	0	G	T	100.0%	755.6 / NA	192	intergenic (+396/‑19)	SA_RS00275/SA_RS00280	DUF3578 domain‑containing protein/hypothetical protein
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                                                                                                                                                                                             aTTTGTTTTACAATGATGAAGATAATTAGTCTATCAAAATAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTcaca                                      >  1:909394/1‑234 (MQ=255)

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                                                                                                                                                                                                    ttACAATGATGAAGATAATTAGTCTATCAAAATAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCa                               >  2:596669/1‑234 (MQ=255)

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                                                                                                                                                                                                               aaGATCATTAGTCTATCAAAATAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACCATATCAATGATAATATAATCTATGTTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAaaataa                    >  2:420224/1‑234 (MQ=255)

                                                                                                                                                                                                               aaGATAATTAGTCTATCAAAATAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAaaataa                    >  1:136732/1‑234 (MQ=255)

                                                                                                                                                                                                               aaGATAATTAGTCTATCAAAATAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAaaataa                    >  1:1267007/1‑234 (MQ=255)

                                                                                                                                                                                                               aaGATAATTAGTCTATCAAAATAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAaaataa                    >  1:1009890/1‑234 (MQ=255)

                                                                                                                                                                                                                         gTCTATCAAAATAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAAAATAAATTGAAgaga          >  2:698278/1‑234 (MQ=255)

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                                                                                                                                                                                                                               cAAAATAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAAAATAAATTGAAGAGATTAttt    >  1:498173/1‑234 (MQ=255)

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                                                                                                                                                                                                                                 aaataaagGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAAAATAAATTGAAGAGATTATTTTc  >  1:576805/1‑234 (MQ=255)

AAAGAGCAGATAAGATAATGTGTAATAATCACAAAAAAGTTAAATATTTTAAGGCTTGTTTAATTATTAATGATTTTATATATAAAGAGCAGTATAATAAAGTTGTTAATATATTATGAATAATATTCAAGTAATTTTATTGTTTTTTAATTTGTCGATATTTAAGTTGAGTTAAATTTAAAGGGTGTAATTTGTTTTACAATGATGAAGATAATTAGTCTATCAAAAGAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAAAATAAATTGAAGAGATTATTTTC  >  NC_002745/35917‑36375

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 16 ≤` `ATCG/ATCG` `< 33 ≤` `ATCG/ATCG` `< 38 ≤` `ATCG/ATCG` `< 39 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`