Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,486,801 | 0 | A | T | 10.6% | 623.2 / 52.1 | 188 | intergenic (‑68/+445) | frc/yfdX | formyl‑CoA transferase, NAD(P)‑binding/uncharacterized protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (76/92); new base T (9/11); total (85/103) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
AGGCCAGCATTTGAGTACAAGATGGGCCAGATTGCACACCGGTGAAATCGAGAACTTTAATTCCTTGAAGTGGAGTTGACATAGCAATACCTATTAGTTAATTAAATATGTGTTAATTTAGCGTTTATTTAAGGCGTAATATCTTCTATAAATAACCCGCAAAATATCGTCGTAGCTGCACTCGATATTTTTAAAATCCTGTATCAAGTGCTGAAAATCATTTCATCGCCACTTCCAATTCCTTTCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCG > CP009273/2486652‑2486948 | cggCCAGCATGTGAGTACACGCTGGCCCAGATTGCACACCGGTGAAATCGAGAACTTTAATTCCTTGAAGTGGAGTTGACATAGCAATACCTATTAGTTAATTAAATATGTGTTAATTTAGCGTTTATTTAAGGCGTAATATCTTCtata < 2:3176381/149‑1 (MQ=255) gCCAGCATTTGAGTACAAGATGGGCCAGATTGCACACCGGTGAAATCGAGAACTTTAATTCCTTGAAGTGGAGTTGACATAGCAATACCTATTAGTTAATTAAATATGTGTTAATTTAGCGTTTATTTAAGGCGTAATATCTTCTattaa > 2:3462767/1‑150 (MQ=255) gCCAGCATTTGAGTACAAGATGGGCCAGATTGCACACCGGTGAAATCGAGAACTTTAATTCCTTGAAGTGGAGTTGACATAGCAATACCTATTAGTTAATTAAATATGTGTTAATTTAGCGTTTATTTAAGGCGTAATATCTTCTataaa > 1:2003066/1‑150 (MQ=255) 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ttctATAAATAACCCGCAAAATATCGTCGTAGCTGCACTCGATATTTTTAAAATCCTGTATCAAGTGCTGAAAATCATTTCATCGCCACTTCCAATTCCTTTCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGa < 1:879608/150‑1 (MQ=255) ctATTAATAACCCGCAAAATATCGTCGTAGCTGCACTCGATATTTTTAAAATCCTGTATCAAGTGCTGAAAATCATTTCATCGCCACTTCCAATTCCTTTCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGAtt > 1:3319116/1‑150 (MQ=255) | AGGCCAGCATTTGAGTACAAGATGGGCCAGATTGCACACCGGTGAAATCGAGAACTTTAATTCCTTGAAGTGGAGTTGACATAGCAATACCTATTAGTTAATTAAATATGTGTTAATTTAGCGTTTATTTAAGGCGTAATATCTTCTATAAATAACCCGCAAAATATCGTCGTAGCTGCACTCGATATTTTTAAAATCCTGTATCAAGTGCTGAAAATCATTTCATCGCCACTTCCAATTCCTTTCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCG > CP009273/2486652‑2486948 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |