Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 572,364 | 0 | G | A | 20.1% | 505.5 / 112.0 | 209 | intergenic (‑83/‑490) | nmpC/essD | DLP12 prophage; truncated outer membrane porin (pseudogene);IS, phage, Tn; Phage or Prophage Related; outer membrane porin protein; locus of qsr prophage/DLP12 prophage; putative phage lysis protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (63/104); new base A (17/25); total (80/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.59e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |