| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 699,801 | G→T | 15.1% | P134P (CCG→CCT) | nagE → | fused N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme: IIC, IIB, and IIA components |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 699,801 | 0 | G | T | 15.1% | 796.3 / 93.1 | 249 | P134P (CCG→CCT) | nagE | fused N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme: IIC, IIB, and IIA components |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (118/93); new base T (15/23); total (133/116) | |||||||||||
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Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
AAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCT > CP009273/699652‑699950 | aaaGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCg > 2:2810636/1‑150 (MQ=255) aGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGAt > 1:1301423/1‑150 (MQ=255) gCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGAtt < 2:2028166/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |