| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,541,486 | A→T | 11.8% | intergenic (‑60/‑172) | yddG ← / → fdnG | aromatic amino acid exporter/formate dehydrogenase‑N, alpha subunit, nitrate‑inducible |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,541,486 | 0 | A | T | 11.8% | 916.7 / 94.5 | 288 | intergenic (‑60/‑172) | yddG/fdnG | aromatic amino acid exporter/formate dehydrogenase‑N, alpha subunit, nitrate‑inducible |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (116/138); new base T (14/20); total (130/158) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.44e-01 | |||||||||||
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
CCCCTCACTGACACCGCGAATCAATCCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAGTTTCCTCGCGCAGTAATA > CP009273/1541337‑1541635 | ccccTCACTGACACCGCGAATCAATCCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTa < 2:2609234/150‑1 (MQ=255) ccTCACTGACACCGCGAATCAATCCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAAc > 1:591922/1‑150 (MQ=255) tCACTGACACCGCGAATCAATCCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACTg < 2:2252023/150‑1 (MQ=255) tCACTGACACCGCGAATCAATCCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTg < 1:3614016/150‑1 (MQ=255) aCTGACACCGCGAATCAATCCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAATCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACTGGc > 1:1121280/1‑150 (MQ=255) tGACACCGCGAATCAATCCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCt > 1:1751552/1‑150 (MQ=255) cacCGCGAATCAATCCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTc > 2:2213007/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATCAATCCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAg < 2:1963799/150‑1 (MQ=255) cgcgAATCAATCCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAgg < 2:4185152/150‑1 (MQ=255) gAATCAATCCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAg > 2:4495747/1‑150 (MQ=255) caatcCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAgtggt > 2:3405856/1‑150 (MQ=255) caatcCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCATGTCAGGCAgtggt > 2:3114508/1‑150 (MQ=255) aatcCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAgtggtg > 1:1291421/1‑150 (MQ=255) aatcCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAgtggtg < 2:2782574/150‑1 (MQ=255) atcCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGc > 1:4207266/1‑150 (MQ=255) atcCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAAGTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGc > 2:3718534/1‑150 (MQ=255) ccTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGt < 1:1176891/150‑1 (MQ=255) cTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGtt > 2:169384/1‑150 (MQ=255) tACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGttt > 1:2526747/1‑150 (MQ=255) aCCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGtttt < 2:1448426/150‑1 (MQ=255) aCCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGtttt < 1:1996342/150‑1 (MQ=255) ccATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGttttt > 1:3993357/1‑150 (MQ=255) cATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTc < 1:4193587/150‑1 (MQ=255) ctCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCt < 2:3638207/149‑1 (MQ=255) gCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAAGTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGc > 1:1814823/1‑150 (MQ=255) ccACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACAGCTAt > 2:2733371/1‑150 (MQ=255) caGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGa < 2:455019/150‑1 (MQ=255) ggACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGagg > 1:4291172/1‑150 (MQ=255) ggACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGagg < 2:1700668/150‑1 (MQ=255) gATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGaggtagg > 1:1358068/1‑150 (MQ=255) aTCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGACTTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGaggtaggt > 2:1804844/1‑150 (MQ=255) cTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAAt < 2:2452888/150‑1 (MQ=255) cTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAAt > 1:201326/1‑150 (MQ=255) aTCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAAttt < 2:3752728/150‑1 (MQ=255) aTCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAAttt < 1:75210/150‑1 (MQ=255) cccTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGaa > 2:1372075/1‑150 (MQ=255) tATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGc < 1:2135766/150‑1 (MQ=255) aTGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCg < 1:612442/150‑1 (MQ=255) gAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGa < 1:4510041/150‑1 (MQ=255) gCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGatt < 1:1919677/150‑1 (MQ=255) cGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGatta > 1:3108196/1‑150 (MQ=255) gTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGattat > 2:807190/1‑150 (MQ=255) ttGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGattatt > 1:34390/1‑150 (MQ=255) ttGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGattatt > 2:4059003/1‑150 (MQ=255) tGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGGTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAATTTTAAGCTGTATTTTTTAGCATTTTTTTAACTGGCGTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCTATTTGCGTAGGCGGTTTAttt < 2:2183717/150‑1 (MQ=255) tGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTAttt < 1:922153/150‑1 (MQ=255) tGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTAttt < 1:3575546/150‑1 (MQ=255) cTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTtg > 1:145541/1‑150 (MQ=255) cTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTtg < 1:1018793/150‑1 (MQ=255) cTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTtg < 1:4424478/150‑1 (MQ=255) tttttGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTtgt < 1:3243765/150‑1 (MQ=255) ttGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGc < 2:2743517/150‑1 (MQ=255) aTGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGt < 2:1363442/150‑1 (MQ=255) aTGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGt > 1:2444921/1‑150 (MQ=255) tGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGtt < 1:147317/150‑1 (MQ=255) tGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGtt < 1:2841028/150‑1 (MQ=255) tGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGtt > 2:2274859/1‑150 (MQ=255) gCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTc > 1:509845/1‑150 (MQ=255) cGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCttt < 2:2621183/150‑1 (MQ=255) cGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCttt < 2:1010882/150‑1 (MQ=255) cTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCttttt < 2:4248611/150‑1 (MQ=255) cTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCttttt > 2:4425743/1‑150 (MQ=255) tGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTg < 1:841020/150‑1 (MQ=255) tttGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGAtt < 1:3007683/150‑1 (MQ=255) tttGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGAtt < 1:1778576/150‑1 (MQ=255) tGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTc < 2:532689/150‑1 (MQ=255) tGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTc < 1:535274/150‑1 (MQ=255) ctctctTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTcgcg > 1:416131/1‑150 (MQ=255) ctTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCaaa > 2:1283383/1‑150 (MQ=255) ttGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCaaaa < 2:896089/150‑1 (MQ=255) ttGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCaaaa > 1:3457110/1‑150 (MQ=255) ttGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCaaaa < 2:3141415/150‑1 (MQ=255) tGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCaaaaa > 1:1935955/1‑150 (MQ=255) gTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGAtt < 1:2654923/150‑1 (MQ=255) aaaaaTTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAg < 2:2403340/150‑1 (MQ=255) aaaTTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCCGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGaa < 1:2845712/150‑1 (MQ=255) aaTTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAAt > 1:1760744/1‑150 (MQ=255) tAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTTACATGCCGTTAAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGTAGGCGGGTTATTTTGGGGCAAACAGATGGTCTTTTTGATTTGGCGCAAAATGATTCAGAAtttt > 2:3691493/1‑150 (MQ=255) aaGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTa < 1:3046383/150‑1 (MQ=255) gCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACt < 2:4296568/150‑1 (MQ=255) cTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCTCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTg > 1:2932601/1‑150 (MQ=255) cTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTg > 1:2716430/1‑150 (MQ=255) cTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTg > 1:2611294/1‑150 (MQ=255) cTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTg > 2:2152079/1‑150 (MQ=255) gAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGtt < 1:4116432/150‑1 (MQ=255) aaTTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTa < 1:2801085/150‑1 (MQ=255) aTTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTCTTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAg > 2:1314433/1‑150 (MQ=255) aTTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAg < 2:1109962/150‑1 (MQ=255) ttttATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAGt < 2:3064910/150‑1 (MQ=255) tttATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAGtt > 1:3867797/1‑150 (MQ=255) tataGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAGTTTc > 2:3866779/1‑150 (MQ=255) aGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAGTTTCCTc < 1:4040427/150‑1 (MQ=255) aGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAGTTTCCTc < 2:3681995/150‑1 (MQ=255) aGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGAGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAGTTTCCTc < 2:1561855/150‑1 (MQ=255) cATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAGTTTCCTcgc > 1:2026960/1‑150 (MQ=255) tttttAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAGTTTCCTCGCGCAg < 2:2517357/150‑1 (MQ=255) tttttAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAGTTTCCTCGCGCAg < 2:655231/150‑1 (MQ=255) ttttAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCTGAATTTTACTGTTAGTTTCCTCGCGCAGt > 2:1863220/1‑150 (MQ=255) tAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAGTTTCCTCGCGCAGTAAt < 2:297931/150‑1 (MQ=255) aaCTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAGTTTCCTCGCGCAGTAATa < 2:3993357/150‑1 (MQ=255) | CCCCTCACTGACACCGCGAATCAATCCTACCATCGTGCTCCACAGGACGATCGCTATCAGCCCTATGAGCGTTGCTTTTTGTCGTGTCATGCTCGCTGTTTTGTCTCTCTTGCCGTTAAAAATTAAGCTGAATTTTATAGCATTTTTTTAACTGGCCTGTCAGGCAGTGGTGCGTTTTTCTACCGCTATTGAGGTAGGTCAATTTGCGAAGGCGGATTATTTTGTGGCAAACAGATGTTCTTTTTGATTTCGCGCAAAAAGATTCAGAATTTTACTGTTAGTTTCCTCGCGCAGTAATA > CP009273/1541337‑1541635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |