| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002745 | 2112505 = | 0 (0.000) | intergenic (‑353/+119) | SA_RS10720/SA_RS10725 | 23S ribosomal RNA/16S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
TTTTATAAGTCAAACGTTAACATGAAGTTACGTTCTTTTATAAAAAGATTTAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGTGTTCTTTCGAACACTAGCGATTATTTCTTATGAATTCAAGCTTATTTAAAACTCTTTATTCACTCGGTTTTGCTTGGTAAAATCTATATTTTACTTACTTATCTAGTTTTCAATGTACAATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTca‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002745/2112167‑2112399‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACGTTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTTCGACGGCTAGCTCCTAAAAGGTTACTCCACCGGCTTCG > NC_002745/2112505‑2112736 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1:1527525/1‑234 ACTCGGTTTTGCTTGGTAAAATCTATATTTTACTTACTTATCTAGTTTTCAATGTACAATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCC < 2:357453/234‑1 ACTCGGTTTTGCTTGGTAAAATCTATATTTTACTTACTTATCTAGTTTTCAATGTACAATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCC < 2:574591/234‑1 GGTTTTGCTTGGTAAAATCTATATTTTACTTACTTATCTAGTTTTCAATGTACAATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAC > 2:97793/1‑234 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TACTTACTTATCTAGTTTTCAATGTACAATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGA < 1:162063/234‑1 TTACTTATCTAGTTTTCAATGTACAATTTCTTTTTAGTTAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAATCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCTGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCAGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGAACCTTCAGATACGGCTACCTTGTTAGGACTT > 2:798/1‑234 TACTTATCTAGTTTTCAATGTACAATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTC > 2:1191579/1‑234 CTTATCTAGTTTTCAAGGTACAATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCAC < 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1:1030196/1‑234 AATGTACAATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTC > 2:1272545/1‑234 tATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTT > 2:1562628/2‑234 AATTTCTTTTTAGTCAAGCGCTCGCATACTGCTTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTT > 2:1384439/1‑234 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1:336686/234‑1 TTTATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTTCGACGGCTAGCTCCTAAAAGGTTACTCCACCG > 2:1514680/1‑234 TATTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTTCGACGGCTAGCTCCTAAAAGGTTACTCCACCGGC < 2:1030196/234‑1 TTTTCATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACATTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTTCGACGGCTAGCTCCTAAAAGGTTACTCCACCGGCTT < 1:208373/234‑1 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NC_002745/2112167‑2112399‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CATAAGCAATATCACTTTAACCAAAAAATATTTGAATGTTAAATAAACATTCAAAACTGAATACAATATGTCACGTTATTCCGCATCTTCTGAAGAAGATGTTCCGAATATATCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTTGTCCCACCTTCGACGGCTAGCTCCTAAAAGGTTACTCCACCGGCTTCG > NC_002745/2112505‑2112736 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |