| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,127,390 | G→A | 11.8% | intergenic (‑74/‑100) | yghS ← / → yghT | putative ATP‑binding protein/putative ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,127,390 | 0 | G | A | 11.8% | 785.2 / 73.9 | 253 | intergenic (‑74/‑100) | yghS/yghT | putative ATP‑binding protein/putative ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (98/125); new base A (15/15); total (113/140) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
CTGAACCATCACATCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGCGATGGTT > CP009273/3127241‑3127538 | gAACCATCACATCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAAc < 2:501183/150‑1 (MQ=255) cATCACATCCGACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATg < 2:1134197/150‑1 (MQ=255) aTCACATCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATgg < 1:897719/150‑1 (MQ=255) caTCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTaa > 2:2716791/1‑150 (MQ=255) caTCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTaa > 2:1272795/1‑150 (MQ=255) tCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATGATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAAtt < 1:3619362/150‑1 (MQ=255) tCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAAtt < 1:830128/150‑1 (MQ=255) cAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGAc < 1:1252204/150‑1 (MQ=255) aaTGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACa < 1:1614829/150‑1 (MQ=255) tGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACAtt < 1:2272145/150‑1 (MQ=255) gCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGa < 2:2855318/150‑1 (MQ=255) cAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGAc < 1:1499186/150‑1 (MQ=255) cAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGAc < 2:330176/150‑1 (MQ=255) aTAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCt > 1:2516535/1‑150 (MQ=255) aaCACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGa > 2:1038037/1‑150 (MQ=255) acacGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGaa < 1:3440834/150‑1 (MQ=255) cGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTa > 2:583809/1‑150 (MQ=255) cGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCATTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTa > 1:278159/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGc < 2:406389/150‑1 (MQ=255) cTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCt < 2:3328070/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCtt < 2:2241416/150‑1 (MQ=255) ggCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCttt < 1:1967982/150‑1 (MQ=255) cGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCa > 2:233872/1‑150 (MQ=255) gTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCAt < 1:4244841/150‑1 (MQ=255) gAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATaaa < 1:2750967/150‑1 (MQ=255) taattaTTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACa > 2:3118001/1‑150 (MQ=255) taattaTTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACa < 2:2044269/150‑1 (MQ=255) aattaTTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAATACat > 2:3905993/1‑150 (MQ=255) aattaTTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACat > 2:3219455/1‑150 (MQ=255) aattaTTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACat < 1:2477689/150‑1 (MQ=255) attattGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACata > 2:4281693/1‑150 (MQ=255) attattGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACata < 2:4337528/150‑1 (MQ=255) attattGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACata < 1:2008498/150‑1 (MQ=255) ttattGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACatat < 2:1773022/150‑1 (MQ=255) gACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAAcc < 1:4356841/150‑1 (MQ=255) gACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAAcc > 1:509321/1‑150 (MQ=255) tatTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCaaat < 1:1853843/150‑1 (MQ=255) tatTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCaaat < 2:2197414/150‑1 (MQ=255) atTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTATATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCaaata < 2:729513/150‑1 (MQ=255) atTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCaaata < 2:2989916/150‑1 (MQ=255) ttACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCaaataa < 1:2868071/150‑1 (MQ=255) gTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAatat < 1:2617578/150‑1 (MQ=255) ttGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATAtt < 2:4445985/150‑1 (MQ=255) tGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATAttt > 2:1700914/1‑150 (MQ=255) tGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATAttt > 2:1605957/1‑150 (MQ=255) tGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATAttt > 2:1604407/1‑150 (MQ=255) gATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATAtttt < 1:4137143/150‑1 (MQ=255) aCGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATg < 1:3738391/150‑1 (MQ=255) cGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATgg < 2:3643604/150‑1 (MQ=255) gAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGa > 1:4458925/1‑150 (MQ=255) gAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGa > 1:3514384/1‑150 (MQ=255) gAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGa < 2:2073313/150‑1 (MQ=255) aaaaaCCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGat > 1:457934/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGat < 1:3107420/150‑1 (MQ=255) aaaaaCCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGat > 1:3143596/1‑150 (MQ=255) aaaaCCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGata < 2:1201990/150‑1 (MQ=255) aaaaCCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGata < 2:4238111/150‑1 (MQ=255) ccGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCCGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAAACAAATAAATATTTTTAATGGATATttaa > 2:1968691/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATttaa < 2:3797954/150‑1 (MQ=255) ggCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATttaaat < 2:609818/150‑1 (MQ=255) cAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATttaaatta < 2:182615/150‑1 (MQ=255) aatGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGatat > 2:916706/1‑150 (MQ=255) gTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATAtt < 1:1946128/150‑1 (MQ=255) gTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATAtt > 2:3017469/1‑150 (MQ=255) aTTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCa < 2:707524/150‑1 (MQ=255) gAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCTTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGc < 2:3474816/150‑1 (MQ=255) aaTATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCa > 2:1592948/1‑150 (MQ=255) atatTACGTGGTCCGTGTTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAg > 2:215014/1‑150 (MQ=255) atatTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAg < 1:3533506/150‑1 (MQ=255) atatTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAg > 2:3565538/1‑150 (MQ=255) tatTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGt > 2:2586306/1‑150 (MQ=255) tatTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGt < 1:1090991/150‑1 (MQ=255) atTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTc < 1:570223/150‑1 (MQ=255) atTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTc > 2:2292598/1‑150 (MQ=255) ttACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCa < 1:2875111/150‑1 (MQ=255) aCGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAAt < 1:3687251/150‑1 (MQ=255) aCGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAAt < 2:3983896/150‑1 (MQ=255) cGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATa > 2:1333264/1‑150 (MQ=255) cGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATa > 2:3850339/1‑150 (MQ=255) ggTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAaca > 1:4285289/1‑150 (MQ=255) gTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAacac > 2:2361810/1‑150 (MQ=255) cGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTc < 1:1271370/150‑1 (MQ=255) tCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTa < 2:2878340/150‑1 (MQ=255) gAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAAtt < 2:2963471/150‑1 (MQ=255) gAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAAtt > 1:4222244/1‑150 (MQ=255) gAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAAATACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAAtt > 1:4318463/1‑150 (MQ=255) tatCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGcc < 1:390039/150‑1 (MQ=255) atCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCg < 1:2106553/150‑1 (MQ=255) ccGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTACATTAATTGCCGtt > 2:3241732/1‑150 (MQ=255) gTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTAt < 2:3513166/150‑1 (MQ=255) ttCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTAtt > 1:1194483/1‑150 (MQ=255) ttCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTAtt > 1:1731593/1‑150 (MQ=255) ttCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTAtt > 1:4011132/1‑150 (MQ=255) ttCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTAtt > 2:1447649/1‑150 (MQ=255) ttCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTAtt > 2:1894950/1‑150 (MQ=255) cAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTgg > 2:2926180/1‑150 (MQ=255) ttATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGCg > 1:4137219/1‑150 (MQ=255) aTTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGCGAt < 1:180091/150‑1 (MQ=255) gtgACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGCGATGGt > 2:2526405/1‑150 (MQ=255) tgACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGCGATGGtt > 2:3881665/1‑150 (MQ=255) | CTGAACCATCACATCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGCGATGGTT > CP009273/3127241‑3127538 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |