| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,806,531 | T→G | 16.3% | L186R (CTG→CGG) | emrB → | multidrug efflux system protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,806,531 | 0 | T | G | 16.3% | 724.1 / 153.0 | 295 | L186R (CTG→CGG) | emrB | multidrug efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (128/119); new base G (22/26); total (150/145) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
CTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGAAATTATC > CP009273/2806382‑2806679 | cTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACt > 2:2022414/1‑150 (MQ=255) tCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTg < 1:342247/150‑1 (MQ=255) cGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGc > 1:3591446/1‑150 (MQ=255) gATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCa > 2:1538989/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCaa < 1:3145984/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAActc > 2:2307677/1‑150 (MQ=255) gcTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAActct < 1:3758749/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTg < 2:822246/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTgc > 1:2891446/1‑150 (MQ=255) cGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGcgcg > 2:1516800/1‑150 (MQ=255) ggTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTATTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTg > 2:1330268/1‑150 (MQ=255) gATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAAc < 1:258255/150‑1 (MQ=255) tGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAAccc < 2:1771248/150‑1 (MQ=255) ggTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCAc > 1:914507/1‑150 (MQ=255) ggTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCAc > 2:3078180/1‑150 (MQ=255) gATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGa > 1:476490/1‑150 (MQ=255) gATTGTCGCGCAAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGTTTATATCAGCGATAATTAACACTGGGGCTGTATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGa < 1:1873800/150‑1 (MQ=255) ttGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAAc < 2:1973935/150‑1 (MQ=255) tGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAAcg < 2:3669340/150‑1 (MQ=255) tGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAAcg < 1:1946665/150‑1 (MQ=255) gcgcCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAAcggcgg < 2:2884484/150‑1 (MQ=255) cgcCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAAcggcggc > 2:2207390/1‑150 (MQ=255) tGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGAt < 2:326049/150‑1 (MQ=255) ggCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGcc > 2:4042639/1‑150 (MQ=255) ggCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGcc > 1:1313837/1‑150 (MQ=255) ggCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAAAGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGcc > 1:2479985/1‑150 (MQ=255) gCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCg < 2:2215469/150‑1 (MQ=255) gCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCg < 1:3339160/150‑1 (MQ=255) ccGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTg > 1:737320/1‑150 (MQ=255) ccGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTg < 1:2624547/150‑1 (MQ=255) ccGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTg > 2:890234/1‑150 (MQ=255) gATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTggg > 2:2600311/1‑150 (MQ=255) gATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTggg < 2:2434265/150‑1 (MQ=255) gATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTggg > 2:2485879/1‑150 (MQ=255) tCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGc > 1:3466745/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCt < 1:2935093/150‑1 (MQ=255) tCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTgg > 2:1634030/1‑150 (MQ=255) cggTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCAct > 1:82967/1‑150 (MQ=255) ttATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCActgct > 1:2338456/1‑150 (MQ=255) tataTCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCActgctg > 2:2732863/1‑150 (MQ=255) tataTCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCActgctg > 2:3453100/1‑150 (MQ=255) tataTCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCActgctg > 1:428093/1‑150 (MQ=255) tatCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGt > 1:2034656/1‑150 (MQ=255) aGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTAtt < 1:1466527/150‑1 (MQ=255) aGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTAtt < 1:2796533/150‑1 (MQ=255) aGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTAtt > 2:4469651/1‑150 (MQ=255) aGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATAGTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTAtt < 2:2518667/150‑1 (MQ=255) cGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTgg > 2:4121600/1‑150 (MQ=255) gATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGt < 2:458406/150‑1 (MQ=255) gATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGt > 1:3194062/1‑150 (MQ=255) aTAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTa < 2:1084773/150‑1 (MQ=255) aaTTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATc > 2:1203481/1‑150 (MQ=255) aaTTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGAGTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATc > 2:4351512/1‑150 (MQ=255) tACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGc > 2:4269928/1‑150 (MQ=255) aCCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCa < 2:2401680/150‑1 (MQ=255) ccACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAg > 2:1832302/1‑150 (MQ=255) ccACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAg < 2:2183689/150‑1 (MQ=255) cTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCt > 2:3953718/1‑150 (MQ=255) tGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTg > 1:710045/1‑150 (MQ=255) tGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTg < 2:624682/150‑1 (MQ=255) cTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGAt > 2:3311655/1‑150 (MQ=255) tGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGAtt > 1:3251548/1‑150 (MQ=255) tGGATAGTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGGGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGAtt < 2:2654484/150‑1 (MQ=255) ggATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTa > 2:3874361/1‑150 (MQ=255) ggATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTa < 1:222902/150‑1 (MQ=255) atatTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATg > 2:4215237/1‑150 (MQ=255) atatTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATg < 1:1042009/150‑1 (MQ=255) atTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCt < 2:1924024/150‑1 (MQ=255) atTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCt < 1:3865737/150‑1 (MQ=255) atTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGAGGACACTGCAATCTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCt < 2:1745134/150‑1 (MQ=255) catcaACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACcg > 2:932815/1‑150 (MQ=255) aaCGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGt < 1:4023173/150‑1 (MQ=255) aCGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTa < 2:3802636/150‑1 (MQ=255) gTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTaaa < 1:4319173/150‑1 (MQ=255) tGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAag < 1:1195401/150‑1 (MQ=255) cGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGc < 2:318845/150‑1 (MQ=255) aTTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTg < 1:4363210/150‑1 (MQ=255) aTTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTg < 1:1637310/150‑1 (MQ=255) tggcgtggcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGa > 1:2976071/1‑150 (MQ=255) cgtggcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTg < 2:1436695/150‑1 (MQ=255) gtggcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTgg < 1:3925077/150‑1 (MQ=255) tggcgGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGt > 1:1813956/1‑150 (MQ=255) cgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGtttt > 2:3975030/1‑150 (MQ=255) ggtgTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTtcatc < 1:1897158/150‑1 (MQ=255) gtgtTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTtcatca < 2:3547851/150‑1 (MQ=255) gtgtTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTtcatca < 2:1369152/150‑1 (MQ=255) gtgtTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATAGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTtcatca > 1:1109500/1‑150 (MQ=255) gtgtTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTtcatca < 1:3131965/150‑1 (MQ=255) tgtTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATcac < 1:2687915/150‑1 (MQ=255) tgtTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATcac < 1:424778/150‑1 (MQ=255) ttGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAg < 1:2851893/150‑1 (MQ=255) tgatgaCACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAgg < 2:1574568/150‑1 (MQ=255) gatgaCACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGa > 2:496448/1‑150 (MQ=255) atgaCACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGaa > 1:2242734/1‑150 (MQ=255) atgaCACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGaa > 1:1657870/1‑150 (MQ=255) atgaCACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGaa > 1:107814/1‑150 (MQ=255) acacTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGAAAtt > 2:806638/1‑150 (MQ=255) cTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGAAATTatc < 1:3551527/150‑1 (MQ=255) cTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGAAATTatc < 1:3646265/150‑1 (MQ=255) cTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGAAATTatc > 2:361019/1‑150 (MQ=255) | CTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGAAATTATC > CP009273/2806382‑2806679 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |