| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,016,372 | C→A | 19.5% | F566L (TTC→TTA) | xdhD → | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,016,372 | 0 | C | A | 19.5% | 889.6 / 160.8 | 320 | F566L (TTC→TTA) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (126/131); new base A (28/35); total (154/166) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
ACCACTCACTCACCGTACCGTGTAACGGACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCGTTCCTTCCGC > CP009273/3016224‑3016521 | aCCACTCACTCACCGTACCGTGTAACGGACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCg > 1:2535434/1‑150 (MQ=255) ccACTCACTCACCGTACCGTGTAACGGACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGc > 1:984208/1‑150 (MQ=255) cactcactCACCGTACCGTGTCACGGACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCt < 2:2713685/150‑1 (MQ=255) actcacCGTACCGTGTAACGGACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCAc > 2:2184657/1‑150 (MQ=255) ctcacCGTACCGTGTAACGGACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCAcc < 1:4322968/150‑1 (MQ=255) accgtaccgtGTAACGGACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATg > 2:2338037/1‑150 (MQ=255) cgtaccgtGTAACGGACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGc < 1:227363/150‑1 (MQ=255) gtaccgtGTAACGGACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCa < 1:726950/150‑1 (MQ=255) gtgtAACGGACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGc < 2:1854611/150‑1 (MQ=255) tgtAACGGACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCg < 1:1001097/150‑1 (MQ=255) cGGACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACt < 1:899203/150‑1 (MQ=255) ggACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCGATCACCATGGCATTAGCGGAACTg > 2:435543/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCt < 2:3681838/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCt < 1:1423138/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTTTCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGa < 1:262880/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGa < 2:2224630/150‑1 (MQ=255) tCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTa < 1:2209929/150‑1 (MQ=255) tCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTa > 2:1839581/1‑150 (MQ=255) tCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAAGGGTGCTTATCCGGGTTATGGCGCACGGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCCTTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTa < 1:3501708/150‑1 (MQ=255) tGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGa > 1:769384/1‑150 (MQ=255) gCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGAt < 2:1029350/150‑1 (MQ=255) tataTCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGAcc > 2:1071343/1‑150 (MQ=255) tatCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGGACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCaa > 2:3482370/1‑150 (MQ=255) tatCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCaa < 2:1219062/150‑1 (MQ=255) ccGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTg < 2:71247/150‑1 (MQ=255) tGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGaa < 2:2827630/150‑1 (MQ=255) tGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTACCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGaa > 2:4329535/1‑150 (MQ=255) cGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAAt < 1:2636327/150‑1 (MQ=255) cGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAAt < 1:2431464/150‑1 (MQ=255) cGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAAt < 1:1525290/150‑1 (MQ=255) gATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAAtt < 2:3080984/150‑1 (MQ=255) gATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAAtt < 2:818967/150‑1 (MQ=255) tAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGTACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTAt < 2:2513884/150‑1 (MQ=255) tAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTAt > 1:1707526/1‑150 (MQ=255) aCGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCg > 1:1182399/1‑150 (MQ=255) cGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGa > 1:2904054/1‑150 (MQ=255) gTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGaa > 2:461446/1‑150 (MQ=255) gTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGaa < 1:39863/150‑1 (MQ=255) gTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGaa < 1:4176769/150‑1 (MQ=255) gTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGaa > 1:2326168/1‑150 (MQ=255) cGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACg < 2:560325/150‑1 (MQ=255) aTTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTa < 2:652678/150‑1 (MQ=255) tttCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTaa < 2:1565280/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAAc < 1:830/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAAc < 1:1083/150‑1 (MQ=255) gTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTa > 1:2061653/1‑150 (MQ=255) ccTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAg < 1:1410199/150‑1 (MQ=255) tactacAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAggg < 1:1650037/150‑1 (MQ=255) tactacAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAggg < 1:1937328/150‑1 (MQ=255) actacAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGc < 2:1468725/150‑1 (MQ=255) tacAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCaa < 2:3526372/150‑1 (MQ=255) acAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAag > 1:1094553/1‑150 (MQ=255) cAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAaga < 2:1121285/150‑1 (MQ=255) cAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCt > 2:2570874/1‑150 (MQ=255) aaCATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTg > 2:2940961/1‑150 (MQ=255) gCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATtc < 1:4478417/150‑1 (MQ=255) cccAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATtct < 1:1260463/150‑1 (MQ=255) ccAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATtctc > 2:2038486/1‑150 (MQ=255) aaaTGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCgg > 1:711034/1‑150 (MQ=255) aaTGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGt < 2:2415881/150‑1 (MQ=255) ggTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCa < 1:1112597/150‑1 (MQ=255) ggTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCa < 1:3397580/150‑1 (MQ=255) ggTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCa > 2:1552681/1‑150 (MQ=255) ggTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCa > 1:3145474/1‑150 (MQ=255) gTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCaa > 1:3612500/1‑150 (MQ=255) gTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCaa > 2:2668784/1‑150 (MQ=255) tGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAAt > 1:3726984/1‑150 (MQ=255) tGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAAt < 1:4385684/150‑1 (MQ=255) gCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATc > 2:1354535/1‑150 (MQ=255) gCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATc > 1:491989/1‑150 (MQ=255) ttATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCgg < 1:4041215/150‑1 (MQ=255) aGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAg > 2:3836434/1‑150 (MQ=255) aGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAg > 1:636146/1‑150 (MQ=255) tATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTaaa > 2:873982/1‑150 (MQ=255) tATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTaaa < 1:2998360/150‑1 (MQ=255) aTGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAg < 1:856477/150‑1 (MQ=255) aTGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAg < 1:2776370/150‑1 (MQ=255) ggCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAgcg < 2:3160389/150‑1 (MQ=255) cgcACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGcc < 2:4458204/150‑1 (MQ=255) cgcACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGcc > 2:1868354/1‑150 (MQ=255) cgcACCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGcc < 2:4051011/150‑1 (MQ=255) gcACCGAACGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCg < 1:3278907/150‑1 (MQ=255) aCCGAAAGGTAACTTAGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGAc > 2:417894/1‑150 (MQ=255) cGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCt > 1:1658989/1‑150 (MQ=255) gAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTc > 2:3931481/1‑150 (MQ=255) aaaTGTAACTTCGATATAACCTTGTCATTAGCGTAACTGGCTGAACATTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACTAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGAAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTcc < 1:219618/150‑1 (MQ=255) aaaGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTcc < 1:2117151/150‑1 (MQ=255) aaaGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGAAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTcc < 1:2891960/150‑1 (MQ=255) aaGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCACTCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCg > 1:383023/1‑150 (MQ=255) aaGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCg > 2:3733479/1‑150 (MQ=255) aaGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCg > 1:1600349/1‑150 (MQ=255) aaGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCg > 1:3762419/1‑150 (MQ=255) gttAACTTCGATATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTTAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCGtt < 1:1924269/148‑1 (MQ=255) gTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCGttc > 2:3409779/1‑150 (MQ=255) gTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCGttc > 2:3176143/1‑150 (MQ=255) tAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCGttcc > 1:3190676/1‑150 (MQ=255) aaCTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCGttcct > 2:1706949/1‑150 (MQ=255) aCTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGTAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCGttcctt < 1:958970/150‑1 (MQ=255) ttCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCGttccttcc < 2:3804208/150‑1 (MQ=255) ttCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCGttccttcc > 1:2699596/1‑150 (MQ=255) | ACCACTCACTCACCGTACCGTGTAACGGACCGGCGCTGTCGCTGCCGTTATATCCGTGCGATAACGTCGATTTCCAGGTCACCACCTACTACAGCAACATTTGCCCAAATGGTGCTTATCAGGGTTATGGCGCACCGAAAGGTAACTTCGCTATCACCATGGCATTAGCGGAACTGGCTGAACAGTTACAGATCGACCAACTGGAAATTATCGAACGTAACCGGGTACACGAAGGGCAAGAGCTGAAAATTCTCGGTGCAATCGGTGAAGGTAAAGCGCCGACCTCCGTTCCTTCCGC > CP009273/3016224‑3016521 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |