Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,687,651 | 0 | C | A | 6.4% | 828.1 / 23.4 | 218 | G418C (GGC→TGC) | purL | phosphoribosylformyl‑glycineamide synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (112/91); new base A (6/9); total (118/100) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.91e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
AAAGTCGAGGTCGGCATCAGACTGACCAGACGCCATAGAAGACGCTGCACCACCGCCAAGACCGATGTTCATTGCCGGGCCGCCGAGAACGACCAGCTTCGCACCGACGTTGATCTCGCCTTTTTGTACGTGATCGGCGCGAATGTTGCCGATCCCGCCCGCCAGCATGATCGGTTTGTGATAACCGCGCAGCTCTTCGCCGTTGTGGCTGTTCACTTTTTCTTCATAAGTACGGAAGTAGCCGTTCAGTGCCGGACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTT > CP009273/2687502‑2687800 | aaaGTCGAGGTCGGCATCAGACTGACCAGACGCCATAGAAGACGCTGCACCACCGCCAAGACCGATGTTCATTGCCGGGCCGCCGAGAACGACCAGCTTCGCACCGACGTTGATCTCGCCTTTTTGTACGTGATCGGCGCGAATGTTGcc > 2:2991303/1‑150 (MQ=255) aGTCGAGGTCGGCATCAGACTGACCAGACGCCATAGAAGACGCTGCACCACCGCCAAGACCGATGTTCATTGCCGGGCCGCCGAGAACGACCAGCTTCGCACCGACGTTGATCTCGCCTTTTTGTACGTGATCGGCGCGAATGTTGCCGa > 1:3051953/1‑150 (MQ=255) tCGAGGTCGGCATCAGACTGACCAGACGCCATAGAAGACGCTGCACCACCGCCAAGACCGATGTTCATTGCCGGGCCGCCGAGAACGACCAGCTTCGCACCGACGTTGATCTCGCCTTTTTGTACGTGATCGGCGCGAATGTTGCCGATc < 1:2503671/150‑1 (MQ=255) 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cGATCCCGCCCGCCAGCATGATCGGTTTGTGATAACCGCGCAGCTCTTCGCCGTTGTGGCTGTTCACTTTTTCTTCATAAGTACGGAAGTAGCCGTTCAGTGCCGGACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCtt > 2:465789/1‑150 (MQ=255) cGATCCCGCCCGCCAGCATGATCGGTTTGTGATAACCGCGCAGCTCTTCGCCGTTGTGGCTGTTCACTTTTTCTTCATAAGTACGGAAGTAGCCGTTCAGTGCCGGACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCtg > 1:4024198/1‑149 (MQ=255) | AAAGTCGAGGTCGGCATCAGACTGACCAGACGCCATAGAAGACGCTGCACCACCGCCAAGACCGATGTTCATTGCCGGGCCGCCGAGAACGACCAGCTTCGCACCGACGTTGATCTCGCCTTTTTGTACGTGATCGGCGCGAATGTTGCCGATCCCGCCCGCCAGCATGATCGGTTTGTGATAACCGCGCAGCTCTTCGCCGTTGTGGCTGTTCACTTTTTCTTCATAAGTACGGAAGTAGCCGTTCAGTGCCGGACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTT > CP009273/2687502‑2687800 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |