Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,194,194 | C→A | 9.5% | S15* (TCA→TAA) | lit → | e14 prophage; cell death peptidase, inhibitor of T4 late gene expression |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,194,194 | 0 | C | A | 9.5% | 568.6 / 31.4 | 163 | S15* (TCA→TAA) | lit | e14 prophage; cell death peptidase, inhibitor of T4 late gene expression |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (70/77); new base A (10/6); total (80/83) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
CATGTCGATAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAG > CP009273/1194045‑1194343 | cATGTCGATAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATtcatc < 1:628677/150‑1 (MQ=255) cGATAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCAt < 1:2507312/150‑1 (MQ=255) cGATAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCAt > 1:1178788/1‑150 (MQ=255) cGATAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCAt < 1:2507335/150‑1 (MQ=255) cGATAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCAt < 1:2272625/150‑1 (MQ=255) gATAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCAtt > 1:942161/1‑150 (MQ=255) aTAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCAttt > 2:1985594/1‑150 (MQ=255) aTAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACAAttt > 2:432985/1‑150 (MQ=255) tAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTa < 2:3985871/150‑1 (MQ=255) tAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTa < 2:2765102/150‑1 (MQ=255) aTTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAg > 1:2203109/1‑150 (MQ=255) ttCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCGATTAATTCATCACCATTTAAGa < 2:3684670/150‑1 (MQ=255) ttCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGa > 2:2669068/1‑150 (MQ=255) ttCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGa > 2:1225002/1‑150 (MQ=255) gCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCa < 2:2310866/150‑1 (MQ=255) cATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCag > 1:332960/1‑150 (MQ=255) cATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCag < 1:4419859/150‑1 (MQ=255) atatAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGACCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTAACCAATTTGTCATCTATACTCAGAAATTAATTCATCAACAAATAAGATTGAACCaga > 1:1559504/1‑150 (MQ=255) tataGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCagag < 2:3833164/150‑1 (MQ=255) ataGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAgaga < 2:1028014/150‑1 (MQ=255) aGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAg > 2:3371523/1‑150 (MQ=255) gTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAgg > 2:3252682/1‑150 (MQ=255) gTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAgg > 1:242724/1‑150 (MQ=255) tCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGc < 1:2961734/150‑1 (MQ=255) gAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCaa < 2:2932933/150‑1 (MQ=255) aaCATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAg < 1:2115669/150‑1 (MQ=255) aaCATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAg < 1:1939729/150‑1 (MQ=255) aCATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGa < 1:2966056/150‑1 (MQ=255) aTAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATc > 1:1535127/1‑150 (MQ=255) aGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCtt > 2:1086697/1‑150 (MQ=255) aaaaaaCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTaa < 1:605610/150‑1 (MQ=255) aaaaaaCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTaa < 2:4071523/150‑1 (MQ=255) aaaaaCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTaaa < 2:3188589/150‑1 (MQ=255) aaaaCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTaaaa > 1:616059/1‑150 (MQ=255) aCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGa > 1:3711624/1‑150 (MQ=255) aCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGa > 2:643696/1‑150 (MQ=255) aCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGa > 1:4171616/1‑150 (MQ=255) cTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGAt < 1:509082/150‑1 (MQ=255) tGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATa < 1:4204810/150‑1 (MQ=255) aaGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGt > 2:2119198/1‑150 (MQ=255) aaGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGt < 1:540880/150‑1 (MQ=255) aaGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGt < 1:539698/150‑1 (MQ=255) aaGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCAATTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGt > 2:2963145/1‑150 (MQ=255) gATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCACTTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTg > 2:492692/1‑150 (MQ=255) gATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTg < 1:1742637/150‑1 (MQ=255) gATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTg < 2:1726230/150‑1 (MQ=255) ttCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTgac < 1:1095354/150‑1 (MQ=255) aTCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTgacgac > 2:854694/1‑150 (MQ=255) tCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACa > 1:143469/1‑150 (MQ=255) ttATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACaaa < 1:4288272/150‑1 (MQ=255) gTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATta < 2:3664022/150‑1 (MQ=255) gTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATta < 2:3663378/150‑1 (MQ=255) tatataCTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATtat < 2:1131400/150‑1 (MQ=255) atataCTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATtata < 1:2177129/150‑1 (MQ=255) tataCTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAAAGATAGTTTAATACAAAAAAATTATaa > 2:938798/1‑150 (MQ=255) actacCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAAttt > 2:3156283/1‑150 (MQ=255) actacCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAAttt > 2:3156039/1‑150 (MQ=255) ctacCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTc < 1:1976842/150‑1 (MQ=255) tacCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCTGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCa < 1:313608/150‑1 (MQ=255) cccAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTgtga < 1:338962/150‑1 (MQ=255) cccAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTgtga > 2:4242609/1‑150 (MQ=255) ccAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTgtgag > 2:3610985/1‑150 (MQ=255) caacaaTGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTgtgagt > 2:562546/1‑150 (MQ=255) aacaaTGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTgtgagtg < 1:394983/150‑1 (MQ=255) aacaaTGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTgtgagtg < 1:394038/150‑1 (MQ=255) aacaaTGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTgtgagtg < 1:3494618/150‑1 (MQ=255) aaTGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAAc > 2:2414794/1‑150 (MQ=255) tAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAat > 2:2034971/1‑150 (MQ=255) tGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCa > 1:1819403/1‑150 (MQ=255) gcgcTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAg > 2:4402795/1‑150 (MQ=255) gcgcTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAg < 1:1660951/150‑1 (MQ=255) gcTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGga < 1:122596/150‑1 (MQ=255) cTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGgaa < 1:4249967/150‑1 (MQ=255) aCCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGgaagaa > 2:4381761/1‑150 (MQ=255) aCCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGgaagaa > 2:1513467/1‑150 (MQ=255) aCCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGgaagaa > 2:1510373/1‑150 (MQ=255) ccAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAAt > 2:2476142/1‑150 (MQ=255) aTTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATgag > 1:3810433/1‑150 (MQ=255) aTTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATgag > 1:3810589/1‑150 (MQ=255) tttGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATgaga > 2:2243372/1‑150 (MQ=255) gTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGta < 1:2669068/150‑1 (MQ=255) tCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGtaa > 1:825568/1‑150 (MQ=255) tCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGtaa < 1:3905632/150‑1 (MQ=255) tCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGtaa < 1:3252682/150‑1 (MQ=255) tCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGtaa > 1:3090294/1‑150 (MQ=255) aTCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGtaata > 1:1871544/1‑150 (MQ=255) aTCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGtaata > 1:1871009/1‑150 (MQ=255) aTCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGtaata > 2:1616182/1‑150 (MQ=255) ctcAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTcaca > 2:1660446/1‑150 (MQ=255) cAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGaaa < 1:1227035/150‑1 (MQ=255) aattaattCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAAt > 2:2014078/1‑150 (MQ=255) aattaattCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAAt < 2:65876/150‑1 (MQ=255) aattCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGtt > 2:3567431/1‑150 (MQ=255) aattCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGtt > 2:2240874/1‑150 (MQ=255) aattCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGtt < 1:3365390/150‑1 (MQ=255) aattCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGtt > 2:4535397/1‑150 (MQ=255) ttCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCt < 2:242724/150‑1 (MQ=255) tcatcaCCATTTAAGATTTCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGATAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTa < 2:1559504/150‑1 (MQ=255) tcataaCCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTa < 1:1168593/150‑1 (MQ=255) tcaCCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACa > 1:700020/1‑150 (MQ=255) | CATGTCGATAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAG > CP009273/1194045‑1194343 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |