Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,169,335 | G→T | 18.8% | T29K (ACG→AAG) | mfd ← | transcription‑repair coupling factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,169,335 | 0 | G | T | 18.8% | 836.6 / 138.8 | 291 | T29K (ACG→AAG) | mfd | transcription‑repair coupling factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (129/107); new base T (27/28); total (156/135) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.58e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
GTAGGGAAGAGTTTCCCAGTCCGCCAGATTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGTTGTCAGATTCTCGTTAGGATATGCCTCAACATATGGGGGCATATCTCTGATAAGCAAT > CP009273/1169187‑1169484 | tAGGGAAGAGTTTCCCAGTCCGCCAGATTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCttt > 1:3396547/1‑150 (MQ=255) ggAAGAGTTTCCCAGTCCGCCAGATTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCTTTGca > 1:3802394/1‑150 (MQ=255) cAGTCCGCCAGATTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCg < 1:1589323/150‑1 (MQ=255) aGTCCGCCAGATTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCgg > 2:2294932/1‑150 (MQ=255) aGTCCGCCAGATTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCgg > 1:81522/1‑150 (MQ=255) aGTCCGCCAGATTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCgg > 1:638993/1‑150 (MQ=255) gTCCGCCAGATTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGt < 2:3654087/150‑1 (MQ=255) gCCAGATTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAAc > 1:1872607/1‑150 (MQ=255) gCCAGATTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAAc < 1:2271814/150‑1 (MQ=255) cAGATTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTc > 2:4397130/1‑150 (MQ=255) aGATTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCTTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCg < 2:3373460/150‑1 (MQ=255) aGATTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCg < 2:4010603/150‑1 (MQ=255) aTTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCTTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGcc < 1:1713907/150‑1 (MQ=255) aTTCATCACCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCTTTGCAAAGGCTGCGCCGGTTAACTCGcc < 1:1008386/150‑1 (MQ=255) tcatcaCCATTTGATCGGGAACCTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCca < 2:3462799/150‑1 (MQ=255) atcaCCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCcagc > 2:3604043/1‑150 (MQ=255) tcaCCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCTTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCcagca > 1:1959623/1‑150 (MQ=255) tcaCCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCcagca < 1:2653896/150‑1 (MQ=255) aCCATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCTTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGa > 1:4037342/1‑150 (MQ=255) ccATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGAc < 2:1893738/150‑1 (MQ=255) cATTTGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACg > 1:250439/1‑150 (MQ=255) tttGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACgct < 2:418472/150‑1 (MQ=255) tttGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACgct < 2:416001/150‑1 (MQ=255) tttGATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACgct < 2:2422645/150‑1 (MQ=255) gATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACgctgct > 2:2725065/1‑150 (MQ=255) gATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACgctgct < 2:4510274/150‑1 (MQ=255) gATCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACgctgct > 2:2382477/1‑150 (MQ=255) aTCGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTc > 2:603253/1‑150 (MQ=255) cGGTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCAc > 1:2074882/1‑150 (MQ=255) ggTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCAcc > 1:793065/1‑150 (MQ=255) ggTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCAcc > 1:960319/1‑150 (MQ=255) ggTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCAcc > 1:4170742/1‑150 (MQ=255) ggTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCAcc < 2:2184146/150‑1 (MQ=255) ggTAAACTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCAcc > 1:2697087/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCttt < 2:4534797/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCttt < 1:2525996/150‑1 (MQ=255) gCTGATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGAc < 1:945584/150‑1 (MQ=255) gATTTCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACggg > 2:3161515/1‑150 (MQ=255) tttCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCa < 1:2021122/150‑1 (MQ=255) tttCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCa < 1:88842/150‑1 (MQ=255) ttCATCATGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCTTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAg < 1:4436709/150‑1 (MQ=255) catcatGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCg > 1:319743/1‑150 (MQ=255) catcatGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCg > 1:296072/1‑150 (MQ=255) atGCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGtata > 2:3023687/1‑150 (MQ=255) gCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAAc < 2:1796204/150‑1 (MQ=255) gCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAAc < 2:1986273/150‑1 (MQ=255) gCAAACGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGATTTGACGGGCAGCGTATAAc < 1:2048697/150‑1 (MQ=255) aCGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGata < 2:2794865/150‑1 (MQ=255) cGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCACTTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGatat > 1:2354225/1‑150 (MQ=255) cGCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGatat < 2:2079602/150‑1 (MQ=255) gCAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATAtt > 2:1924214/1‑150 (MQ=255) cAGAGCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTg > 1:3053206/1‑150 (MQ=255) agagCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGt < 1:1311151/150‑1 (MQ=255) gagCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCTTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGtt < 1:2190720/150‑1 (MQ=255) agCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTc < 2:3371415/150‑1 (MQ=255) agCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTc < 1:3745237/150‑1 (MQ=255) gCATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCa < 2:493905/150‑1 (MQ=255) cATTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGTCAATTTCCGCTACCAGCTTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAg < 1:4375633/150‑1 (MQ=255) aTTTTGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAgg > 2:3937137/1‑150 (MQ=255) ttttGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGc < 2:2999446/150‑1 (MQ=255) tttGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCa < 2:1309851/150‑1 (MQ=255) tGCATATCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATa < 2:138793/150‑1 (MQ=255) tatCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACgg > 1:3131437/1‑150 (MQ=255) atCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGt > 2:97651/1‑150 (MQ=255) tCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACgggt < 1:64592/150‑3 (MQ=255) tCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGtt > 1:1087972/1‑150 (MQ=255) tCTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGtt > 1:694655/1‑150 (MQ=255) cTGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGTTg > 2:255089/1‑150 (MQ=255) tGGTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGTTGt > 1:1262298/1‑150 (MQ=255) ggTGCAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGTTGTc > 2:3227364/1‑150 (MQ=255) cAATGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGATAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGTTGTCAGAt > 2:377669/1‑150 (MQ=255) aaTGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGTTGTCAGAtt > 1:2883446/1‑150 (MQ=255) aTGAGTACCACCGGACCGGCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGTTGTCAGATtc > 2:74867/1‑150 (MQ=255) 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cggaccggCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCTTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGTTGTCAGATTCTCGTTAGGata > 2:108321/1‑150 (MQ=255) ggaccggCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGTTGTCAGATTCTCGTTAGGatat > 1:518354/1‑150 (MQ=255) accggCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGTTGTCAGATTCTCGTTAGGATATGc > 1:747527/1‑150 (MQ=255) accggCGTGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGTTGTCAGATTCTCGTTAGGATATGc < 1:1411038/150‑1 (MQ=255) tGACGTTCGGCAATTTCCGCTACCAGCGTTGCACAGGCTGCGCCGGTTAACTCGCCCAGCAGACGCTGCTCACCCGCTTTGACGGGCAGCGTATAACGATATTGTTCAGGCATAACGGTTGTCAGATTCTCGTTAGGATATGCCTCAACa > 1:1388573/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |