Read alignment evidence... | |||||||||||
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.42e-05 | |||||||||||
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Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 451 total aligned reads displayed.
TTACTTTATCCATTTTCCTAACGTCAAAGGTGTTAAATCATACTCGCGTATAATTTCATTTCTTGGCTTACCATTTTCATATAATCTAACCATTTATAACTTAAACTCTGAACTAAATGTTCTTCTTTCTTAAATTAACAAAATCTACTCTCATAGAATTTGTCCAATTAGATGATATAATAGTAGAGTCGCCTATCTCTCAGGCGTCAATTTAGACGCAGAGAGGAGGTGTA‑TAAGGTGATGCTTATTTTCGTTCACATCATAGCACCAGTCATCAGTGGCTGTGCCATTGCGTTTTTTTCTTATTGGCTAAGTAGACG‑‑‑C‑A‑‑ATACAA‑‑AATAGGTGAC‑ATAT‑AGCC‑GCACCAATAAAAATCCCCTCACTACCGCAAATAGTGAGGGGATTGGTGTATAAGTAAATACTTATTTTCGTTATCTCAATTATACTGCTAATCTTTCTCTTTGTAAAATATGCAAGGTT > NC_002745/1856298‑1856762 | tAACGTCAAAGGTGTTAAATCATACTCGCGTATAATTTCATTTCTTGGCTTACCATTTTCATATAATCTAACCATTTATAACTTAAACTCTGAACTAAATGTTCTTCTTTCTTAAATTAACAAAATCTACTCTCATAGAATTTGTCCAATTAGATGATATAATAGTAGAGTCGCCTATCTCTCAGGCGTCAATTTAGACGCAGAGAGGAGGTGTA‑TAAGGTGATGCTTATTTTc < 2:1118850/234‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |