Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 833,437 | G→A | 13.4% | intergenic (‑56/+209) | ybiJ ← / ← ybiI | DUF1471 family putative periplasmic protein/DksA‑type zinc finger protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 833,437 | 0 | G | A | 13.4% | 658.7 / 75.5 | 224 | intergenic (‑56/+209) | ybiJ/ybiI | DUF1471 family putative periplasmic protein/DksA‑type zinc finger protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (87/106); new base A (18/12); total (106/118) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
GTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTTATACCGCGTGGCAGTCACAGCAGCGTTAA > CP009273/833288‑833586 | tGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTAt > 1:4262724/1‑150 (MQ=255) tGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTAt > 1:459516/1‑150 (MQ=255) ggATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCa < 1:2202616/150‑1 (MQ=255) aTGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATAAGTATCACg < 2:79962/150‑1 (MQ=255) cGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑tttt < 2:4367975/150‑1 (MQ=255) cGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑tttt < 2:4209501/150‑1 (MQ=255) cGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑tttt > 1:1960359/1‑150 (MQ=255) gTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAACTGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑ttttt < 1:66575/150‑1 (MQ=255) gTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑ttttt < 1:3664748/150‑1 (MQ=255) gTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑ttttt < 1:2239680/150‑1 (MQ=255) ttACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑tttttt < 1:1233573/150‑1 (MQ=255) ttACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATAAAG‑tttttt > 2:4418084/1‑150 (MQ=255) tACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑ttttttt < 2:4203154/150‑1 (MQ=255) tACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑ttttttt > 2:2720547/1‑150 (MQ=255) aCCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATAAGTATCACG‑TTTTTTTa > 1:1197956/1‑150 (MQ=255) ggTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACga > 2:3396245/1‑150 (MQ=255) ggTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACga > 1:1309806/1‑150 (MQ=255) ccgccgCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACgagaga < 1:1763577/150‑1 (MQ=255) gccgcGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATa < 2:3328662/150‑1 (MQ=255) gccgcGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATa < 1:789995/150‑1 (MQ=255) gccgcGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATa < 2:92727/150‑1 (MQ=255) ccgcGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATaa < 1:3290475/150‑1 (MQ=255) cgAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAAt < 2:1652399/150‑1 (MQ=255) acGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAag < 2:1064138/150‑1 (MQ=255) cGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAaga > 2:1368790/1‑150 (MQ=255) cGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATAAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAaga < 1:874305/150‑1 (MQ=255) cAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGaa < 1:1375019/150‑1 (MQ=255) cAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGaa < 1:2033768/150‑1 (MQ=255) cAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGaa < 1:4038226/150‑1 (MQ=255) aaTGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAAtt > 1:4283161/1‑150 (MQ=255) aaTGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAAtt > 1:2324660/1‑150 (MQ=255) tGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGa > 2:2603213/1‑150 (MQ=255) tGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATAAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGa > 2:1678630/1‑150 (MQ=255) gACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATAAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGAc > 2:3906897/1‑150 (MQ=255) aCAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATAAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGAcc < 1:2538487/150‑1 (MQ=255) gTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCtt < 1:1104655/150‑1 (MQ=255) gTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCtt > 2:4306971/1‑150 (MQ=255) gAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGtt > 2:3831613/1‑150 (MQ=255) gCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCaaata < 1:510644/150‑1 (MQ=255) ccATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCaaataa > 2:1196436/1‑150 (MQ=255) ccATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCaaataa > 2:3924340/1‑150 (MQ=255) tAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAatt > 1:4180108/1‑150 (MQ=255) agcagcAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAattg < 2:550790/150‑1 (MQ=255) agcagcAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAattg < 1:3528155/150‑1 (MQ=255) caacaaCAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAAttgattga > 2:1707757/1‑150 (MQ=255) acaacaGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATtgattgat < 2:3750619/150‑1 (MQ=255) caacaGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGatat < 2:1700988/150‑1 (MQ=255) aacaGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATc > 2:3860114/1‑150 (MQ=255) aacaGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATc > 1:3839904/1‑150 (MQ=255) acaGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATc > 2:4060257/1‑150 (MQ=255) aGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTaa > 1:1899152/1‑150 (MQ=255) aGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCGTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTaa > 2:2020733/1‑150 (MQ=255) tATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAAcc > 1:3827236/1‑150 (MQ=255) aTTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCt < 2:2926592/150‑1 (MQ=255) tGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTAc > 1:575599/1‑150 (MQ=255) gATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACt < 1:3937013/150‑1 (MQ=255) tAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGa < 2:3680366/150‑1 (MQ=255) gTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATa > 2:4256734/1‑150 (MQ=255) gTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATa > 2:672138/1‑150 (MQ=255) ttttCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATaa < 2:4016858/150‑1 (MQ=255) tttCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATaaa > 1:4209654/1‑150 (MQ=255) ttCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAATAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAATTTGATTTATATCTATACTACTGATaaa > 2:2932259/1‑150 (MQ=255) ttCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATAAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAAc > 2:2267497/1‑150 (MQ=255) tCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAAcc > 2:4304764/1‑150 (MQ=255) tCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATAAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAAcc > 1:840247/1‑150 (MQ=255) cATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCa < 2:459516/150‑1 (MQ=255) aattaatCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCattt < 1:1522253/150‑1 (MQ=255) aattaatCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATAAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCattt < 2:498102/150‑1 (MQ=255) attaatCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCattt < 2:1659390/150‑1 (MQ=255) ttaatCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCatttat > 2:1209559/1‑150 (MQ=255) atCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATAAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATttg > 1:3592319/1‑150 (MQ=255) atCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATAAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATttg < 1:1380407/150‑1 (MQ=255) tctctcGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATttg > 2:4127733/1‑150 (MQ=255) tctctcGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGAGTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATttgt > 2:2610406/1‑150 (MQ=255) tctcGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATttgttg < 2:3310399/150‑1 (MQ=255) ctcGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATttgttg > 2:2074604/1‑150 (MQ=255) gCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACt < 1:3210236/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATAAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACt > 1:3534293/1‑150 (MQ=255) cAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACtt > 1:1947243/1‑150 (MQ=255) cAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACtt < 2:4171447/150‑1 (MQ=255) gTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATg > 1:957483/1‑150 (MQ=255) gTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATg > 1:2927254/1‑150 (MQ=255) tGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATAAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGa < 1:4348875/150‑1 (MQ=255) gATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGaa < 1:2030804/150‑1 (MQ=255) gATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGaa < 1:563720/150‑1 (MQ=255) aTTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAAc > 2:323205/1‑150 (MQ=255) tttttGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACt < 1:3396575/150‑1 (MQ=255) gTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGttt > 2:2851383/1‑150 (MQ=255) taAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTtat < 2:1913157/150‑1 (MQ=255) aaGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTtata < 1:2771932/150‑1 (MQ=255) gttgttTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTTATACCGCGTg < 1:3074264/150‑1 (MQ=255) gttTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTCCTGATAAACCATGTATTTGTTGTAGTTCTGTACGTGTTTTATAACGCGTGGCa > 2:2469961/1‑150 (MQ=255) tcgtcgATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTTATACCGCGTGGCAGTc < 1:684853/150‑1 (MQ=255) tcgtcgATGTGATAAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTTATACCGCGTGGCAGTc > 2:3520336/1‑150 (MQ=255) gtcgATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTTATACCGCGTGGCAGTcac > 2:280362/1‑150 (MQ=255) tcgATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTTATACCGCGTGGCAGTcaca > 1:1771853/1‑150 (MQ=255) tgtgATGAGTATCACGTTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTTATACCGCGTGGCAGTCAcagca > 1:719429/1‑150 (MQ=255) gatgaGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTTATACCGCGTGGCAGTCACAGCAGCGt > 1:2787436/1‑150 (MQ=255) gatgaGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTTATACCGCGTGGCAGTCACAGCAGCGt > 2:160004/1‑150 (MQ=255) gaGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTTATACCGCGTGGCAGTCACAGCAGCGTTaa < 2:2995823/150‑1 (MQ=255) | GTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCAAATGACAGAGTTGAAAGAGCCATAGCAGCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACG‑TTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTTATACCGCGTGGCAGTCACAGCAGCGTTAA > CP009273/833288‑833586 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |