| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 750,112 | A→T | 5.8% | intergenic (‑188/‑521) | gltA ← / → sdhC | citrate synthase/succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 750,112 | 0 | A | T | 5.8% | 829.7 / 29.6 | 234 | intergenic (‑188/‑521) | gltA/sdhC | citrate synthase/succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (103/117); new base T (6/8); total (109/125) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
GAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTT > CP009273/749963‑750261 | gAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTa < 2:305854/150‑1 (MQ=255) aCTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACt < 2:4493383/150‑1 (MQ=255) cTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACtt > 1:2256922/1‑150 (MQ=255) ttAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTa > 1:594033/1‑150 (MQ=255) aaTTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCa < 2:1884318/150‑1 (MQ=255) aTTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCaa > 2:2394458/1‑150 (MQ=255) tttGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAAt < 2:1255962/150‑1 (MQ=255) tGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATcc < 2:1373994/150‑1 (MQ=255) tCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAatt < 1:341249/150‑1 (MQ=255) tCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAatt < 2:3851072/150‑1 (MQ=255) tCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAatt < 1:161264/150‑1 (MQ=255) acaTCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAAttatta < 2:4487962/150‑1 (MQ=255) acaTCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAAttatta < 1:4372069/150‑1 (MQ=255) acaTCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAAttatta < 2:2955248/150‑1 (MQ=255) cAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACt > 1:210727/1‑150 (MQ=255) cTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTc < 2:4053304/150‑1 (MQ=255) tGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCt > 2:1695825/1‑150 (MQ=255) tGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCt < 2:2247879/150‑1 (MQ=255) ggCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTa > 1:757398/1‑150 (MQ=255) ggCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTa > 1:3764890/1‑150 (MQ=255) ggCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCACTGTGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGAAGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGAAATCCGAATTATTAAACTAGTCTa > 1:3338723/1‑150 (MQ=255) cTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATAAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTAcc > 2:1697684/1‑150 (MQ=255) tACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACt > 2:2029697/1‑150 (MQ=255) cccGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACtaa > 2:1827802/1‑150 (MQ=255) cGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACtaata < 1:2353872/150‑1 (MQ=255) ttttttATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAAc > 1:4009400/1‑150 (MQ=255) tttttATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGGATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACt < 1:3782257/150‑1 (MQ=255) ttATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTc < 2:4468302/150‑1 (MQ=255) aTTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTccc > 1:1110350/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCgaatgaa < 1:679870/150‑1 (MQ=255) cgccgcTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGACTTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCgaatgaat > 2:2972768/1‑150 (MQ=255) cgccgcTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCgaatgaat > 2:709429/1‑150 (MQ=255) ccgcTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTg < 1:682866/150‑1 (MQ=255) ctctGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTc < 1:4022646/150‑1 (MQ=255) ctctGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTc < 1:1204980/150‑1 (MQ=255) ctctGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTc > 2:3325372/1‑150 (MQ=255) ctctGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTc > 2:2145719/1‑150 (MQ=255) tctGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCa > 2:2189557/1‑150 (MQ=255) tgtgAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAGCTGTCCCGAATGAATTGGTCAAt > 1:487101/1‑150 (MQ=255) tgAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATAc < 1:1825764/150‑1 (MQ=255) gAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGACTGAATTGGTCAATACt > 2:3836106/1‑150 (MQ=255) gAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACt < 2:235201/150‑1 (MQ=255) aaaGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACtt < 1:3418646/150‑1 (MQ=255) agagGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTcc > 1:2662854/1‑150 (MQ=255) agGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTTCTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCTAATGAATTGGTCTATACTTCcac < 2:2569439/150‑1 (MQ=255) aaaCCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGtt > 2:173060/1‑150 (MQ=255) aaCCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTa < 1:2283914/150‑1 (MQ=255) tGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATa < 2:594033/150‑1 (MQ=255) tGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATa > 2:4223594/1‑150 (MQ=255) tGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATa > 1:3067625/1‑150 (MQ=255) gggTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATaa < 2:4399544/150‑1 (MQ=255) gggTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATaa < 2:3665120/150‑1 (MQ=255) taaCAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATAAATAGATGACGAATAAAAGGCGAAACAAGAAATTAGCAATCAGAATAAATAAACTTGTCTAAAACTAAAAACTGTAACTAATGAATTGGTCAATACTTACAAACTGTTACATaata > 2:2010163/3‑148 (MQ=255) cAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTaa > 1:1060980/1‑150 (MQ=255) agagCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAAt > 1:3113967/1‑150 (MQ=255) agCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCt > 1:4264737/1‑150 (MQ=255) ctctGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTa > 1:2442024/1‑150 (MQ=255) ctctGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTa > 1:1935165/1‑150 (MQ=255) tctGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAg < 2:3555015/150‑1 (MQ=255) ctGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAgg < 1:1879544/150‑1 (MQ=255) gggCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTg < 2:3118027/150‑1 (MQ=255) gggCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTg < 2:1928628/150‑1 (MQ=255) cgcTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGaaa > 1:4487309/1‑150 (MQ=255) cgcTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGaaa > 1:1520887/1‑150 (MQ=255) cgcTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGaaa > 1:1521200/1‑150 (MQ=255) gcTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAAt > 2:2668564/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATAc < 2:426695/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATAc < 1:1681767/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATAcc > 2:4300360/1‑150 (MQ=255) ttAAAGGATCCATTGATGACGAATTAATGGAGAATCAAGTAATTATCAATCCGAATTATTAAAATTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACtt < 2:2736490/149‑1 (MQ=255) aaGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCAt > 1:531892/1‑150 (MQ=255) ggATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATaa > 1:595073/1‑150 (MQ=255) gATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAAc > 2:4520489/1‑150 (MQ=255) gATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAAc < 2:1513071/150‑1 (MQ=255) ccATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACttt < 1:3372917/150‑1 (MQ=255) cATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACtttt > 1:3515312/1‑150 (MQ=255) cATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACtttt > 2:3068917/1‑150 (MQ=255) aTTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTa < 1:814000/150‑1 (MQ=255) aTTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTa > 2:3833427/1‑150 (MQ=255) aTTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTa < 1:1388377/150‑1 (MQ=255) tgatgaCGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACg < 2:4361022/150‑1 (MQ=255) tgaCGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCAt < 1:371819/150‑1 (MQ=255) tAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGc > 2:2284324/1‑150 (MQ=255) aaaTGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCt < 2:146591/150‑1 (MQ=255) aaTGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATTAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCtt < 2:2151418/150‑1 (MQ=255) aaTGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCtt < 2:1244565/150‑1 (MQ=255) aTGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCttt < 1:3970950/150‑1 (MQ=255) tGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCtttt < 2:107463/150‑1 (MQ=255) ggCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTc < 1:4211607/150‑1 (MQ=255) ggCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTc < 1:611664/150‑1 (MQ=255) gCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTcc < 1:887827/150‑1 (MQ=255) cGAATCAAGTTCTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCAGTATATGCTTTTCCt > 1:4296437/1‑150 (MQ=255) cGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCt < 2:4009400/150‑1 (MQ=255) cGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCt < 1:173060/150‑1 (MQ=255) cGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCt > 1:2600468/1‑150 (MQ=255) aTCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGt > 1:2531086/1‑150 (MQ=255) cAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTaa > 1:4175690/1‑150 (MQ=255) aGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATg < 2:3013064/150‑1 (MQ=255) tACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGtt > 2:2854197/1‑150 (MQ=255) tACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGtt < 1:1596251/150‑1 (MQ=255) | GAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTT > CP009273/749963‑750261 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |