| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | CP009273 | 1,427,903 | IS3 (–) +3 bp | 21.6% | coding (27‑29/591 nt) | pinR ← | Rac prophage; putative site‑specific recombinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1089701 = | NA (NA) | 58 (0.260) | 42/276 | NT | NA | noncoding (1258/1258 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | CP009273 | = 1427905 | NA (NA) | coding (27/591 nt) | pinR | Rac prophage; putative site‑specific recombinase | |||||
| * | ? | CP009273 | = 1090958 | NA (NA) | 37 (0.170) | 27/276 | NT | 21.3% | noncoding (1/1258 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | CP009273 | 1427903 = | 134 (0.620) | coding (29/591 nt) | pinR | Rac prophage; putative site‑specific recombinase | |||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
AAGCAACCGGTTAAAACCAGGACGCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATGCAACCC > CP009273/1427761‑1428050 | agcttcagggcttcactgcgaaattcaggcgaatgctgtttacggggttttttactggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGAc < 2:126571‑M2/7‑1 (MQ=255) ttcagggcttcactgcgaaattcaggcgaatgctgtttacggggttttttactggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGt > 2:1505776‑M2/140‑149 (MQ=255) tcactgcgaaattcaggcgaatgctgtttacggggttttttactggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCaaaaa > 1:3722317‑M2/131‑149 (MQ=255) ccAGGACGCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCg > 1:2149016/1‑149 (MQ=31) aGGACGCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCgag < 1:1035020/149‑1 (MQ=32) ggtcGCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTACTGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAACCCTGCTCTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCgaga < 2:3277801/146‑1 (MQ=255) ggACGCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCgaga < 1:1927602/149‑1 (MQ=32) gCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAAACTGCACGTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGGTGATATCCGACAGTAAGCAAAAAATCGAGACaaa > 1:384033/1‑147 (MQ=255) caggcgaatgctgtttacggggttttttactggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGt < 2:1615298‑M2/32‑1 (MQ=255) aCTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTga < 1:2353955/149‑1 (MQ=32) ttGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGActc < 1:4179574/149‑1 (MQ=32) ttGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGActc > 2:3933722/1‑149 (MQ=32) tgctgcTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGActct < 2:3704640/149‑1 (MQ=32) tgctgcTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGActct < 1:1647022/149‑1 (MQ=32) tgctgcTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGActct < 2:2332301/149‑1 (MQ=32) tgctgAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCtata < 2:2498133/149‑1 (MQ=32) tgctgAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCtata < 2:2499475/149‑1 (MQ=32) aGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGaaa < 1:2559470/149‑1 (MQ=32) gCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAAt > 2:329279/1‑149 (MQ=32) gttttttactggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGgt < 2:1069193‑M2/53‑1 (MQ=255) cTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGgt > 2:1028158/1‑149 (MQ=32) cTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGgt < 2:1104749/149‑1 (MQ=32) cTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGgt < 1:3682316/149‑1 (MQ=32) cTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGgt < 1:3682315/149‑1 (MQ=32) tAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGgtg < 2:311182/149‑1 (MQ=32) aaTGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGgtgt < 2:1284788/149‑1 (MQ=32) aTGTGTTCGTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGtt < 1:2242809/149‑1 (MQ=17) tttactggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtc > 1:2873040‑M2/93‑149 (MQ=255) tttactggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtc < 1:647473‑M2/57‑1 (MQ=255) tttactggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtc < 1:2804555‑M2/57‑1 (MQ=255) tgtgTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtc < 1:2071823/149‑1 (MQ=32) gtgtTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtca < 2:443461/149‑1 (MQ=32) tcttcGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtcatatc < 1:2966306/149‑1 (MQ=32) tcttcGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACAAAGTTAGACTCTATACGAAATTGGTGTtcatatc > 1:250881/1‑149 (MQ=17) ggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtcatatca > 2:315299‑M2/87‑149 (MQ=255) ggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtcatatca > 2:1441833‑M2/87‑149 (MQ=255) cttcGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtcatatca < 2:1182619/149‑1 (MQ=32) cttcGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtcatatca < 2:2031112/149‑1 (MQ=32) gATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAAt < 1:1378939/149‑1 (MQ=32) ttattTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGc > 2:2558245/1‑149 (MQ=32) ttattTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGc > 1:2449458/1‑149 (MQ=32) tattTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCa > 2:3025690/1‑149 (MQ=32) tttGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATTCAtc > 1:3545883/1‑149 (MQ=17) tgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCAtc < 2:2041279‑M2/72‑1 (MQ=255) tgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCAtc < 1:215964‑M2/72‑1 (MQ=255) tGCAGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCAtctc < 2:3496704/149‑1 (MQ=17) gCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCa < 1:505892/149‑1 (MQ=32) gagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTa > 1:4264073‑M2/64‑149 (MQ=255) aTTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTa < 1:3923780/149‑1 (MQ=32) aTTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTa > 2:1694496/1‑149 (MQ=32) aTTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTa < 1:3923782/149‑1 (MQ=32) aTTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTa < 1:3244476/149‑1 (MQ=32) tttAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATg < 1:1930178/149‑1 (MQ=32) gtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATg > 1:727083‑M2/62‑149 (MQ=255) tAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAAAAATTATGat > 1:1555128/1‑149 (MQ=17) cctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGatta > 1:3317617‑M2/58‑149 (MQ=255) aaCCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTAGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATTCATCTCAGAAAATAATTATGattat > 1:95185/1‑149 (MQ=17) aCCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGattatt < 2:1217844/149‑1 (MQ=32) ctgactgagattttactcacttagcagcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAATCAAAAATTCGAGACATAGTTAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGTAAATAATTATGATTAttt < 2:1298560‑M2/95‑1 (MQ=255) ccTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTAttt > 2:2673436/1‑149 (MQ=32) tgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTAtttt > 1:3452963‑M2/54‑149 (MQ=255) actgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaAACCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGAATatttttt > 2:4091123‑M2/52‑148 (MQ=255) cTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGc > 1:1263418/1‑149 (MQ=32) ttCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCat < 1:4123829/149‑1 (MQ=32) ttCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCat > 2:2125214/1‑149 (MQ=32) ttCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCat > 2:2125781/1‑149 (MQ=32) tCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCata < 1:1584272/149‑1 (MQ=32) tCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCata < 1:1374709/149‑1 (MQ=32) cGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCatat < 1:305707/149‑1 (MQ=32) tttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATAtt < 2:3893924‑M2/106‑1 (MQ=255) gATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATAtt < 2:4016068/149‑1 (MQ=32) gATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATAtt < 2:2910620/149‑1 (MQ=32) gATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAACTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCGGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATAtt < 2:3769/149‑1 (MQ=17) ttCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTtgt < 1:1762490/149‑1 (MQ=32) tCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTtgta < 1:4084/149‑1 (MQ=32) cccGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTtgtat > 2:1892603/1‑149 (MQ=32) cccGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTtgtat < 2:829306/149‑1 (MQ=32) ggCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTtgtatgta < 2:600305/149‑1 (MQ=32) ggCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTtgtatgta < 2:600913/149‑1 (MQ=32) cGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTaca < 2:363566/149‑1 (MQ=32) gTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTacac < 2:2892111/149‑1 (MQ=32) gTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTacac < 2:1659949/149‑1 (MQ=32) ttGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACg > 1:1160184/1‑149 (MQ=32) ttGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACg > 2:2261117/1‑149 (MQ=32) tGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGt < 1:1601442/149‑1 (MQ=32) gATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGtt < 2:1066999/149‑1 (MQ=32) ggtggtCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAAt > 2:3775651/1‑149 (MQ=32) ggtggtCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAAt > 1:3355961/1‑149 (MQ=32) gtggtCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATa < 1:3638684/149‑1 (MQ=32) ggtCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATaaa < 2:4297934/149‑1 (MQ=32) gtCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAAc < 2:4058352/149‑1 (MQ=32) tgatgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGaa < 2:724198‑M2/134‑1 (MQ=255) gCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTAt > 2:926627/1‑149 (MQ=32) gCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTAt < 1:221624/149‑1 (MQ=32) gTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATGc > 2:1368376/1‑149 (MQ=32) agatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATGGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATGc < 1:1305218‑M2/143‑1 (MQ=255) agatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATGc > 1:1660956‑M2/7‑149 (MQ=255) ttGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATGCa > 1:1706657/1‑149 (MQ=32) tGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATGCaa < 1:3092103/149‑1 (MQ=32) tGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATGCaa < 1:3092683/149‑1 (MQ=32) | AAGCAACCGGTTAAAACCAGGACGCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATGCAACCC > CP009273/1427761‑1428050 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |