| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,009,705 | G→A | 90.6% | intergenic (‑176/‑86) | ysgA ← / → udp | putative carboxymethylenebutenolidase/uridine phosphorylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,009,705 | 0 | G | A | 90.6% | 833.0 / 60.1 | 265 | intergenic (‑176/‑86) | ysgA/udp | putative carboxymethylenebutenolidase/uridine phosphorylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (12/13); new base A (111/129); total (123/142) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
TGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTGATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTAAAAACGATTTACAAGGGGCTACGCTT > CP009273/4009558‑4009853 | tGCGCAAGGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGtaat < 1:63424/150‑1 (MQ=255) gcgcAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGtgatg < 1:1372393/150‑1 (MQ=255) gcgcAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGtgatg < 1:398554/150‑1 (MQ=255) aaTGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTa < 1:2505506/150‑1 (MQ=255) aaTGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTa > 1:2400265/1‑150 (MQ=255) aTGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTAt > 1:3248009/1‑150 (MQ=255) tGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATc > 2:855928/1‑150 (MQ=255) tGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATc > 2:789151/1‑150 (MQ=255) tGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATc > 2:2650922/1‑150 (MQ=255) tGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATc < 2:2720590/150‑1 (MQ=255) gTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTGATGAGTATCa > 1:3654133/1‑150 (MQ=255) gTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCa < 1:3448932/150‑1 (MQ=255) aCTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGaa < 2:4462011/150‑1 (MQ=255) taGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGaaaaaa > 2:811800/1‑150 (MQ=255) taGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGaaaaaa > 1:43476/1‑150 (MQ=255) aGTCAGCATGCAGCAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAAt > 1:2969748/1‑150 (MQ=255) aGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAAt < 2:3788535/150‑1 (MQ=255) aGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAAt > 1:3128327/1‑150 (MQ=255) aGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTGTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAAt > 1:878773/1‑150 (MQ=255) cAGCATGCAACAAATCACAGTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGtt < 2:3872459/150‑1 (MQ=255) gCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTGATGAGTATCACGAAAAAATGTTaa < 1:3573211/150‑1 (MQ=255) gCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTaa < 2:3234593/150‑1 (MQ=255) cATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTGATGAGTATCACGAAAAAATGTTaaa > 1:3919718/1‑150 (MQ=255) attcaacaaATCACATTGCCTTAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTCTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAAc < 2:3413502/147‑1 (MQ=255) aTGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAAc < 2:3696395/150‑1 (MQ=255) aTGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAAc < 1:4123598/150‑1 (MQ=255) tGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTGATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAAcc < 1:1436348/150‑1 (MQ=255) tGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAAcc > 2:1674785/1‑150 (MQ=255) aacaaATCTCTTTGACTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTTCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTGATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCtt < 1:764670/150‑1 (MQ=255) aacaaATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTCTCACGAAAAAATGTTAAACCCta > 2:4215821/1‑149 (MQ=255) aacaaATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCtt < 2:737907/150‑1 (MQ=255) acaaATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTGATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTc < 1:2057734/150‑1 (MQ=255) caaATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCg < 1:1703175/150‑1 (MQ=255) aaaTCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCgg < 1:1117805/150‑1 (MQ=255) cacaTTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTaaa > 2:615469/1‑150 (MQ=255) acaTTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTGATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAg > 1:1659853/1‑150 (MQ=255) caTTGCCTGAATCGGCTCCTCTTGTATGCAGTCCTGCAGAATGACGGGGGATTTATGTGATTTGCATCACTGTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAgt < 2:1918383/150‑1 (MQ=255) caTTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAgt < 2:2314265/150‑1 (MQ=255) tGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTc < 2:2792513/150‑1 (MQ=255) tGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTc < 2:2792586/150‑1 (MQ=255) gCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCt < 2:1903146/150‑1 (MQ=255) cTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCttt > 1:3343027/1‑150 (MQ=255) cTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCttt > 2:427425/1‑150 (MQ=255) aaTCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTGATGAGTATCACG‑AAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGc > 2:1613965/1‑150 (MQ=255) tCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGct < 2:2078070/150‑1 (MQ=255) gCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGcttct > 2:3654377/1‑150 (MQ=255) cTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTCTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGcttctt < 1:634269/150‑1 (MQ=255) tCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCttcttc > 2:181198/1‑150 (MQ=255) aTCTTTTCTGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTGATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTg < 2:464044/150‑1 (MQ=255) tCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGTGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGa > 2:916703/1‑150 (MQ=255) tGCTGTCCTGAAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGTTGGGTAAATTTATGCATCGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAAcc < 1:248920/150‑1 (MQ=255) tGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAAcc < 1:1724274/150‑1 (MQ=255) tGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAAcc < 2:2766407/150‑1 (MQ=255) aGTCCTGCAGAATGAAGGGTTATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGAt < 2:2396158/150‑1 (MQ=255) aGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGAt < 1:615469/150‑1 (MQ=255) tCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTc < 1:1157138/150‑1 (MQ=255) tCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTc < 1:3440868/150‑1 (MQ=255) gCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACag < 2:4099277/150‑1 (MQ=255) aGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACagag < 1:1588936/150‑1 (MQ=255) aTGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTCAACCGATTCACAgaggag > 2:1758430/1‑150 (MQ=255) tGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGt > 2:3058608/1‑150 (MQ=255) aGGTTGATTTAATTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAAAGCAATTTCGTAATCGTAATGTGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGATTCTTCTGACTAAACCTATTCAAAGAGGagtagt > 1:3001079/1‑150 (MQ=255) aGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGt > 2:4263363/1‑150 (MQ=255) ggTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGtat < 1:1003912/150‑1 (MQ=255) ggTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGtat > 1:3585133/1‑150 (MQ=255) aTTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAAACGATTCACAGAGGAGTTGTATATGt > 2:2198439/1‑150 (MQ=255) tATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCa > 1:4229383/1‑150 (MQ=255) tATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCa > 1:912885/1‑150 (MQ=255) gtgATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGt < 2:2745635/150‑1 (MQ=255) tgATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTc > 1:2882365/1‑150 (MQ=255) gATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCt < 1:2004062/150‑1 (MQ=255) aTTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTg > 1:1917929/1‑150 (MQ=255) tGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATg < 1:3310284/150‑1 (MQ=255) cACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGttttt > 1:3786680/1‑150 (MQ=255) aCTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTc < 1:2667783/150‑1 (MQ=255) aCTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTc > 2:1299071/1‑150 (MQ=255) ttttGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCAt < 1:444899/150‑1 (MQ=255) ttttGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCAt < 1:2710969/150‑1 (MQ=255) ttGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTGATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCAtct < 1:3213957/150‑1 (MQ=255) ggtggGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCg < 1:3665731/150‑1 (MQ=255) ggtggGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCg > 2:406291/1‑150 (MQ=255) gtggGTAAATTTATGCAGCGCATTTGCGTCATGGGAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCgg > 1:4278162/1‑150 (MQ=255) gggTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGcc < 1:580360/150‑1 (MQ=255) gTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTc > 1:1862025/1‑150 (MQ=255) tAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCa > 2:3260041/1‑150 (MQ=255) aaaTTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCAc > 1:4069817/1‑150 (MQ=255) aaaTTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCAc < 1:2654335/150‑1 (MQ=255) aaTTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACt > 2:4348026/1‑150 (MQ=255) ttATGCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTaaa > 1:2239052/1‑150 (MQ=255) gCAACGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTAAAAACg < 1:1836114/150‑1 (MQ=255) aaCGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTAAAAACGAt < 2:255246/150‑1 (MQ=255) cGCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTAAAAACGAttt < 1:2429139/150‑1 (MQ=255) gCATTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTAAAAACGATTTa < 2:50548/150‑1 (MQ=255) aTTTGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTAAAAACGATTTACa > 1:3166016/1‑150 (MQ=255) tGCGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTAAAAACGATTTACAAgg > 2:1511242/1‑150 (MQ=255) cGTCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTAAAAACGATTTACAAgggg < 1:4517641/150‑1 (MQ=255) tCATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTAAAAACGATTTACAAGGGGCt > 1:1301004/1‑150 (MQ=255) cATGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTAAAAACGATTTACAAGGGGCTa > 1:2038837/1‑150 (MQ=255) tGGTAATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTAAAAACGATTTACAAGGGGCTACg < 2:3508469/150‑1 (MQ=255) tgatgaGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCCTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTAAAAACGATTTACAAGGGGCTACGCtt > 2:100274/1‑150 (MQ=255) | TGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGATTTATGTGATTTGCATCACTTTTGGTGGGTAAATTTATGCAACGCATTTGCGTCATGGTGATGAGTATCACGAAAAAATGTTAAACCCTTCGGTAAAGTGTCTTTTTGCTTCTTCTGACTAAACCGATTCACAGAGGAGTTGTATATGTCCAAGTCTGATGTTTTTCATCTCGGCCTCACTAAAAACGATTTACAAGGGGCTACGCTT > CP009273/4009558‑4009853 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |