Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,045,365 | A→T | 13.6% | L104L (CTT→CTA) | ubiI ← | 2‑octaprenylphenol hydroxylase, FAD‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,045,365 | 0 | A | T | 13.6% | 927.4 / 114.5 | 295 | L104L (CTT→CTA) | ubiI | 2‑octaprenylphenol hydroxylase, FAD‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (97/158); new base T (14/26); total (111/184) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.61e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
ATGCTGCCATCTTTCAGCGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAGTAATTTTTCGCTGGCGGC > CP009273/3045216‑3045514 | aTGCTGCCATCTTTCAGCGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCa < 2:413498/150‑1 (MQ=255) aTGCTGCCATCTTTCAGCGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCa < 1:3268607/150‑1 (MQ=255) tgcCATCTTTCAGCGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGAt > 1:794682/1‑150 (MQ=255) tgcCATCTTTCAGCGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGAt > 1:2689412/1‑150 (MQ=255) tgcCATCTTTCAGCGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGAt < 2:4386005/150‑1 (MQ=255) ccATCTTTCAGCGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATgg < 2:1299601/150‑1 (MQ=255) tttCAGCGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCTAGATGGCtata < 1:199293/150‑1 (MQ=255) tttCAGCGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCtata < 1:2703483/150‑1 (MQ=255) tttCAGCGTCAGGAAGGTTTCATGTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCtata < 2:4473547/150‑1 (MQ=255) ttCAGCGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAg < 2:2465639/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGcc < 2:1227744/150‑1 (MQ=255) gCGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCa < 2:3959639/150‑1 (MQ=255) cGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATCTGCCCAAGATGGCTATAGCCCAt > 2:2297524/1‑150 (MQ=255) tCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGAGATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCTAGATGGCTATAGCCCATGc < 2:302067/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCTAGATGGCTATAGCCCATGCt > 1:1922508/1‑150 (MQ=255) cAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCt < 1:2918751/150‑1 (MQ=255) ggAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCttt < 2:1895800/150‑1 (MQ=255) gAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTg > 1:1828143/1‑150 (MQ=255) gAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTg > 1:1609284/1‑150 (MQ=255) aaGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGa > 2:2441092/1‑150 (MQ=255) aGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGAt < 2:3163051/150‑1 (MQ=255) tttCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGt > 1:2788144/1‑150 (MQ=255) tCATTTTCTCCCCCGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCa < 2:3810747/150‑1 (MQ=255) cATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCaa > 1:2888547/1‑150 (MQ=255) ttttCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAAc < 2:20995/150‑1 (MQ=255) tcCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCTAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAAt < 2:2560305/150‑1 (MQ=255) tcCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAAt < 2:1196219/150‑1 (MQ=255) ccccAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAAtg < 2:78707/150‑1 (MQ=255) ccccAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAAtg > 1:4518606/1‑150 (MQ=255) cAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGa < 1:1185614/150‑1 (MQ=255) aGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGAc > 2:2406428/1‑150 (MQ=255) ggCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAATCGAAATGTGAcc > 1:771523/1‑150 (MQ=255) cGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCaa > 1:1322061/1‑150 (MQ=255) ctgctgTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCt > 2:3846513/1‑150 (MQ=255) ctgctgTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCt < 2:4105818/150‑1 (MQ=255) ctgctgTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCt < 1:1264208/150‑1 (MQ=255) ctgctgTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGAGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCt < 2:3692937/150‑1 (MQ=255) gctgTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCTAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGt < 1:2080981/150‑1 (MQ=255) ctgTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTc < 2:1645504/150‑1 (MQ=255) tgTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCt < 2:1571893/150‑1 (MQ=255) tgTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCt < 2:553422/150‑1 (MQ=255) tAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCTAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCttt > 1:2307080/1‑150 (MQ=255) tAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCttt < 2:1923189/150‑1 (MQ=255) aaTTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTg < 1:4460815/150‑1 (MQ=255) aTTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGt < 2:3949680/150‑1 (MQ=255) ttCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTc < 1:1461005/150‑1 (MQ=255) gCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCcac < 1:298783/150‑1 (MQ=255) cTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCa < 2:1728542/150‑1 (MQ=255) aaCAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCAtc > 2:2880205/1‑149 (MQ=255) aaCAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATa < 1:2023867/150‑1 (MQ=255) gATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCTAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATa < 2:1146962/150‑1 (MQ=255) gATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCTAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATa > 2:1971532/1‑150 (MQ=255) gATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCTAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATa > 1:1727485/1‑150 (MQ=255) atatCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATaa > 1:4214799/1‑150 (MQ=255) tatCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAAc < 2:4309787/150‑1 (MQ=255) tatCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAAc < 2:3280803/150‑1 (MQ=255) tCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAg < 2:1325784/150‑1 (MQ=255) tCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAg < 2:4221843/150‑1 (MQ=255) tCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAg < 2:614417/150‑1 (MQ=255) cTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCTAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGc > 2:3000808/1‑150 (MQ=255) tGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCt > 2:1470246/1‑150 (MQ=255) acgacTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTgg > 2:421726/1‑150 (MQ=255) cgacTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGc > 2:2475519/1‑150 (MQ=255) gacTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGcc > 1:3337698/1‑150 (MQ=255) acTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGccc > 1:505789/1‑150 (MQ=255) acTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGccc < 1:1075987/150‑1 (MQ=255) tGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCTAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTa < 2:3624606/150‑1 (MQ=255) tGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTa < 2:2689396/150‑1 (MQ=255) tGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTa > 1:2054396/1‑150 (MQ=255) aTGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACg < 2:4518606/150‑1 (MQ=255) aTGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACg < 2:464157/150‑1 (MQ=255) aTGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACg > 1:2173804/1‑150 (MQ=255) gcgcTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACgag < 2:4188816/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACgag < 2:4281020/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACgag < 1:3860478/150‑1 (MQ=255) gcTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCTAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACgagag < 1:4260196/150‑1 (MQ=255) gTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAAt < 2:865669/150‑1 (MQ=255) ttCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATg > 1:2562518/1‑150 (MQ=255) ccACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTc < 1:3769731/150‑1 (MQ=255) acaGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACTAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTTTCACACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCt < 1:535660/150‑1 (MQ=255) caGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTg > 1:909323/1‑150 (MQ=255) aGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGc > 2:2825098/1‑150 (MQ=255) aGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGc > 1:811043/1‑150 (MQ=255) gcgcGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGcc < 1:1133449/150‑1 (MQ=255) cgTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGa > 2:2019149/1‑150 (MQ=255) gTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGAc < 1:3535670/150‑1 (MQ=255) gTAGTGAATCACTGAATGTTCACCGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCAGACTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCACAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGAc < 2:3489417/150‑1 (MQ=255) cTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACggg < 2:541807/150‑1 (MQ=255) aTTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAg > 1:382093/1‑150 (MQ=255) aTTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAg < 2:3105467/150‑1 (MQ=255) aTTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAg > 1:3456664/1‑150 (MQ=255) aTTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAg < 1:2646089/150‑1 (MQ=255) ttCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAGTaa < 2:2788144/150‑1 (MQ=255) tCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAGTAAt > 2:1813462/1‑150 (MQ=255) cAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAGTAAtt > 2:2653270/1‑150 (MQ=255) aCGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAGTAAtttt < 2:334865/150‑1 (MQ=255) gATATGCCCTAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAGTAATTTTTc > 2:400416/1‑150 (MQ=255) atGCCCTAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAGTAATTTTTCGCt > 2:2064327/1‑150 (MQ=255) atGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAGTAATTTTTCGCt > 1:3979515/1‑150 (MQ=255) aaGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAGTAATTTTTCGCTggcggc > 1:3294312/1‑150 (MQ=255) | ATGCTGCCATCTTTCAGCGTCAGGAAGGTTTCATTTTCTCCCCAGGCGACCTGCTGTAATTCTGCGGGGGCTAACAGAGTGATATCTGACGACTGATGCGCTTTGTTCCACAGCGCGTAGTGAATCACTGAATTTTCAACGATATGCCCAAGATGGCTATAGCCCATGCTTTGATCGTCAAACGAAATGTGACCAAAGCTGTCTTTGTCCCACACTTCCATACCGTGATAACAGCTGGCCCTACGAGAGAGAATGTCCTGCCAGACGCCAAGACGGGTGAGTAATTTTTCGCTGGCGGC > CP009273/3045216‑3045514 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |