| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,742,459 | T→A | 16.4% | A109A (GCT→GCA) | yfjD → | UPF0053 family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,742,459 | 0 | T | A | 16.4% | 671.1 / 110.6 | 237 | A109A (GCT→GCA) | yfjD | UPF0053 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (87/111); new base A (20/19); total (107/130) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
GACCGCCTGATAAGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATGCGCATGATGGGTAT > CP009273/2742310‑2742608 | gACCGCCTGATAAGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCGGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCt < 2:2789681/150‑1 (MQ=255) cGCCTGATAAGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAg < 2:3181978/150‑1 (MQ=255) tGATAAGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTAt > 2:1775617/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCg < 2:168356/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGaa < 1:1800455/150‑1 (MQ=255) tGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGaaaa < 1:3204224/150‑1 (MQ=255) tgtTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCa < 2:1939362/150‑1 (MQ=255) gtTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCAt > 1:609299/1‑150 (MQ=255) ttAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCAtt < 2:2423531/150‑1 (MQ=255) ttAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCAtt < 2:1836832/150‑1 (MQ=255) aaTCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGc > 1:1980020/1‑150 (MQ=255) aaTAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTg > 2:494312/1‑150 (MQ=255) tAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTa < 2:3219315/150‑1 (MQ=255) tAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTa < 2:1737754/150‑1 (MQ=255) tAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTa < 1:2612210/150‑1 (MQ=255) aaCCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTAc < 1:3738128/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTAccc > 1:2235321/1‑150 (MQ=255) ccTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCAGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTAccc > 1:209156/1‑150 (MQ=255) cAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGaaaa > 2:3058432/1‑150 (MQ=255) atatTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAg < 2:4036268/150‑1 (MQ=255) tatTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGt < 1:2173828/150‑1 (MQ=255) tatTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGt > 1:729302/1‑150 (MQ=255) atTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTc < 2:93891/150‑1 (MQ=255) ttCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCg > 1:3215986/1‑150 (MQ=255) gCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTAt < 2:3584458/150‑1 (MQ=255) gCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTAt > 1:3557427/1‑150 (MQ=255) ccTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATc > 2:1474298/1‑150 (MQ=255) ccTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATc > 2:2180935/1‑150 (MQ=255) ccTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATc > 2:1474052/1‑150 (MQ=255) cTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATcc > 1:689235/1‑150 (MQ=255) cTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCAGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATcc > 2:302883/1‑150 (MQ=255) tCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCg > 1:3584897/1‑150 (MQ=255) ccGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGa < 2:3056475/150‑1 (MQ=255) cgcTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGagta < 2:2556258/150‑1 (MQ=255) gcTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGagtag > 1:1819314/1‑150 (MQ=255) tCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGtt > 2:3308303/1‑150 (MQ=255) cGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGttt < 1:1633984/150‑1 (MQ=255) ggCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGtttt < 1:3268033/150‑1 (MQ=255) ggCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGtttt < 2:3730316/150‑1 (MQ=255) gCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTc < 2:2080973/150‑1 (MQ=255) gCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTc < 1:4506240/150‑1 (MQ=255) cACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTct < 1:3658768/150‑1 (MQ=255) cACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTct < 2:2216944/150‑1 (MQ=255) cACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCAGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTct < 2:2226351/150‑1 (MQ=255) cACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCAGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTct < 2:4499116/150‑1 (MQ=255) cACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCAGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTct < 2:2305202/150‑1 (MQ=255) tATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTctgct < 1:3868631/150‑1 (MQ=255) aTTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTctgctg > 2:402377/1‑150 (MQ=255) 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tgtgCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCAGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTAt > 2:2605545/1‑150 (MQ=255) gtgCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATc < 1:3034071/150‑1 (MQ=255) gtgCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATc > 1:1881222/1‑150 (MQ=255) tgCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCa > 2:544470/1‑150 (MQ=255) gCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCAc > 2:2322158/1‑150 (MQ=255) 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cTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTa > 1:2488112/1‑150 (MQ=255) ttttGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTAt < 1:4418913/150‑1 (MQ=255) ttttGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTAt < 2:1189868/150‑1 (MQ=255) ttttGTCGTACTGGTATTTGCAGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTAt < 1:914594/150‑1 (MQ=255) tttGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATg < 1:747898/150‑1 (MQ=255) tGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCt < 2:2738920/150‑1 (MQ=255) gTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTg < 2:3410288/150‑1 (MQ=255) cGTACTGGTATTTGCAGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGAt < 2:853146/150‑1 (MQ=255) gTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCGGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCGGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCGGATg > 1:2847953/1‑150 (MQ=255) tGGTATTTGCAGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCGGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATGCGCa > 2:2724009/1‑150 (MQ=255) tATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATGCGCatga < 1:1186903/150‑1 (MQ=255) gCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATGCGCATGATGGGt < 1:1628598/150‑1 (MQ=255) | GACCGCCTGATAAGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATGCGCATGATGGGTAT > CP009273/2742310‑2742608 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |