| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,385,662 | C→G | 8.1% | intergenic (‑275/+155) | tldD ← / ← yhdP | putative peptidase/DUF3971‑AsmA2 domains protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,385,662 | 0 | C | G | 8.1% | 893.9 / 7.0 | 310 | intergenic (‑275/+155) | tldD/yhdP | putative peptidase/DUF3971‑AsmA2 domains protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (198/75); new base G (2/27); total (206/104) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.10e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
ATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCG > CP009273/3385513‑3385811 | cAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCTACCTACGGTTATGTTCCGt > 1:1701848/1‑150 (MQ=255) aGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGGTATGTTCGGtg > 2:1925889/1‑149 (MQ=255) ggCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGttt > 2:5233229/1‑150 (MQ=40) ggCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCATATCCGACCTACGGTTATGTTCCGtgt > 2:4296690/1‑148 (MQ=37) aaCGGCTGTCGGAGGGGGCGTAACCGCCTTATCCGACCTCGGGTTTTGTGCGG‑TTTGTAGGCCTTATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTa < 2:5087869/150‑1 (MQ=14) cGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTatg > 1:4450221/1‑148 (MQ=255) cGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAgg > 2:3756784/1‑150 (MQ=255) ggCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGGTATGTTCCGGTTGTAGGc > 1:4025556/1‑150 (MQ=255) ggCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGGTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTGTGAAGGc > 2:5238284/1‑150 (MQ=255) cTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTGTGTAGGCCt > 2:3473149/1‑150 (MQ=255) ggggtaTGGGGCGAAAACGCCTTACCCGACATA‑GGTTATGTTCCGTTTTGTAGGCCTGATAAGCCGCCCCGCGTCGCACCCGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGa < 2:1077539/145‑1 (MQ=11) cGGATGGGGCGTAAAGGCGTTAGCCGACCTACGGTTTTGTTCGG‑TTTGTAGGCCTGATATGACGCACCGGGTCGCATCTGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATa < 2:3447321/150‑1 (MQ=14) gtttGCGGCGTACACGCCTTATCCGACGTTGGGTTTTGTGCGT‑TTTGTTGGCTTTATACGCCGCACTGGGGCGCTTCCGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATaa < 1:3835794/147‑1 (MQ=14) ggATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATaa > 2:853342/1‑150 (MQ=255) gtggcggctAAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATACGCCGAACAGCGCCGAATCTGGAAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAg < 1:2609367/147‑1 (MQ=14) gATGCGGCGTAAACGCATTATCCGACCTACGTTTATGTTCGG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCTGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAg < 2:417948/150‑1 (MQ=255) ggcgTAAACGCCTGAGCCGACC‑AAGGTTTTGTTTCGTTTTGTTGGCCTTATAAGACGCACCGCGTCGCAACTGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGca < 2:2712905/150‑1 (MQ=11) cgTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGcaca > 2:1990321/1‑150 (MQ=255) gTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAg > 2:4722744/1‑150 (MQ=255) tAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTGTCTTTGCCTGATAAGACGCACAGc > 2:3168923/1‑150 (MQ=255) tAAACGCCTAATCCGACCTAGGTTTTTGTTCGT‑TTTGTAGGCCTTATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGc < 2:1817748/150‑1 (MQ=14) ggactaaTCCGACCTGGGGTTTTGTACGT‑TTTGTCGGCCTTATAACCCGCCCCGCGTCGCAACCGCCCACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCg < 1:1897454/144‑1 (MQ=11) gCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGc > 2:2108556/1‑150 (MQ=255) ccTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCa > 1:4053429/1‑150 (MQ=255) cTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCAt > 2:4031364/1‑150 (MQ=255) ttATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACCCACAGCGACGAATCAGGCAACGGCTGCCGGAAGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGATCCGTATCTAGACCTGATAAGACGCACATAGTCGCaac > 2:3578129/1‑148 (MQ=14) tATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCa > 2:1200029/1‑150 (MQ=40) tATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACCGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCa > 1:3374575/1‑150 (MQ=255) aTCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAg > 2:3071197/1‑150 (MQ=40) ccGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGc > 2:5021943/1‑150 (MQ=39) cGACCTAGTTTTATGTTCCT‑TTTTTCGCCATTATATGACGCACAGCTGCGCATCTGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCa < 2:1842618/150‑1 (MQ=11) cGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCa > 2:2597368/1‑150 (MQ=38) gcccTACGGTTATGTTCGG‑TTTTTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCaa < 2:3864534/148‑1 (MQ=16) cGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTg > 2:1475213/1‑150 (MQ=35) ttATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCg > 2:4248787/1‑150 (MQ=35) aTGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGa > 1:661940/1‑150 (MQ=35) ccG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATgcgg > 1:3056500/1‑150 (MQ=33) cG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATgcggc > 1:1111718/1‑150 (MQ=32) 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cATCGGCCACCGGCTGCCGTAGGGGGCGTAAACGCCTTACCCGACCTAGGTTTTTGTTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGAATCCGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTc < 2:2844217/150‑1 (MQ=11) ggCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCt > 1:1987827/1‑150 (MQ=40) ggCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCt > 2:4250581/1‑150 (MQ=40) ggCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCt > 2:1615670/1‑150 (MQ=40) ccacgggcggcCGGATGCGTCGTAAACGCCTTATCCGACCTCCGTTTATGTCCGGTTTTTCGGCCTTTTAAGACGCACAGGGTCGAATCAGCCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTc < 1:5237701/145‑1 (MQ=14) ccAACGGCTGCCGTATGCGGCGTAAACGCCTTATCCTACATAGTTTTATTTACCTTTTGTAGGCATTAAAAGACCCACAGCGTCGCAACAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTc < 2:4458278/149‑1 (MQ=14) cAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCg > 1:2962019/1‑150 (MQ=255) aaCGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGt > 1:5242552/1‑150 (MQ=255) cGGCTGCCGTCTGCGGCTTAACCCCATAATCCTCCGAACGTTTTTGTCCGGTTTTTAGGCCTTATAAGACCCACTGCTTCTCATCAGCCCACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTg < 1:786463/150‑1 (MQ=9) cGGCTGCCGGATGCGGCTTAACCGCATTATCCGACATCCGGTTATTTTCCGTTTGTAGGCCTTATAAGACGCACCGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTg < 2:3649318/150‑1 (MQ=14) 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aaaCGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTGATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATc > 2:790324/1‑150 (MQ=255) cGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGGTATGTTCTGGCTCGATGGCCTTTGGCAACGATTATccga > 2:574626/1‑148 (MQ=255) cGCCTTAGCCGACCTTGGTTTTTGTTCGGTTTTTAGGCATTATACGACCCACCGCGCCGCATCAGCCCACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTa < 1:3756784/150‑1 (MQ=18) gCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTAt > 1:2835091/1‑150 (MQ=255) ccTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATg > 1:181933/1‑150 (MQ=255) ccTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACCCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATg < 2:2901668/150‑1 (MQ=255) cTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATga > 2:3100503/1‑150 (MQ=255) ttATCCGACCTACGTTTTTGTTCCTTTTGTTGGCCTTATAAGACGCACCGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATgag < 2:232180/150‑1 (MQ=18) aTCCGACTTAGGTTTTTGTTCGGTTTGTAGGCCTGATACGCCGCCCAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGAt < 2:3661726/150‑1 (MQ=18) tCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGAtt > 2:630329/1‑150 (MQ=255) 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ccGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTCTGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTc > 2:1134164/1‑150 (MQ=255) ccGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTc > 1:2977853/1‑150 (MQ=255) | ATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCG > CP009273/3385513‑3385811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |