BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_002745	36,145	G→T	intergenic (+396/‑19)	SA_RS00275 → / → SA_RS00280	DUF3578 domain‑containing protein/hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_002745	36,145	0	G	T	100.0%	905.3 / NA	238	intergenic (+396/‑19)	SA_RS00275/SA_RS00280	DUF3578 domain‑containing protein/hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (121/117); total (121/117)

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aaaGAGCAGATAAGATAATGTGTAATAATCACAAAAAAGTTAAATATTTTAAGGCTTGTTTAATTATTAATGATTTTATATATAAAGAGCAGTATAATAAAGTTGTTAATATATTATGAATAATATTCAAGTAATTTTATTGTTTTTTAATTTGTCGATATTTAAGTTGAGTTAAATTTAAAGGGTGTAATTTGTTTTACAATGATGAAGATAATTAGTCTATCAAAATAAAgg                                                                                                                                                                                                                                   <  2:160907/234‑1 (MQ=255)

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                                                                                                                                                                                                                     aTTAGTCTATCAAAATAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCACTTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAAAATAAATTGaa              >  2:398734/1‑234 (MQ=255)

                                                                                                                                                                                                                         gTCTATCAAAATAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAAAATAAATTGAAgaga          >  1:1722022/1‑234 (MQ=255)

                                                                                                                                                                                                                         gTCTATCAAAATAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAAAATAAATTGAAgaga          >  1:170726/1‑234 (MQ=255)

                                                                                                                                                                                                                             aTCAAAATAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAAAATAAATTGAAGAGattat      <  2:967510/234‑1 (MQ=255)

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                                                                                                                                                                                                                                 aaataaagGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAAAATAAATTg                <  1:1013707/220‑1 (MQ=255)

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AAAGAGCAGATAAGATAATGTGTAATAATCACAAAAAAGTTAAATATTTTAAGGCTTGTTTAATTATTAATGATTTTATATATAAAGAGCAGTATAATAAAGTTGTTAATATATTATGAATAATATTCAAGTAATTTTATTGTTTTTTAATTTGTCGATATTTAAGTTGAGTTAAATTTAAAGGGTGTAATTTGTTTTACAATGATGAAGATAATTAGTCTATCAAAAGAAAGGGGTTGGGACTGTTATGAGTGATAATTTGTCATTATTCATTGACTATATCAATGATAATATAATCTATGGTAGTGAAATCAAACGGGAGAAATTAGAGAATTTATTTAATCAATTTGCTATAAAAAATGTTGAAAAGAACATTGTCTATGATGAACTGAAATCTTTAGATATTACAATCATTGAGTCACAGGATTCATATAAAAATAAATTGAAGAGATTATTTTC  >  NC_002745/35917‑36375

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 18 ≤` `ATCG/ATCG` `< 35 ≤` `ATCG/ATCG` `< 38 ≤` `ATCG/ATCG` `< 39 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`