| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,072,825 | 0 | G | T | 9.4% | 750.3 / 39.9 | 208 | intergenic (‑136/+178) | cmtB/tktA | putative mannitol‑specific enzyme IIA component of PTS/transketolase 1, thiamine triphosphate‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (93/94); new base T (10/10); total (103/105) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
TCACTAAGCCGCATAAATTATCCTTATTTTATTTTTAGGGTACCGTCCGGCGGTAAAAATAAAATACTCGTGCGGTTTAATGAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCC > CP009273/3072676‑3072974 | aCTAAGCCGCATAAATTATCCTTATTTTATTTTTAGGGTACCGTCCGGCGGTAAAAATAAAATACTCGTGCGGTTTAATGAAAGCAATTGAGCAGGGACACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGtt > 2:960990/1‑150 (MQ=255) tAAGCCGCATAAATTATCCTTATTTTATTTTTAGGGTACCGTCCGGCGGTAAAAATAAAATACTCGTGCGGTTTAATGAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGACTTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTtat > 2:3381750/1‑150 (MQ=255) aGCCGCATAAATTATCCTTATTTTATTTTTAGGGTACCGTCCGGCGGTAAAAATAAAATACTCGTGCGGTTTAATGAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAg < 1:4527198/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |