| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 234,985 | A→T | 9.9% | I80N (ATC→AAC) ‡ | ykfM ← | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 234,985 | 0 | A | T | 9.9% | 396.8 / 5.4 | 151 | I80N (ATC→AAC) ‡ | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (67/67); new base T (15/2); total (82/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.46e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
ATTATTACCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTA > CP009273/234837‑235134 | attattACCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGAt > 1:1382531/1‑150 (MQ=255) ttattaCCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGAtt > 1:2511823/1‑150 (MQ=255) ttattaCCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGAtt < 2:3606328/150‑1 (MQ=255) ttaCCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAg < 2:3911104/150‑1 (MQ=255) cAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTAt > 1:2503782/1‑150 (MQ=255) gTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTttat < 1:2215902/150‑1 (MQ=255) aaTTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCg < 2:540603/150‑1 (MQ=255) ttAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAgta > 1:222317/1‑150 (MQ=255) aGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCgtaat > 2:1339789/1‑149 (MQ=255) aGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAgtaag > 1:1964063/1‑150 (MQ=255) aGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaag < 1:3702158/150‑1 (MQ=255) aTTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagtaa < 1:656069/150‑1 (MQ=255) ttGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaa < 2:1986292/150‑1 (MQ=255) tGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaaa < 2:207283/150‑1 (MQ=255) gACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAt < 1:71200/150‑1 (MQ=255) gACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAAt > 2:2530134/1‑150 (MQ=255) gACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGAATAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAt > 2:34356/1‑150 (MQ=255) gACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTGAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAt < 1:1380206/150‑1 (MQ=255) aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAAtt > 2:2349297/1‑150 (MQ=255) aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAtt < 2:3151979/150‑1 (MQ=255) cATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTa < 2:751879/150‑1 (MQ=255) cATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTa < 1:450056/150‑1 (MQ=255) atCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTaaaa > 2:44271/1‑147 (MQ=255) atCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAt < 1:1577123/150‑1 (MQ=255) atCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAt < 1:4167475/150‑1 (MQ=255) ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGa > 2:4433765/1‑150 (MQ=255) tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAat > 2:3207520/1‑150 (MQ=255) gtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAata < 2:3964260/150‑1 (MQ=255) tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAatat < 2:2377666/150‑1 (MQ=255) gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATAtt < 2:1282056/150‑1 (MQ=255) gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATAtt < 2:1282051/150‑1 (MQ=255) cAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTa > 1:3012879/1‑150 (MQ=255) aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaa < 2:3287034/150‑1 (MQ=255) aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAATACAAGAATAATTaa > 1:1375710/1‑150 (MQ=255) aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaaa > 2:1734387/1‑150 (MQ=255) aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATTAATATTTaaaa > 2:3135837/1‑150 (MQ=255) ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTATATTAAGTAAAATTAAAAGAATATTTaaaaat > 1:3894124/1‑149 (MQ=255) gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 2:1427063/150‑1 (MQ=255) aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGa > 2:3637147/1‑150 (MQ=255) tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGaaaa > 1:1056392/1‑150 (MQ=255) ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGaaaaag > 2:2823079/1‑148 (MQ=255) aaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGATTGATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACa < 2:2039927/150‑1 (MQ=255) ggTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTTATTATGATTTTATTATAGTTATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTTAAAAGACaag > 1:2026143/1‑148 (MQ=255) cTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGaaaa > 2:4350460/1‑149 (MQ=255) tATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATTAAAACGACATGAAAcc > 2:3297021/1‑150 (MQ=255) ttACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGa > 2:1812275/1‑150 (MQ=255) tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCGaa > 1:3389193/1‑150 (MQ=255) cGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAATTAATTTATTAAACTAAGTAAAAATACAATAATATTTAAAAAAGAAAAAGACAAGAAAACGaacc > 1:4322046/1‑148 (MQ=255) aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTTAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACCTGTAACCGAAGcac > 1:2410856/1‑150 (MQ=255) atatattatTAAAATTATAAGATTTAGTTGTATTTTTTTGTCTGTGTCTAATTTGACTACATTCGTTTTTTTGATTAAGAATTTTTTTTTTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAg < 2:3550850/147‑1 (MQ=255) cTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTATAGTTAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAAACGAATCACAGaa > 1:1347821/1‑150 (MQ=255) cTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATGAAAATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGAACACaa > 1:4436739/1‑150 (MQ=255) tATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAt > 2:4347822/1‑150 (MQ=255) attattAAAAATTTATGAGTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATATTGTTTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATc < 2:586943/150‑1 (MQ=255) ttattaAAAATATAAGAGTTTGCTGTTTTTTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGATTGATTTTTTTATGTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCa < 2:2896735/150‑1 (MQ=255) aGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAATACAATAATAATTAAAAATTAAAAAGACAAGAAAACCAACCACAGAAACaaa > 1:3179650/1‑149 (MQ=255) aaaatTATAAGTGTTAGTTTTTTTGTTTTGTGTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATATTTTTTTTATTTTCTTAATTAAAATTACTTTATTATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAtt < 1:2044947/150‑1 (MQ=255) aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAtt > 2:1610672/1‑150 (MQ=255) aaaTATATGTGTTAGCTGTTTTGTTTGGTCTGTGGCTAAATTGACTCCCTTCTTTTTTTTTATTAAGATTTTTTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATTTTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtct < 2:1552766/150‑1 (MQ=255) aaaTATATCTGTTAGCTGTTTTTTTTTGTCTGTGGATAAATTCACTACCTTCTTTTTTTTTATAAATAATTATTTTATTATCGAATTAAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtct < 2:3833495/150‑1 (MQ=255) atatAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTcc > 2:1482279/1‑150 (MQ=255) tataTGATTTAGTTGTTTTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACAACATTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCa < 1:1078858/150‑1 (MQ=255) aaGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCGAAGAACAGAAACAAAATTATCCAAta > 2:4227595/1‑149 (MQ=255) aaGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATc > 2:1020075/1‑150 (MQ=255) tgagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCa < 1:3372702/149‑1 (MQ=255) agagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAAAGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAAACCAAGCACACAATAAAAATTATCCAATCa > 1:4333967/1‑150 (MQ=255) ttAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAAAGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCCAAGCACAAAAAAAAAAATATCAAATAATaaa > 1:3666917/1‑150 (MQ=255) gCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAAGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACCGAATCAACATTCTCCAATCAAAAAata > 2:3266310/1‑150 (MQ=255) gCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACATAATCAACATAATCCAATCATAAAata > 2:3266026/1‑150 (MQ=255) tttttGTTATGTTTGTGGCTAATTTGACTACCTTGTTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt < 1:2804496/147‑1 (MQ=255) aTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTcc > 2:3917496/1‑150 (MQ=255) ttGTTATGTCTGTGGATAAATTCAATACCTTAGTTTTTTTCATAAACAATTATTTTATTATCTAAATAAAAATTAAATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCg < 1:1775472/150‑1 (MQ=255) gTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACAACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTAATTTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTg < 1:3759711/150‑1 (MQ=255) tttgtgtgtgGACAATTTGAATACTTTCTTTTTTTTTTTTAACATTTTTTTTATTATCTAAATTAAAATTAATTTAATATTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGa < 1:2297618/148‑1 (MQ=255) tATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGa > 2:4229936/1‑150 (MQ=255) ttgtgggtgGCTAATTTGAATACATTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATTAAATTTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAg < 1:4147503/144‑1 (MQ=255) tGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGc < 2:3687958/150‑1 (MQ=255) gTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAACATAAAATATTTCCGTGGAGCa > 2:889944/1‑150 (MQ=255) cTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt > 2:1093686/1‑150 (MQ=255) tgtgGCTAATTTTACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAAAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAATGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAttt < 1:2770335/150‑1 (MQ=255) gtgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAAAGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACCAGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATATCCAAACAAAAAATATTTACGTGGAGCAattt > 1:1355799/1‑150 (MQ=255) ggCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACAATAAAACCAAGCACACAAACAAAAATCTCCAAAAATAAAAAATTTACGTGGAGGAtttttt > 1:3146376/1‑148 (MQ=255) cGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAAATATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATAATTAAAAATTAAAAAGACAATAAACCGAAGCACAGAAAAAACAATATCCAATAAAAAAAAATTTGCGTGGGGCCATttatta > 1:2897357/1‑150 (MQ=255) aattttaCTACATTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:2503782/144‑1 (MQ=255) aaaTTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:2158705/150‑1 (MQ=255) aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAAATAAAATAATATTTAAAAATGTAAAAGACAATAAAACGAAGCACAGAAAAAAACTTATCCAAAAAAAAAAAAATTCAGTGGTGCATTTTatttttt > 2:816352/1‑149 (MQ=255) aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGCATTTTattattt > 2:4526674/1‑149 (MQ=255) tcacaaCCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTATTAAAAATTACATTAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAat < 1:1339789/145‑1 (MQ=255) aCCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATAGTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAATGAAAAAGAAATTAAAACCAATCACAGAAAAAAAAATATACAAACAAAAAATATATGAGTGGAGCAATTTTTTATTTtatatatt > 2:3221608/1‑148 (MQ=255) aCCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATAAAAATTCTCCAATAATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAAtatata > 2:2240001/1‑148 (MQ=255) aCCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATTAAAACCAAGCACAGAATAAACATTAAACAAACAAAAAATATTTACGTGGAGCATTTTATTATTTAAtatata > 2:3221513/1‑148 (MQ=255) cTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:1845563/150‑1 (MQ=255) ttCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 2:548866/150‑1 (MQ=255) tCGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGtt < 1:2200597/150‑1 (MQ=255) tCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGtt > 2:4382587/1‑150 (MQ=255) cttttttttGATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAATTTACATGAATATTTAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 1:1864867/148‑1 (MQ=255) ttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAAAGACATGAAACCTAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc > 1:1528370/1‑150 (MQ=255) tttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACt > 2:4467385/1‑150 (MQ=255) tttGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTcc < 1:2047279/150‑1 (MQ=255) aTTAAGATTTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa < 1:3965211/150‑1 (MQ=255) | ATTATTACCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTA > CP009273/234837‑235134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |