Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 844,378 | 0 | C | A | 8.1% | 705.3 / 5.9 | 221 | intergenic (‑11/+288) | dps/rhtA | Fe‑binding and storage protein; stress‑inducible DNA‑binding protetin/threonine and homoserine efflux system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (85/106); new base A (27/2); total (113/108) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.80e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
AATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATGAGTTAGATATATTGATA > CP009273/844230‑844526 | aaTCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATcc < 2:871096/150‑1 (MQ=255) tCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCctc < 2:1650152/150‑1 (MQ=255) aagaaagaTCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTg < 2:4012743/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |