| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_002745 | 46,963 | G→T | S26S (TCC→TCA) | mecA ← | PBP2a family beta‑lactam‑resistant peptidoglycan transpeptidase MecA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002745 | 46,963 | 0 | G | T | 99.1% | 861.2 / ‑5.4 | 215 | S26S (TCC→TCA) | mecA | PBP2a family beta‑lactam‑resistant peptidoglycan transpeptidase MecA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base T (99/114); total (99/116) | |||||||||||
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Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
AATTTTATATTGAGCATCTACTCGTTTTTTATTTTTAGATACTTTTTTTATTTTACGATCCTGAATGTTTATATCTTTAACGCCTAAACTATTATATATTTTTATCGGACGTTCAGTCATTTCTACTTCACCATTATCGCTTTTAGAAATATAACTGCTATCTTTATAAACTTGTTTGAAATTTTTATCTTCAATTGCATCAATAGTATTATTAATTTCTTTATCTTTGGAAGCATAAAAATATATACCAAACCCGACAACTACAACTATTAAAATAAGTGGAACAATTTTTATCTTTTTCATCAATATCCTCCTTATATAAGACTACATTTGTAGTATATTACAAATGTAGTATTTATGTCAAAATAATGTTATAATTTTTGTGATATGGAGGTGTAGAAGGTGTTATCATCTTTTTTAATGTTAAGTATAATCAGTTCATTGCTCACGATATGTGT > NC_002745/46735‑47192 | aaTTTTATATTGAGCATCTACTCGTTTTTTATTTTTAGATCCCTTTTTTATTTTACGATCCTGAATGTTTATATCTGTAACGCCTAAACTATTATATATGTTTATCGGACGTTCAGTCATTTCTCGTTCGCCGTTATCGCATTTAGAAATATAACTGCTATCTTTATAAACTTGTTTGAAATTTTTATCTTCACTTGCATCAATAGTATTATTAATTTCTTTACCCTGGGAAGc < 2:1204517/234‑1 (MQ=255) aTTTTATATTGAGCATCTACTCGTTTTTTATTTTTAGATACTTTTTTTATTTTACGATCCTGAATGTTTATATCTTTAACGACTAAACTATTATATATTTTTATCGGACGTTCAGTCATTTCTACTTCACCATTATCGCTTTTAGAAATATAACTGCTATCTTTATAAACTTGTTTGAAATTTTTATCTTCAATTGCATCAATAGTATTATTAATTTCTTTATCTTTTGAAGCa < 2:1367672/234‑1 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NC_002745/46735‑47192 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |