| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002745 | 777410 = | 304 (1.130) | 16 (0.060) | 9/464 | 9.2 | 5.6% | intergenic (+399/+480) | SA_RS03870/SA_RS03880 | 5'‑3'‑deoxyribonucleotidase/diacylglycerol kinase family lipid kinase |
| ? | NC_002745 | 1066550 = | 240 (0.890) | intergenic (+64/+182) | SA_RS05320/SA_RS05325 | TrkA family potassium uptake protein/ribonuclease J | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
ATTTAGATATAAGAGCACAATATGGAATTAACATTATTGCAATTAAACGAGGCAAAGAGTTCATCATTTCACCAAATCCAAATATTAATTTAGAAATAGGTGATATTTTAATCATGATTGGACATGATAATGATTTAAATCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGTTACAAGCGCATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCAATATAACTTTGTAGAGCATTGAACATTGATTTATGTCTCAAGCTCATCATATATAAAGAAAAAGCTACTAACAATGGGTGGTGAGTTTAATTAAAACTTCACTTCAAAGTTAGTAGCTTTTTGATTATTTATTGTTTGATTCTTTTTGTTCGTTTACCTTCATAATGACTGGT > NC_002745/1066317‑1066780 | aTTTAGATATAAGAGCACAATATGGAATTAACATTATTGCAATTAAACGAGGCAAAGAGTTCATCATTTCACCAAATCCAAATATTAATTTAGAAATAGGTGATATTTTAATCATGATTGGACATGATAATGATTTAAATCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGtt < 2:1590455/234‑1 (MQ=255)aTTTAGATATAAGAGCACAATATGGAATTAACATTATTGCAATTAAACGAGGCAAAGAGTTCATCATTTCACCAAATCCAAATATTAATTTAGAAATAGGTGATATTTTAATCATGATTGGACATGATAATGATTTAAATCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGtt < 2:1364096/234‑1 (MQ=255) tAGATATAAGAGCACAATATGGAATTAACATTATTGCAATTAAACGAGGCAAAGAGTTCATCATTTCACCAAATCCAAATATTAATTTAGAAATAGGTGATATTTTAATCATGATTGGACATGATAATGATTTAAATCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGAc > 1:1423167/1‑234 (MQ=255) tAGATATAAGAGCACAATATGGAATTAACATTATTGCAATTAAACGAGGCAAAGAGTTCATCATTTCACCAAATCCAAATATTAATTTAGAAATAGGTGATATTTTAATCATGATTGGACATGATAATGATTTAAATCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGAc > 1:1696115/1‑234 (MQ=255) tAGATATAAGAGCACAATATGGAATTAACATTATTGCAATTAAACGAGGCAAAGAGTTCATCATTTCACCAAATCCAAATATTAATTTAGAAATAGGTGATATTTTAATCATGATTGGACATGATAATGATTTAAATCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGAc > 2:495440/1‑234 (MQ=255) tAGATATAAGAGCACAATATGGAATTAACATTATTGCAATTAAACGAGGCAAAGAGTTCATCATTTCACCAAATCCAAATATTAATTTAGAAATAGGTGATATTTTAATCATGATTGGACATGATAATGATTTAAATCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGAc > 1:671191/1‑234 (MQ=255) tAGATATAAGAGCACAATATGGAATTAACATTATTGCAATTAAACGAGGCAAAGAGTTCATCATTTCACCAAATCCAAATATTAATTTAGAAATAGGTGATATTTTAATCATGATTGGACATGATAATGATTTAAATCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTAGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGAc > 1:1294118/1‑234 (MQ=255) agCACAATATGGAATTAACATTATTGCAATTAAACGAGGCAAAGAGTTCATCATTTCACCAAATCCAAATATTAATTTAGAAATAGGTGATATTTTAATCATGATTGGACATGATAATGATTTAAATCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGtt < 1:1199809/221‑1 (MQ=255) agCACAATATGGAATTAACATTATTGCAATTAAACGAGGCAAAGAGTTCATCATTTCACCAAATCCAAATATTAATTTAGAAATAGGTGATATTTTAATCATGATTGGACATGATAATGATTTAAATCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGtt > 2:1199809/1‑221 (MQ=255) agCACAATATGGAATTAACATTATTGCAATTAAACGAGGCAAAGAGTTCATCATTTCACCAAATCCAAATATTAATTTAGAAATAGGTGATATTTTAATCATGATTGGACATGATAATGATTTAAATCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGACTAGAATTGaa > 2:1666609/1‑234 (MQ=255) aaTATGGAATTAACATTATTGCAATTAAACGAGGCAAAGAGTTCATCATTTCACCAAATCCAAATATTAATTTAGAAATAGGTGATATTTTAATCATGATTGGACATGATAATGATTTAAATCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGACTAGAATTGAAAAAAg > 2:1037891/1‑234 (MQ=255) ggAATTAACATTATTGCAATTAAACGAGGCAAAGAGTTCATCATTTCACCAAATCCAAATATTAATTTAGAAATAGGTGATATTTTGATCATGATTGGACATGATAATGATTTAAATCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGt < 2:112234/234‑1 (MQ=255) 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1:1530051/234‑1 (MQ=255) aaaTCGCATTGAAAAAAAGATTGCGACGAGAGAATCGGGAGTAGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGTTACAAGCGCATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCAATATAACTTTGTAGAGCATTGAACATTGATTTATGTCTCAAGCTCATCATATATAAAGAAAAGGCTACTAACAATGggt < 2:1236292/234‑1 (MQ=255) aTCGCTTTGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGTTACAAGCGCATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCAATATAACTTTGTAGAGCATTGAACATTGATTTATGTCTCAAGCTCATCATATATAAAGAAAAAGCTACTaa > 1:693466/1‑224 (MQ=255) tGAAAAAAATATTGCGACGAGATAATCGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGTTACAAGCGCATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCAATATAACTTTGTAGAGCATTGAACATTGATTTATGTCTCAAGCTCATCATATATAAAGAAAAAGCTACTAACAATGGGTGGTGAGttt > 2:110927/1‑234 (MQ=255) 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NC_002745/1066317‑1066780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |