Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,525,258 | T→G | 5.8% | T181P (ACC→CCC) | yhgE ← | DUF4153 family putative inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,525,258 | 0 | T | G | 5.8% | 701.7 / 7.6 | 244 | T181P (ACC→CCC) | yhgE | DUF4153 family putative inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (101/122); new base G (19/2); total (120/124) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.06e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
AGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATACTGACTGGTAAAAATAGCGAT > CP009273/3525110‑3525407 | aGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGtt < 2:668176/150‑1 (MQ=255) aGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACAGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCCGCGCGGGAACCAGACCAAACGTGAGATAAATAAAACACG‑CGGtt > 1:3625886/1‑150 (MQ=255) gggTTAGAAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCTATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTg < 1:3880808/150‑1 (MQ=255) tAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTTAAAGTGACAGTGTTGGCGCCAGGGTAACCCCCCCCCCGGGAACACCAACAAAACTGAGATAAATAAAACACT‑CCGGTGGaaa > 1:2351100/1‑150 (MQ=255) aGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAACGGGACTGTGTTCGCGCGAGGATAACCGCCAGCCCGGTAACCAGACCAAACCTGAGATAAATAAAACAGT‑CGGGTGCaaaa > 1:2224761/1‑150 (MQ=255) aaTGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAag < 2:1478893/150‑1 (MQ=255) aaTGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAag < 1:1402343/150‑1 (MQ=255) aTGATACTAACGGCAGCAACCCTGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAAACAGT‑CGGTTGCAAAAAaga > 2:198591/1‑150 (MQ=255) aTGATACTAACGGCAGCAACCCTGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGAGCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCAAACGTGAGATAAAAAAAACAGT‑CGGGTGCAAAAAaga > 2:201244/1‑150 (MQ=255) tGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTACCGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGGTGCAAAAAagag < 2:556355/150‑1 (MQ=255) tGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTTAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCCCCAGCGCGGTAACCAGACCAAAAGTGAGATAAATAAAACAGT‑CGGTTGCAAAAAatag > 1:1642004/1‑150 (MQ=255) gATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGc < 1:1765162/150‑1 (MQ=255) aCTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTa < 2:155209/150‑1 (MQ=255) aCTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGGGTCAGTGTTCGCGCGAGGATCAACGCCACCGCGGTAACCACACCTAACCTGAGATTAAAAAAACACT‑CGGGTGGAAAAAAGATCGtc > 1:1611894/1‑149 (MQ=255) aCTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAACGTGGCAGTGTTCGCGCGAGGGTCACCCCCACCCCGGTAACCAGACCCAAACGGAGATAAATAAAACACT‑CGGGTTCaaaaaaaatcgga > 1:2053172/1‑143 (MQ=255) cTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGTCTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGGGAGATAAATAAACCAGT‑CGGGTGCAAAAAAGAGCGTAt > 2:2474098/1‑150 (MQ=255) cTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTAt < 2:384367/150‑1 (MQ=255) cTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGTCTGTGTTCGCGCGCGGATCACCGCCCCCGCGGTAACCCGACCTAACGGGAGATAAATAAACCAGT‑CGGGTGCAAAAAAGAGCGTAt > 2:518117/1‑150 (MQ=255) tAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGTCTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCCGCGCGGTCACCAGACCGAACCTGAGAGAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGGAtt > 1:2889574/1‑150 (MQ=255) aaCGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTg < 2:3740883/150‑1 (MQ=255) aaCGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTg < 2:3135890/150‑1 (MQ=255) ggCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCCCCCGCGCGGTAACCCGACCGAACCTGAGATAAAAAAACCAGG‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGaaa > 2:4374568/1‑150 (MQ=255) cagcaACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAACGTGACAGTGGTCGCGCGCGGATCACCGCCCGCGCGGTAACCACACCAAACGGGGGATAAATAAACCAGT‑CGGGTGGCAAAAATAGCGGAGTGaaaaa > 1:3977914/1‑150 (MQ=255) agcaACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAAc < 1:2392459/150‑1 (MQ=255) agcaACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACGGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAAc > 2:726784/1‑150 (MQ=255) agcaACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGGGTCGGTGTTCGCGCGATGATCACCCCCAGCGCGGGAAACAGACCAAACCTGAGATAAAAAAACCACTACGGTTG‑AAAAAAAAGCGTATTGaaaaaa > 2:1904214/1‑149 (MQ=255) aaCCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTg > 2:2585572/1‑150 (MQ=255) aaCCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCCGTAAACAGAACAAAAGTGAGATAAATAAAACAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGTAAAAAGTg > 2:2381154/1‑150 (MQ=255) aCCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGa < 2:871417/150‑1 (MQ=255) aCCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGa < 1:1549138/150‑1 (MQ=255) ccccGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGAt < 2:213223/150‑1 (MQ=255) ccccGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGAt < 2:1956969/150‑1 (MQ=255) ccccGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGAt < 2:3330857/150‑1 (MQ=255) ccccGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGAt < 2:2735172/150‑1 (MQ=255) ccccGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCGAACGTGAGATAAATAAAACAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGAt > 2:2630092/1‑150 (MQ=255) cccGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATAACCCCCAGCGCGGTAAACAGACCTAAAGTGAGATAAATAAAAAACT‑CGGTTTGAAAAAAAAGAGTATTTTAAAAACTGATg > 1:4429330/1‑150 (MQ=255) ccGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGc < 2:899306/150‑1 (MQ=255) gTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAAAGTGACAGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCCGCGCGGTAAACAGACCGAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGGTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAAACTGATGCca > 1:2190031/1‑150 (MQ=255) gCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATATAGTCTATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATAACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCcaaca < 1:279688/150‑1 (MQ=255) gCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCcaaca < 1:2544686/150‑1 (MQ=255) tAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGCGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGttt < 1:465691/150‑1 (MQ=255) cGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTaaa < 2:541/150‑1 (MQ=255) aacaacTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTTTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCACACCAAAACTGAGATAAAAAAAACAGT‑CGGTTTCAAAAAATAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAaaaaac > 2:3983132/1‑150 (MQ=255) caacTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCCAGGATAACCGCCACCGCGGTAACCAGACCAAACCTGAGAAAAATAAACCACT‑CGGTTGCCAAAAAGAGCGGAATGAAAAAAGTGATGCCAACAACTTTAaacaacac > 2:2479218/1‑148 (MQ=255) caacTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACAGTTTTAGCGCGAGGATAACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCAAACGTGATATAAATAAACCAGT‑AGGTTTCAAAAAATAGCGTATTTAAAAAAAGTATTCCAACAAGTTTAaaaaacac > 2:2858616/1‑148 (MQ=255) aacTTTTTAATAGAGTCGATTAAACGTGAGTGTTTTCGCGCGAGGATCACCGCCTGCGCGGTAACAAGACCTAAGGTGATATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCAAACAAGTTTAAACAactca < 1:2403892/150‑1 (MQ=255) ttttAATAGTGTCTATTAAAGGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCTGCGCGTTAACAATACCTAACGTTATAAAAATAAACCAGT‑CGTTTGAAAAAAAGTGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTcc < 1:2027391/150‑1 (MQ=255) tttGAATAGAGTCGATTAAAAGTTACAGTTTTCGCGCGAGGAAAACCGCCAGCGCGGTAAACAGAACAAAAGTGAGATAAATAAAACAGT‑CGGTTTCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAAAGTGATTCCAACAAGTTTAAAAAACTAACAcc > 2:3397052/1‑150 (MQ=255) agagTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGG‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCACAAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTaa < 2:3367445/150‑1 (MQ=255) agTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTaaaa < 2:4097086/150‑1 (MQ=255) cGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCa > 2:358805/1‑150 (MQ=255) cGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCa > 2:2717837/1‑150 (MQ=255) gtttAAACGTGTCTGTGTTCGCGCGAGTATCACCGCCAGCGCGTTAACCAGACCTAACGTTATATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTTAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCAc < 1:3585253/148‑1 (MQ=255) gATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCAc > 2:1248702/1‑150 (MQ=255) aTTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCAcc > 1:1241285/1‑150 (MQ=255) ttAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCa > 2:2198135/1‑150 (MQ=255) aaaCGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGc > 2:809353/1‑150 (MQ=255) aaCGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGGTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGcc > 1:4217088/1‑150 (MQ=255) aCGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCa < 2:2938723/150‑1 (MQ=255) cGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCAc < 2:2082783/150‑1 (MQ=255) cGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCAc < 2:4083157/150‑1 (MQ=255) tgtgTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAg > 2:134745/1‑150 (MQ=255) cgcgcgAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTg > 2:144950/1‑150 (MQ=255) gcgcgAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTgg < 1:3289965/150‑1 (MQ=255) cgcgTGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACACGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGc < 2:3029187/150‑1 (MQ=255) cgcgAGGATCACCTCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGG‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGc < 2:3260458/150‑1 (MQ=255) cgcgAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACATAACGTTATATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGc < 1:4200628/150‑1 (MQ=255) aGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCgaga > 1:3723658/1‑150 (MQ=255) gcaTCACCGCCAGCGCGTAAACCAGACCTAACGTGACATAAAAAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGaa < 1:1970523/148‑1 (MQ=255) gaacACCGCCTGCGCGGTAACCAGACATAACGTTATATAAATAAACCCGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGaaa < 1:3117033/147‑1 (MQ=255) cACCGCCAGCGCGTAAACAATACCTAACTTTATAAAAATAAACCAGT‑CGTTTGCAAAAAAGAGCTTTTTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAAt < 1:818693/150‑1 (MQ=255) aCCGCCCGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATc < 1:1975826/150‑1 (MQ=255) aCCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGAAAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATc < 1:1976317/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCAcc < 2:3099348/150‑1 (MQ=255) cAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAg > 1:4442175/1‑150 (MQ=255) cAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAg > 1:852823/1‑150 (MQ=255) cgcgGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTaa < 1:1359593/150‑1 (MQ=255) cgcgGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTaa > 1:3460630/1‑150 (MQ=255) gcgGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAat < 2:1722253/150‑1 (MQ=255) tAACCAGACCTAACGTGATATAAATAAACCAGT‑CGGTTGAAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATaa < 1:99817/150‑1 (MQ=255) tAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATaa > 2:937154/1‑150 (MQ=255) cAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTAc < 2:2590397/150‑1 (MQ=255) catAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTa < 1:2610285/148‑1 (MQ=255) catAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTa < 1:4253030/148‑1 (MQ=255) cTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTAt < 2:2889574/150‑1 (MQ=255) tAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATg < 1:720620/150‑1 (MQ=255) gagaTAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATac > 2:164747/1‑150 (MQ=255) agaTAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATact > 2:3189454/1‑150 (MQ=255) agaTAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATact < 2:646329/150‑1 (MQ=255) agaTAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATact > 2:3189545/1‑150 (MQ=255) gaTAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATactg < 1:198881/150‑1 (MQ=255) ataaataaACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATactga < 2:4281728/150‑1 (MQ=255) taaataaaCCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGTGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATactgac > 1:3769056/1‑150 (MQ=255) aataaaCCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATactgactg < 1:4462941/150‑1 (MQ=255) tacaCCCGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCACCAAGTCTAAACAACTCACTCCACACAAAAAGCACCACCCACGTCACGCCATCGGCGAGAACCATCACCAGTAATCTACGTACGTTATGCCATACTGCCTGGt < 2:1084863/147‑1 (MQ=255) aaaCCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATACTGACTGGTa < 1:2185526/150‑1 (MQ=255) aGT‑CGTTTGAAAAAAATAGCTTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAACATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATACTGACTGGTAAAAat < 1:4048338/150‑1 (MQ=255) aGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATACTGACTGGTAAAAat < 1:518117/150‑1 (MQ=255) gTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATACTGACTGGTAAAAatagcga > 2:2844066/1‑150 (MQ=255) ttGCAAAAAAGAGCTTATTGAAAAACGTGATGCCAACACGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATACTGACTGGTAAAAatagcgat < 2:45763/150‑1 (MQ=255) | AGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGT‑CGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATGCCATACTGACTGGTAAAAATAGCGAT > CP009273/3525110‑3525407 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |