| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 235,036 | G→T | 14.5% | S63Y (TCC→TAC) ‡ | ykfM ← | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 235,036 | 0 | G | T | 14.5% | 382.0 / 3.5 | 164 | S63Y (TCC→TAC) ‡ | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (91/34); new base T (6/28); total (97/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.01e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
GAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATAAAA > CP009273/234887‑235182 | gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 2:1428363/150‑1 (MQ=255) aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGa > 2:3637147/1‑150 (MQ=255) tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGaaaa > 1:1056392/1‑150 (MQ=255) ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGaaaaag > 2:2823079/1‑148 (MQ=255) aaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGATTGATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACa < 2:2039927/150‑1 (MQ=255) ggTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAAATAATATTTTAAAAGTaaaaacacaag > 1:2026252/1‑143 (MQ=255) tATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAcc > 2:3297022/1‑150 (MQ=255) ttACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGa > 2:1812275/1‑150 (MQ=255) cGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAATTAATTTATTAAACTAAGTAAAAATACAATAATATTTAAAAAAGAAAAAGACAAGAAAACGaacc > 1:4322046/1‑148 (MQ=255) aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTTAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACCTGTAACCGAAGcac > 1:2410856/1‑150 (MQ=255) cTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTATAGTTAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAAACGAATCACAGaa > 1:1347821/1‑150 (MQ=255) cTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATGAAAATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGAACACaa > 1:4436739/1‑150 (MQ=255) tATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAt > 2:4347822/1‑150 (MQ=255) tATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAAt > 2:2075903/1‑150 (MQ=255) ttattaAAAATATAAGAGTTTGCTGTTTTTTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGATTGATTTTTTTATGTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCa < 2:2896735/150‑1 (MQ=255) aaaTATATGTGTTAGCTGTTTTGTTTGGTCTGTGGCTAAATTGACTCCCTTCTTTTTTTTTATTAAGATTTTTTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATTTTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtct < 2:1552766/150‑1 (MQ=255) aaaTATATCTGTTAGCTGTTTTTTTTTGTCTGTGGATAAATTCACTACCTTCTTTTTTTTTATAAATAATTATTTTATTATCGAATTAAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtct < 2:3833495/150‑1 (MQ=255) atatAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTcc > 2:1482279/1‑150 (MQ=255) tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAATCACAGAATAAACATTCTCCa > 1:3771982/1‑150 (MQ=255) tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCa > 2:1706462/1‑150 (MQ=255) aaGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATc > 2:4488860/1‑150 (MQ=255) aaGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATc > 2:1020075/1‑150 (MQ=255) tgagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCa < 1:3372702/149‑1 (MQ=255) ttAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAAAGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCCAAGCACAAAAAAAAAAATATCAAATAATaaa > 1:3666917/1‑150 (MQ=255) ttAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGTTTAATAAATATTTTATTATCGTAAGTAAAAATACAAGAATATTTAAAAATGAAAAACACAAGAAAACCAAACACAGAAACAAAAAAATCCAAACATaaa > 1:4222320/1‑150 (MQ=255) gCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAAGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACCGAATCAACATTCTCCAATCAAAAAata > 2:3266310/1‑150 (MQ=255) tttttGTTATGTTTGTGGCTAATTTGACTACCTTGTTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt < 1:2804496/147‑1 (MQ=255) aTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATCTCCAATCATAAAAAATTTcc > 2:3917528/1‑150 (MQ=255) tttttGTCTGTGGACAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTTATAAAGAATTTTTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTg < 1:3759698/146‑1 (MQ=255) tATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGa > 2:4229936/1‑150 (MQ=255) atttCTGTGGCTAAATTGAATACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAATTTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAg < 2:3240515/147‑1 (MQ=255) tGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGc < 2:3687958/150‑1 (MQ=255) gTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAATAAAATAAAATTTAAAAAAGAAAAAGACAAGAAACCCAAGCCCACAAACAAAAATCTACAAAAAAAAAAAATTTACGGGGAGcc > 1:4414422/1‑149 (MQ=255) gTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAACATAAAATATTTCCGTGGAGCa > 2:889944/1‑150 (MQ=255) cTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt > 2:1093686/1‑150 (MQ=255) tgtgGCTAATTTTACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAAAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAATGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAttt < 1:2770335/150‑1 (MQ=255) gtgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAAAGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACCAGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATATCCAAACAAAAAATATTTACGTGGAGCAattt > 1:1355799/1‑150 (MQ=255) ggCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACAATAAAACCAAGCACACAAACAAAAATCTCCAAAAATAAAAAATTTACGTGGAGGAtttttt > 1:3146376/1‑148 (MQ=255) gctaaaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTCTTATCGAAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatt < 2:3130264/147‑1 (MQ=255) aattttaCTACATTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:2503782/144‑1 (MQ=255) aatttGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:3286990/147‑1 (MQ=255) aaaTTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:2158705/150‑1 (MQ=255) aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAAATAAAATAATATTTAAAAATGTAAAAGACAATAAAACGAAGCACAGAAAAAAACTTATCCAAAAAAAAAAAAATTCAGTGGTGCATTTTatttttt > 2:816352/1‑149 (MQ=255) aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAATTAAAAGAATATTTAAAAATGAAAACGAAAAGAAACCGAAACAAATAATCAAAATTCTCCAATAAAAAAAAATTTACGTGGAGCATTTTattattt > 1:2618739/1‑149 (MQ=255) tcacaaCCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTATTAAAAATTACATTAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAat < 1:1339789/145‑1 (MQ=255) aCCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATAGTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAATGAAAAAGAAATTAAAACCAATCACAGAAAAAAAAATATACAAACAAAAAATATATGAGTGGAGCAATTTTTTATTTtatatatt > 2:3221608/1‑148 (MQ=255) aCCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATTAAAACCAAGCACAGAATAAACATTAAACAAACAAAAAATATTTACGTGGAGCATTTTATTATTTAAtatata > 2:3221513/1‑148 (MQ=255) cTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:1845563/150‑1 (MQ=255) ttgtttttttttATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 2:548753/146‑1 (MQ=255) ttCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 2:548866/150‑1 (MQ=255) tCGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGtt < 1:2200597/150‑1 (MQ=255) tCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGtt > 2:4382587/1‑150 (MQ=255) cttttttttGATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAATTTACATGAATATTTAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 1:1864867/148‑1 (MQ=255) ttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAAAGACATGAAACCTAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc > 1:1528370/1‑150 (MQ=255) tttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACt > 1:2500576/1‑150 (MQ=255) tttGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTcc < 1:2047279/150‑1 (MQ=255) tttaTTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAATTTAAATTAATATTTAAAAATTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCg < 1:2874997/147‑1 (MQ=255) tGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCgg > 1:597137/1‑150 (MQ=255) aTTAAGATTTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa < 1:3965211/150‑1 (MQ=255) aaGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaa > 1:1503671/1‑150 (MQ=255) aaGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaa > 1:1503680/1‑150 (MQ=255) aTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACa > 2:1722308/1‑150 (MQ=255) gATTTAATTATCTAAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACaaa < 2:3593906/150‑1 (MQ=255) aTTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaag > 2:2843431/1‑150 (MQ=255) tttATTATCTTAATAAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaagaa < 1:3637147/150‑1 (MQ=255) tttATTATCGTATGTAAAATTACATGAATTTTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaagaa < 2:1376671/150‑1 (MQ=255) tttATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaagaa > 1:1962186/1‑150 (MQ=255) ttattaTCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaagaag > 2:4362144/1‑150 (MQ=255) tattatCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGc > 2:1340345/1‑150 (MQ=255) tattatCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGc > 2:2729443/1‑150 (MQ=255) atCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTg > 1:271528/1‑150 (MQ=255) gtaagtaaAATTACATAAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAATGAAGCAGTGAAt > 1:3088809/1‑150 (MQ=255) taagtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATg > 1:1010874/1‑150 (MQ=255) taagtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATg > 1:123546/1‑150 (MQ=255) taagtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATg > 1:1010152/1‑150 (MQ=255) attaaAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCa < 2:1382550/148‑1 (MQ=255) agtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCa > 2:4293115/1‑150 (MQ=255) ttaaAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAg < 2:1349656/149‑1 (MQ=255) ttaaAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAg < 2:3894124/149‑1 (MQ=255) taaAATTAAATTAATTTTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAgg < 2:3088378/150‑1 (MQ=255) aaaTTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGa < 1:1075299/150‑1 (MQ=255) cATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAaata > 1:3608995/1‑150 (MQ=255) aaTATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAatat > 1:3680328/1‑150 (MQ=255) aaTATTTAAAAAGAAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAatat < 1:1974700/150‑1 (MQ=255) atatTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATg < 2:3013208/150‑1 (MQ=255) tatTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGTGACAAATAATATgg > 2:2389925/1‑150 (MQ=255) tatTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATgg < 1:4467385/150‑1 (MQ=255) atTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGc > 2:1033205/1‑150 (MQ=255) atTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGc < 2:601405/150‑1 (MQ=255) tttAAAAATTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGcc < 1:34356/150‑1 (MQ=255) tttAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGcc < 1:2295057/150‑1 (MQ=255) ttaaaaaaGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGcc < 1:4172095/147‑1 (MQ=255) ttAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCa < 2:3719151/150‑1 (MQ=255) ttAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCa < 2:3946171/150‑1 (MQ=255) ttAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCa < 2:722956/150‑1 (MQ=255) aaaaaGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATa < 2:4414422/150‑1 (MQ=255) aaaGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATCTGGCCATaaa > 1:1607901/1‑150 (MQ=255) aaaGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATaaa > 1:1609901/1‑150 (MQ=255) aaGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATaaaa > 1:2864698/1‑150 (MQ=255) aaGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATaaaa > 1:3151533/1‑150 (MQ=255) | GAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATAAAA > CP009273/234887‑235182 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |