| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,761,733 | 0 | T | A | 7.1% | 913.7 / 47.4 | 267 | V222E (GTA→GAA) | yfjP | CP4‑57 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (105/143); new base A (9/10); total (114/153) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.47e-01 | |||||||||||
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
ACAAAATATCAGCCGCAAAATCTGCCTGCTGCATGAGCTATTCCAGCCCGTGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGAAACCGTAGGTGCCATACTCGATACGGTAAGCACCTTTCCCCTTATTCCCGCCCCGGTGCGGACCATTATTCAGGCCGTGC > CP009273/2761584‑2761882 | aCAAAATATCAGCCGCAAAATCTGCCTGCTGCATGAGCTATTCCAGCCCGTGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGgt > 2:3152663/1‑150 (MQ=255)aCAAAATATCAGCCGCAAAATCTGCCTGCTGCATGAGCTATTCCAGCCCGTGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGgt > 2:3758298/1‑150 (MQ=255) cAAAATATCAGCCGCAAAATCTGCCTGCTGCATGAGCTATTCCAGCCCGTGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGgta > 1:4490934/1‑150 (MQ=255) 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ggTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGAAACCGTAGGTGCCATACTCGATACGGTAAGCACCTTTCCCCTTATTCCCGCCCCGGTGCGGACCATTATTCAGGCCGt < 1:1041176/150‑1 (MQ=255) gtagtaGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGAAACCGTAGGTGCCATACTCGATACGGTAAGCACCTTTCCCCTTATTCCCGCCCCGGTGCGGACCATTATTCAGGCCGTg > 1:1016069/1‑150 (MQ=255) | ACAAAATATCAGCCGCAAAATCTGCCTGCTGCATGAGCTATTCCAGCCCGTGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGAAACCGTAGGTGCCATACTCGATACGGTAAGCACCTTTCCCCTTATTCCCGCCCCGGTGCGGACCATTATTCAGGCCGTGC > CP009273/2761584‑2761882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |