| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,030,998 | C→A | 11.9% | P212P (CCG→CCT) | yedV ← | putative sensory kinase in two‑component regulatory system with YedW |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,030,998 | 0 | C | A | 11.9% | 748.6 / 63.2 | 226 | P212P (CCG→CCT) | yedV | putative sensory kinase in two‑component regulatory system with YedW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (89/110); new base A (16/11); total (105/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.17e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.07e-01 | |||||||||||
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
GCGTAACCTGATTCTGACCCAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTA > CP009273/2030850‑2031146 | gCGTAACCTGATTCTGACCCAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCg < 2:1303323/150‑1 (MQ=255) cGTAACCTGATTCTGACCCAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCgg > 2:27683/1‑150 (MQ=255) cGTAACCTGATTCTGACCCAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCgg < 1:852244/150‑1 (MQ=255) cGTAACCTGATTCTGACCCAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTAgg < 1:974940/150‑1 (MQ=255) aaCCTGATTCTGACCCAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTaa < 1:1106911/150‑1 (MQ=255) aaCCTGATTCTGACCCAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTaa < 1:3678224/150‑1 (MQ=255) aCCTGATTCTGACCCAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAAt > 1:3565459/1‑150 (MQ=255) ccTGATTCTGACCCAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATg < 2:976620/150‑1 (MQ=255) tGATTCTGACCCAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATgcg > 1:3971030/1‑150 (MQ=255) ccAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCaa > 2:4405117/1‑150 (MQ=255) cAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAAc > 2:2540550/1‑150 (MQ=255) tAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAgg > 2:108535/1‑150 (MQ=255) cATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCtctc < 1:1022347/150‑1 (MQ=255) cATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCtctc < 1:483886/150‑1 (MQ=255) aTTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCg > 1:2887066/1‑150 (MQ=255) ttAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCgg > 2:3975140/1‑150 (MQ=255) tAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGc > 2:651488/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTAGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTa > 2:2566752/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTAGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTa > 2:1690591/1‑150 (MQ=255) ggCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCg < 2:3437163/150‑1 (MQ=255) cGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTAGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGtt > 2:3166071/1‑150 (MQ=255) cGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTAGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGtt > 2:898134/1‑150 (MQ=255) gTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTta > 2:1897715/1‑150 (MQ=255) gTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTta < 2:1580332/150‑1 (MQ=255) gTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTta > 1:2967923/1‑150 (MQ=255) ttCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTtat < 1:3031108/150‑1 (MQ=255) ttCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTtat < 1:3030315/150‑1 (MQ=255) tAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTAGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGGTATAAt > 2:2851100/1‑150 (MQ=255) gTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCa < 2:1624851/150‑1 (MQ=255) tGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCt < 1:520165/150‑1 (MQ=255) tGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCt > 2:1932383/1‑150 (MQ=255) gCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTcc < 1:3156195/150‑1 (MQ=255) gCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTcc < 2:2354046/150‑1 (MQ=255) cGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCg > 2:3219708/1‑150 (MQ=255) agaTCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGtt < 2:1845771/150‑1 (MQ=255) gaTCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTa < 2:2954484/150‑1 (MQ=255) gTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTAcacc > 2:2065429/1‑150 (MQ=255) gTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTAcacc > 1:1514349/1‑150 (MQ=255) cAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTAcaccac < 1:3729330/150‑1 (MQ=255) cAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCa < 2:3381781/150‑1 (MQ=255) cAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCa < 2:1231955/150‑1 (MQ=255) cAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCa < 2:1095844/150‑1 (MQ=255) aCTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACt < 1:4351255/150‑1 (MQ=255) cTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACtt > 1:172677/1‑150 (MQ=255) aCTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACttttt < 1:2540550/150‑1 (MQ=255) aCTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACttttt < 1:1777390/150‑1 (MQ=255) ttAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTAGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGa > 2:3529130/1‑150 (MQ=255) aGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGAtc < 1:3113359/150‑1 (MQ=255) aGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGAtc < 2:2290041/150‑1 (MQ=255) cGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTAGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGAtctct < 1:2709975/150‑1 (MQ=255) cGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTAGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGAtctct < 1:4053080/150‑1 (MQ=255) gCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGAtctctc > 2:396803/1‑150 (MQ=255) gCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGAtctctc > 1:2250422/1‑150 (MQ=255) cTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCg < 2:3857478/150‑1 (MQ=255) tCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGt > 2:1391595/1‑150 (MQ=255) tCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGt > 2:3839802/1‑150 (MQ=255) cAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTa > 1:3132739/1‑150 (MQ=255) aTCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTAGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATcc < 1:2124095/150‑1 (MQ=255) cTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCg > 2:2816816/1‑150 (MQ=255) tGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTc > 1:473025/1‑150 (MQ=255) cATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACa > 1:1418456/1‑150 (MQ=255) cATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACa > 2:2405467/1‑150 (MQ=255) cATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACa < 2:2730617/150‑1 (MQ=255) atgatgCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAg > 1:4422348/1‑150 (MQ=255) tgatgCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACCGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGc > 2:2033388/1‑150 (MQ=255) gatgCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCg > 2:443383/1‑150 (MQ=255) tgCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGa > 2:4470490/1‑150 (MQ=255) ttttATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTa < 1:1613648/150‑1 (MQ=255) tATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATa < 1:3348416/150‑1 (MQ=255) aTTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATAc < 1:1801361/150‑1 (MQ=255) aTTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTAGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATAc > 1:638323/1‑150 (MQ=255) tCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGTCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTg < 2:1081573/150‑1 (MQ=255) tCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTAGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTg < 2:4358575/150‑1 (MQ=255) cAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCACGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGa > 1:2174367/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAg > 2:593972/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAg > 1:1183865/1‑150 (MQ=255) gCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCaa > 2:870933/1‑150 (MQ=255) gCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCaa > 2:2388343/1‑150 (MQ=255) ccTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATATCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGTACTTAATACTGATCaaa > 1:425569/1‑150 (MQ=255) cTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAg < 2:564015/150‑1 (MQ=255) ccAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACa < 1:2813763/150‑1 (MQ=255) cAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACaa < 2:4295949/150‑1 (MQ=255) gagGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATgg < 1:2856146/150‑1 (MQ=255) agGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGc > 1:2384585/1‑150 (MQ=255) ggTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCg < 2:3045140/150‑1 (MQ=255) ggTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCg < 2:1479762/150‑1 (MQ=255) ttttAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGAc < 1:4125805/150‑1 (MQ=255) tAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAAt < 1:3350395/150‑1 (MQ=255) tAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAAt < 1:4266377/150‑1 (MQ=255) aGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATg < 2:3274999/150‑1 (MQ=255) ttCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCa < 1:3934524/150‑1 (MQ=255) ttCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCa < 1:3428027/150‑1 (MQ=255) ttCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCa < 1:4416092/150‑1 (MQ=255) ttCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCa < 2:473025/150‑1 (MQ=255) ttCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCa < 1:3934060/150‑1 (MQ=255) ctctcGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCaaa > 1:845415/1‑150 (MQ=255) ctctcGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCaaa > 1:3407030/1‑150 (MQ=255) ctctcGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCaaa < 2:3675669/150‑1 (MQ=255) tctcGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAAt < 1:3670948/150‑1 (MQ=255) tcGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATta < 1:1965593/150‑1 (MQ=255) | GCGTAACCTGATTCTGACCCAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTA > CP009273/2030850‑2031146 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |