Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,103,588 | 0 | A | T | 11.9% | 759.9 / 77.1 | 236 | V11E (GTG→GAG) | rfbC | dTDP‑4‑deoxyrhamnose‑3,5‑epimerase |
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Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
GGCCTCTGAGTACATTTTTTGATGAACGTGAGTGATTGTCTTGAACAAAGCTGACCGGATAGCCTAGAATATGTTCAAATGCTGATTGATTAAAGCTCTCATAAAAGAAACCTCTATCATCACCAAATACTCTTGGCTCCAGAATTAGCACATCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACAGCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAACCTTTACGAAATGCAATCTCT > CP009273/2103439‑2103736 | ctctGAGTACATTTTTTGATGAACGTGAGTGATTGTCTTGAACAAAGCTGACCGGATAGCCTAGAATATGTTCAAATGCTGATTGATTAAAGCTCTCATAAAAGAAACCTCTATCATCACCAAATACTCTTGGCTCCAGAATTAGCACAt > 1:4300827/1‑150 (MQ=255) ctctGAGTACATTTTTTGATGAACGTGAGTGATTGTCTTGAACAAAGCTGACCGGATAGCCTAGAATATGTTCAAATGCTGATTGATTAAAGCTCTCATAAAAGAAACCTCTATCATCACCAAATACTCTTGGCTCCAGAATTAGCACAt > 1:1725506/1‑150 (MQ=255) tctGAGTACATTTTTTGATGAACGTGAGTGATTGTCTTGAACAAAGCTGACCGGATAGCCTAGAATATGTTCAAATGCTGATTGATTAAAGCTCTCATAAAAGAAACCTCTATCATCACCAAATACTCTTGGCTCCAGAATTAGCACATc > 1:965049/1‑150 (MQ=255) 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ggCTCCAGAATTAGCACATCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACAGCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAACCTTTAc < 1:2777530/150‑1 (MQ=255) ggCTCCAGAATTAGCACATCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACAGCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAACCTTTAc < 1:248599/150‑1 (MQ=255) cTCCAGAATTAGCTCATCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACAGCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAACCTTTACGa > 2:4086362/1‑150 (MQ=255) gAATTAGCACATCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACAGCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAACCTTTACGAAATGc > 1:761876/1‑150 (MQ=255) aaTTAGCACATCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACACCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAAACTTTACGAAATGCa > 2:3478099/1‑150 (MQ=255) ttAGCACATCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACAGCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAACCTTTACGAAATGCAAt < 2:4300827/150‑1 (MQ=255) ttAGCACATCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACAGCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAACCTTTACGAAATGCAAt < 2:131035/150‑1 (MQ=255) aGCACATCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACAGCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAACCTTTACGAAATGCAAtct > 2:4517892/1‑150 (MQ=255) gCACATCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACAGCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAACCTTTACGAAATGCAAtctc < 2:1726029/150‑1 (MQ=255) gCACATCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACAGCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAACCTTTACGAAATGCAAtctc > 1:1504388/1‑150 (MQ=255) gCACATCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACAGCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAACCTTTACGAAATGCAAtctc < 1:1072121/150‑1 (MQ=255) cacaTCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACAGCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAACCTTTACGAAATGCAATctct > 1:4530140/1‑150 (MQ=255) | GGCCTCTGAGTACATTTTTTGATGAACGTGAGTGATTGTCTTGAACAAAGCTGACCGGATAGCCTAGAATATGTTCAAATGCTGATTGATTAAAGCTCTCATAAAAGAAACCTCTATCATCACCAAATACTCTTGGCTCCAGAATTAGCACATCTTCAATTTCAGTTCTAATCACATTCATTAATTTGAATCCTTCGTCATTTTATAAAGATACTGCCCATAATTATTCTTTATTAGTGGTACAGCTAATTTTCTTACTTGCTCAACATCAATAAAACCTTTACGAAATGCAATCTCT > CP009273/2103439‑2103736 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |