| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,011,240 | G→T | 14.3% | D608Y (GAT→TAT) | ygfK → | putative Fe‑S subunit oxidoreductase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,011,240 | 0 | G | T | 14.3% | 1060.9 / 116.4 | 328 | D608Y (GAT→TAT) | ygfK | putative Fe‑S subunit oxidoreductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (127/154); new base T (24/23); total (151/177) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
CAGGTCCGGCGGGTCTGGCAGCAGGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTGGCGGGCGACAACCAA > CP009273/3011091‑3011389 | aGGTCCGGCGGGTCTGGCAGCAGGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGa > 1:496038/1‑150 (MQ=255) gTCCGGCGGGTCTGGCAGCAGGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGACCGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGAtt < 2:3978823/150‑1 (MQ=255) gTCCGGCGGGTCTGGCAGCAGGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGAtt < 2:2887606/150‑1 (MQ=255) gTCCGGCGGGTCTGGCAGCAGGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGAtt < 1:4238816/150‑1 (MQ=255) gTCCGGCGGGTCTGGCAGCAGGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGAtt < 2:4429027/150‑1 (MQ=255) ccGGCGGGTCTGGCAGCAGGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGTCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGAtttt > 2:492526/1‑150 (MQ=255) ccGGCGGGTCTGGCAGCAGGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGAtttt < 1:1805449/150‑1 (MQ=255) gcggGTCTGGCAGCAGGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTttgtt < 2:3529721/150‑1 (MQ=255) cggGTCTGGCAGCAGGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTttgttg < 2:1592470/150‑1 (MQ=255) cagcagGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACg < 1:3641397/150‑1 (MQ=255) cagcagGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACg > 2:1554453/1‑150 (MQ=255) cagGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCg < 2:4221701/150‑1 (MQ=255) agGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGt > 1:459555/1‑150 (MQ=255) ggTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTg < 2:3740998/150‑1 (MQ=255) gTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGa > 1:3004215/1‑150 (MQ=255) tACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGaca > 1:3850979/1‑148 (MQ=255) tACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGaaa < 2:1769937/150‑1 (MQ=255) cTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAAtt < 2:738768/150‑1 (MQ=255) ttCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAAttt > 1:703459/1‑150 (MQ=255) ttCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAAttt < 2:688865/150‑1 (MQ=255) ccTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGa > 2:3234554/1‑150 (MQ=255) ttGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGt < 2:1309654/150‑1 (MQ=255) tGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTa < 1:1222197/150‑1 (MQ=255) gCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTAt < 1:4351787/150‑1 (MQ=255) ccAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATg > 2:2690154/1‑150 (MQ=255) cAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATgg > 1:2623655/1‑150 (MQ=255) cAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATgg < 1:2868396/150‑1 (MQ=255) agagCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGgc < 2:3680577/150‑1 (MQ=255) gagCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGgct > 2:2309575/1‑150 (MQ=255) agCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGgctg > 1:860456/1‑150 (MQ=255) gggCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTc > 2:2537063/1‑150 (MQ=255) cATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCAccc > 1:4097959/1‑150 (MQ=255) cGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGAtt < 1:738093/150‑1 (MQ=255) cGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGATAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGAtt < 2:4172275/150‑1 (MQ=255) ggTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGAttt > 2:2964238/1‑150 (MQ=255) ggTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGAttt > 1:595602/1‑150 (MQ=255) gTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTa < 2:1225273/150‑1 (MQ=255) aCGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAAcc < 2:3131941/150‑1 (MQ=255) cGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCa > 1:1055419/1‑150 (MQ=255) tttGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAg < 2:4502186/150‑1 (MQ=255) tttGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAg < 2:2194607/150‑1 (MQ=255) tttGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAg < 2:2602579/150‑1 (MQ=255) ttGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGc > 1:3217450/1‑150 (MQ=255) tGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCa < 1:2776737/150‑1 (MQ=255) aCGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGtt < 1:1583610/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTa < 1:3967181/150‑1 (MQ=255) gcgAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTaa < 1:2308558/150‑1 (MQ=255) gAAGCCAATGCGGGCGGTGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTaaaa > 1:2068683/1‑150 (MQ=255) gCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAAt < 2:3422242/150‑1 (MQ=255) gCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAAt < 1:3622442/150‑1 (MQ=255) cgggcggCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCt > 1:1571051/1‑150 (MQ=255) gggcggCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCAGTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCtt > 2:868162/1‑150 (MQ=255) ggcggcGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTc > 1:2267256/1‑150 (MQ=255) ggcggcGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTc > 2:1631065/1‑150 (MQ=255) gcggcgTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTcc < 1:2517655/150‑1 (MQ=255) gcggcgTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTcc < 1:1479886/150‑1 (MQ=255) ggcgTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCAc < 2:2551441/150‑1 (MQ=255) cgTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTa < 2:552680/150‑1 (MQ=255) tgAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTc < 2:2546393/150‑1 (MQ=255) tgAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTc > 1:1661436/1‑150 (MQ=255) tgAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTc > 2:1188182/1‑150 (MQ=255) gAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGGTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCt < 1:2053215/150‑1 (MQ=255) aaaaTATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGa > 2:4230709/1‑150 (MQ=255) aaaTATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGAt < 1:1824772/150‑1 (MQ=255) aaaTATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGAt > 2:1912899/1‑150 (MQ=255) aaaTATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGAt > 2:842537/1‑150 (MQ=255) aaTATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGAtt < 2:1837920/150‑1 (MQ=255) atCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGcc > 2:1214652/1‑150 (MQ=255) tCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCa > 2:3650045/1‑150 (MQ=255) aTTCCTCAGTTCCGTAGTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCAcc < 2:3615468/150‑1 (MQ=255) cTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCa > 1:2595878/1‑150 (MQ=255) cAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACt > 2:3149795/1‑150 (MQ=255) cAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACt < 1:4148084/150‑1 (MQ=255) gTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGa > 1:1352185/1‑150 (MQ=255) tCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATa > 1:3704462/1‑150 (MQ=255) tCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATa < 2:2071604/150‑1 (MQ=255) gTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATaaaa > 1:3463870/1‑150 (MQ=255) aTTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAAt < 1:316409/150‑1 (MQ=255) ttCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATa < 1:812987/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCg < 2:2290410/150‑1 (MQ=255) cTGCAGAGTTAATTCAGCTCGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCg < 2:1065938/150‑1 (MQ=255) cTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCg < 2:2938876/150‑1 (MQ=255) cTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCg < 1:2618182/150‑1 (MQ=255) cAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGgtg < 1:1138593/150‑1 (MQ=255) agagTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGgtgt < 2:1408944/150‑1 (MQ=255) agagTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGgtgt > 1:4158585/1‑150 (MQ=255) ttAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGaaa < 2:3773144/150‑1 (MQ=255) aTTCAGCACGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTg > 2:2766807/1‑150 (MQ=255) aTTCAGCACGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTg > 2:505270/1‑150 (MQ=255) aTTCAGCACGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTg > 1:1154452/1‑150 (MQ=255) ttCAGCACGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTgg > 1:1179559/1‑150 (MQ=255) ttCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTgg < 2:3849946/150‑1 (MQ=255) ttCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTgg < 2:2382514/150‑1 (MQ=255) ttCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTgg < 1:1761888/150‑1 (MQ=255) gCACGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTggcggg < 1:4491328/150‑1 (MQ=255) cACGATATCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGACACCGGCACTGATAAAAATATCGGTGTGAAACTggcgggc > 2:1268373/1‑150 (MQ=255) atatCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTGGCGGGCGACa < 2:755068/150‑1 (MQ=255) atCTATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTGGCGGGCGACAAc < 2:1361935/150‑1 (MQ=255) gATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTGGCGGGCGACAACCaa > 2:3924661/1‑150 (MQ=255) gATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTGGCGGGCGACAACCaa > 1:1649722/1‑150 (MQ=255) | CAGGTCCGGCGGGTCTGGCAGCAGGTTACTTCCTTGCCAGAGCGGGCCATCCGGTTACGCTGTTTGAACGCGAAGCCAATGCGGGCGGCGTGGTGAAAAATATCATTCCTCAGTTCCGTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAATTTGAGTATGGCTGCTCACCCGATTTAACCATTGAGCAGTTAAAAAATCAGGGCTTCCACTATGTTCTGATTGCCACCGGCACTGATAAAAATAGCGGTGTGAAACTGGCGGGCGACAACCAA > CP009273/3011091‑3011389 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |