| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,072,314 | C→A | 14.2% | E126* (GAA→TAA) | cmtB ← | putative mannitol‑specific enzyme IIA component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,072,314 | 0 | C | A | 14.2% | 824.8 / 88.7 | 260 | E126* (GAA→TAA) | cmtB | putative mannitol‑specific enzyme IIA component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (106/117); new base A (19/18); total (125/135) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
AGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATCCCGG > CP009273/3072165‑3072460 | aGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttc > 2:798490/1‑150 (MQ=255) gTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttct < 2:2867985/150‑1 (MQ=255) gTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttct > 2:2388187/1‑150 (MQ=255) tCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGtatttatt < 2:315218/150‑1 (MQ=255) cAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttcttc > 1:409712/1‑150 (MQ=255) aaaaaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttcttct < 1:1723585/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttcttct < 2:3277207/150‑1 (MQ=255) aaaaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttcttctt < 2:698081/150‑1 (MQ=255) aaaaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttcttctt < 1:991410/150‑1 (MQ=255) aaaaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGAGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttcttctt < 1:3816076/150‑1 (MQ=255) aaaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttcttcttc < 2:2172517/150‑1 (MQ=255) aaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCg < 1:483954/150‑1 (MQ=255) aaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCg < 1:3052229/150‑1 (MQ=255) aaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCg > 2:1315687/1‑150 (MQ=255) aaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCAATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCg < 2:1606624/150‑1 (MQ=255) aGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGc > 2:3807024/1‑150 (MQ=255) aGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGc > 1:1939518/1‑150 (MQ=255) cccAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAg < 1:4015705/150‑1 (MQ=255) cAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTa < 2:864528/150‑1 (MQ=255) tGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACtt < 1:2391792/150‑1 (MQ=255) tGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACtt < 1:1789492/150‑1 (MQ=255) tGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACtt < 2:1561993/150‑1 (MQ=255) ggACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTATTCGAACAGTAATTAACTTa > 2:3508841/1‑150 (MQ=255) gACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGTGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTaa < 1:4072670/150‑1 (MQ=255) gACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTaa > 2:2069702/1‑150 (MQ=255) aCCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAAc > 2:3980546/1‑150 (MQ=255) aCCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAAc > 1:4318251/1‑150 (MQ=255) ttGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCt < 1:3476371/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATa < 2:1855372/150‑1 (MQ=255) gAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAg > 2:3253591/1‑150 (MQ=255) gCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAgcg < 1:3922253/150‑1 (MQ=255) ttGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAAtg < 2:595172/150‑1 (MQ=255) cATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAatc < 2:4119180/150‑1 (MQ=255) cATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAatc < 1:862258/150‑1 (MQ=255) cATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAatc < 1:1011060/150‑1 (MQ=255) taataTTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAatcgg < 2:3019066/150‑1 (MQ=255) tattatCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAatcggcat > 2:3564225/1‑150 (MQ=255) ttatCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAatcggcatcg > 2:163983/1‑150 (MQ=255) tatCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAatcggcatcgg < 1:3349559/150‑1 (MQ=255) ccTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGgcag > 1:500062/1‑150 (MQ=255) ccTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGgcag < 1:522102/150‑1 (MQ=255) ccTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGgcag > 2:2302867/1‑150 (MQ=255) cTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGgcagc > 2:2073087/1‑150 (MQ=255) tGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGgcagca > 1:781028/1‑150 (MQ=255) gTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGcagcag > 1:1705633/1‑150 (MQ=255) agagGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCagag > 1:1079474/1‑150 (MQ=255) gaggagAGAGTAATTATCCGCGGCTGAGAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCagaga < 2:4413803/150‑1 (MQ=255) ggagAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGt < 2:4058579/150‑1 (MQ=255) agagagTAATTATCCGCGGCTGATAAGGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTcc < 2:1910301/150‑1 (MQ=255) agagTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGa < 2:3244929/150‑1 (MQ=255) gagTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGAt < 1:1402298/150‑1 (MQ=255) gagTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGAt < 1:4330390/150‑1 (MQ=255) agTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATg < 1:1668667/150‑1 (MQ=255) agTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATg < 1:2624562/150‑1 (MQ=255) aTCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaatt < 2:1726386/150‑1 (MQ=255) tCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaattt < 1:2946887/150‑1 (MQ=255) ccGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaattta > 1:2860162/1‑150 (MQ=255) gcgGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaatttaat < 1:3864342/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaatttaaa < 2:2532968/150‑2 (MQ=255) cgGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaatttaatt < 2:1088725/150‑1 (MQ=255) cgGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaatttaatt > 2:3602127/1‑150 (MQ=255) cgGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaatttaatt < 2:1385645/150‑1 (MQ=255) ggCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTg < 2:4275434/150‑1 (MQ=255) gCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTgg > 2:1191396/1‑150 (MQ=255) cTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGt > 1:3680408/1‑150 (MQ=255) gATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTc < 2:363316/150‑1 (MQ=255) aTAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCg > 2:1610253/1‑150 (MQ=255) aTAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCg > 2:3419355/1‑150 (MQ=255) aaTGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTc > 2:2155233/1‑150 (MQ=255) aTGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCa > 2:944320/1‑150 (MQ=255) tGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCAt < 2:2232071/150‑1 (MQ=255) tGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCAt < 1:645332/150‑1 (MQ=255) ccGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTcc < 1:2762101/150‑1 (MQ=255) gCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTcccc > 1:4417672/1‑150 (MQ=255) ttttCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATaa > 1:4338682/1‑150 (MQ=255) tCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAaca > 2:935105/1‑150 (MQ=255) atgatgCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCtt < 2:2032135/150‑1 (MQ=255) atgatgCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCtt > 2:4347285/1‑150 (MQ=255) atgatgCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCtt < 1:1191269/150‑1 (MQ=255) gatgCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGt < 1:3254183/150‑1 (MQ=255) atgCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGtt > 2:1595833/1‑150 (MQ=255) tgCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTc < 2:911424/150‑1 (MQ=255) tgCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTc < 1:2137556/150‑1 (MQ=255) tgCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTc < 2:623184/150‑1 (MQ=255) gCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCa < 2:375944/150‑1 (MQ=255) gCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCa < 2:105554/150‑1 (MQ=255) tGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAg > 1:3630185/1‑150 (MQ=255) tAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTaa < 2:3877066/150‑1 (MQ=255) aaGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAAt > 2:3228736/1‑150 (MQ=255) agagTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATg < 1:2189685/150‑1 (MQ=255) agagTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATg < 2:2096149/150‑1 (MQ=255) gagTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGt < 1:2012592/150‑1 (MQ=255) agTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGACAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTc > 2:2637986/1‑150 (MQ=255) gttgttCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCACTGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCa < 2:4211565/150‑1 (MQ=255) gttgttCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCa < 2:4043418/150‑1 (MQ=255) ttgttCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCaa > 2:4227251/1‑150 (MQ=255) tgttCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCaaa > 1:2648722/1‑150 (MQ=255) gttCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAg > 1:3348946/1‑150 (MQ=255) ttCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGa < 1:3310084/150‑1 (MQ=255) ttCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGa > 1:1898768/1‑150 (MQ=255) | AGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATCCCGG > CP009273/3072165‑3072460 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |