Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,243,089 | G→T | 18.7% | I3I (ATC→ATA) | yeiE ← | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,243,089 | 0 | G | T | 18.7% | 603.7 / 98.9 | 212 | I3I (ATC→ATA) | yeiE | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (71/100); new base T (22/18); total (94/118) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.57e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
ACGCGATCAAACAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAAACAACATCGTACACTGTGGC > CP009273/2242940‑2243238 | aCGCGATCAAACAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTg < 1:2190436/150‑1 (MQ=255) cgcgATCAAACAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGa < 1:2135109/150‑1 (MQ=255) gATCAAACAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGAtgt < 2:4303309/150‑1 (MQ=255) aGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTc > 1:2483247/1‑150 (MQ=255) aGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTc < 1:1610167/150‑1 (MQ=255) aGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTc < 1:1609696/150‑1 (MQ=255) gTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCg < 1:1740386/150‑1 (MQ=255) gTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCg < 1:3188204/150‑1 (MQ=255) gCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCtt < 1:3960487/150‑1 (MQ=255) cACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTa < 1:1182193/150‑1 (MQ=255) cAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACt < 1:3279176/150‑1 (MQ=255) cAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACt < 2:3838626/150‑1 (MQ=255) aGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTta > 1:605154/1‑150 (MQ=255) cTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTtata < 2:3509871/150‑1 (MQ=255) tGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATaa < 2:3751494/150‑1 (MQ=255) tGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATaa > 1:2605344/1‑150 (MQ=255) gCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATaaa > 2:1886554/1‑150 (MQ=255) gCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATaaa < 1:3346067/150‑1 (MQ=255) tCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGatta < 2:4218971/150‑1 (MQ=255) aGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTTATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGattaatt < 1:1127088/150‑1 (MQ=255) aGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGattaatt < 1:3328142/150‑1 (MQ=255) ggtcggtcAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGattaatta < 2:899018/150‑1 (MQ=255) gtcggtcAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATtat < 2:324429/150‑1 (MQ=255) ggtcAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATAAATTATaaa > 1:2720165/1‑150 (MQ=255) tcAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATGAATTATAAata < 2:2815622/150‑1 (MQ=255) tcAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAata < 1:199250/150‑1 (MQ=255) tcAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAata > 2:674351/1‑150 (MQ=255) tcAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAata < 1:3397888/150‑1 (MQ=255) cAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAatat < 1:279834/150‑1 (MQ=255) aaGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAatata < 1:1388711/150‑1 (MQ=255) aGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAatatat > 1:3654046/1‑150 (MQ=255) cTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAAt < 2:1998029/150‑1 (MQ=255) tGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATc < 2:2929904/150‑1 (MQ=255) gcTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAat < 1:2972648/150‑1 (MQ=255) cTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAatt < 1:977453/150‑1 (MQ=255) cTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAatt < 1:1299762/150‑1 (MQ=255) ctgctgATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAattttat < 1:1350176/150‑1 (MQ=255) ctgctgATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAattttat < 1:1891959/150‑1 (MQ=255) gctgATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAattttattt < 1:4174186/150‑1 (MQ=255) ctgATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAattttatttt > 2:1411532/1‑150 (MQ=255) ctgATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAattttatttt > 2:3916030/1‑150 (MQ=255) ctgATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAattttatttt < 1:712405/150‑1 (MQ=255) aTTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTaa > 1:359663/1‑150 (MQ=255) tGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATTCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAAc < 1:3259319/150‑1 (MQ=255) cGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCa < 2:4008123/150‑1 (MQ=255) gACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAAATTTATTTTTAAACCAg > 1:1151339/1‑150 (MQ=255) aCAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGt < 1:1005327/150‑1 (MQ=255) cATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAAc < 2:1176432/150‑1 (MQ=255) tCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCt < 2:1715190/150‑1 (MQ=255) cACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCtt < 2:4152848/150‑1 (MQ=255) cACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCtt > 2:719817/1‑150 (MQ=255) cACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCtt < 2:2625574/150‑1 (MQ=255) aCCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTa < 2:3377398/150‑1 (MQ=255) ccGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAAACAGATAGTAGTAAACTTAt > 1:878196/1‑150 (MQ=255) cGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAATATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACAATTTAGTCGTAAACTTAtt > 1:4139043/1‑149 (MQ=255) cGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATg < 2:2131036/150‑1 (MQ=255) cGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATg > 2:2230289/1‑150 (MQ=255) cGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGAATAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATg > 1:3924930/1‑150 (MQ=255) aCGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGcc > 2:3307443/1‑150 (MQ=255) ttggtggtTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGACGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACATTATGCCCGGtt < 1:3725612/148‑1 (MQ=255) tggtTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTGTAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAg < 2:3489254/150‑1 (MQ=255) ggtTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAgg > 1:625824/1‑150 (MQ=255) ggtTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTCATGTGCATAGTCGCTTACCACATATAAAGATTAAAAATAAAAATATAATCAATTTTATTTTTAAAACAGTTATTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAgg > 2:3037718/1‑150 (MQ=255) gtTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGga > 2:492264/1‑150 (MQ=255) tGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATAAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAAACTTATGCCCGGTTAAAGgaga > 1:188163/1‑150 (MQ=255) gATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGagag > 2:1050344/1‑150 (MQ=255) tCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAggg < 1:755413/150‑1 (MQ=255) ccACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGt < 1:1325629/150‑1 (MQ=255) cTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTAt > 1:374011/1‑150 (MQ=255) ttttCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTTACCTTATGCCCGGTTAAAGGTGAGGGTTATg > 2:3822841/1‑150 (MQ=255) tCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACg < 1:2029634/150‑1 (MQ=255) tCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACg < 1:4304519/150‑1 (MQ=255) cAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACATATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCGTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGa > 1:4211989/1‑150 (MQ=255) cAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACATATAAAGATTAATTATAAATATATAATAAATTTTATTTTTAAACCAGTTATTAGTAAACATATGCCCGGGTAAAGGAGAGGGGTATGTCGa > 1:4211597/1‑150 (MQ=255) tACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAata > 2:1738913/1‑150 (MQ=255) tACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAata < 1:304835/150‑1 (MQ=255) aCTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGACCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAatat > 2:809439/1‑150 (MQ=255) cTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATc > 2:4425401/1‑150 (MQ=255) cTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAAACAGTTATTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATc > 1:534428/1‑150 (MQ=255) cTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCAcc > 1:748254/1‑150 (MQ=255) cAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTa < 2:2644696/150‑1 (MQ=255) aaaaaCTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGGCCGGGTAAAGGAGAGGGTTATGTCGACTATCACCTTAc > 1:2297222/1‑150 (MQ=255) aaaaaCTTCCAACTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAAACAGGTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATTACGAATATAACCTTAc > 1:2732699/1‑150 (MQ=255) aaaCTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGCGAGGGTTATGACGAATATCACATTTCAg > 2:2324049/1‑150 (MQ=255) aaaCTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAAATTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATAACACCTTACAg > 2:2323610/1‑150 (MQ=255) aaCTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGa > 2:2357011/1‑150 (MQ=255) aaCTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTAACACTTATAAATATTAAATATAAATATATAATCAAATTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAAACTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGGTATGTCGAATATCACCTTACAGa > 1:828475/1‑150 (MQ=255) aCTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTAAAGaa > 2:629733/1‑150 (MQ=255) ttCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGGTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAaac > 1:2132082/1‑150 (MQ=255) tCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAaaca < 2:1215688/150‑1 (MQ=255) ccAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAaacaa > 1:4030519/1‑150 (MQ=255) aaCTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAAacaaca > 2:1625051/1‑150 (MQ=255) aCTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAAACAACAt < 1:2861633/150‑1 (MQ=255) cTGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAAACAACATc > 2:502545/1‑150 (MQ=255) tGCCGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAAACAACATCg < 1:1075161/150‑1 (MQ=255) ccGGAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAAACAACATCGTa < 2:1543281/150‑1 (MQ=255) cGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATAAAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAATGAGATGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAAACAAAATAGTac > 2:3997878/1‑150 (MQ=255) ggAGGGTTATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAAACAACATCGTaca < 2:422288/150‑1 (MQ=255) ggAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAAACAACATCGTaca < 1:2081393/150‑1 (MQ=255) gAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAAACAACATCGTacac < 1:1859142/150‑1 (MQ=255) | ACGCGATCAAACAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAGCATCACCGACGCCTGGGTGGTTGATCCACTTTTCAATACTTCTGCAAAAACTTCCAACTGCCGGAGGGTGATGTGCATAGTCGCTTACCACTTATAAAGATTAATTATAAATATATAATCAATTTTATTTTTAAACCAGTTAGTCGTAACCTTATGCCCGGTTAAAGGAGAGGGTTATGACGAATATCACCTTACAGAAACAACATCGTACACTGTGGC > CP009273/2242940‑2243238 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |